{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"blastn\", bioproject = \"PRJNA888821\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[3414038, "PRJNA888821_P_NODE_83_length_1482_cov_36.599006_g61_i0", "PRJNA888821", "83", "1482", "36.599006", "542.39726892", "Bdellovibrionota bacterium", "3034175", "Bacteria", "Bacteria", "1181", "0", "", "NTclustered", "gi|2556916994|gb|CP129486.1|", "3034175", "g61", "i0", "84.306", "166.566126855601", "1217", "182", "98", "9", "11", "1224", "468414", "469624", "MAG: Bdellovibrionota bacterium isolate cMAG.10 chromosome, complete genome", "blastn", "246851", "1181", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", null, null, null, null, "Bdellovibrionota bacterium"], [4691053, "PRJNA888821_P_NODE_19704_length_310_cov_2.776371_g19622_i0", "PRJNA888821", "19704", "310", "2.776371", "8.6067501", "Bdellovibrio sp. HCB290", "3394356", "Bacteria", "Bacteria", "233", "9.64e-57", "", "NTclustered", "gi|2895991164|gb|CP178620.1|", "3394356", "g19622", "i0", "94.667", "28.9290322580645", "150", "8", "48", "0", "1", "150", "774029", "774178", "Bdellovibrio sp. HCB290 chromosome, complete genome", "blastn", "8968", "233", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB290"], [7241057, "PRJNA888821_P_NODE_38206_length_243_cov_8.870588_g38123_i0", "PRJNA888821", "38206", "243", "8.870588", "21.55552884", "Peredibacter sp. HCB2-198", "3383025", "Bacteria", "Bacteria", "261", "3.34e-65", "", "NTclustered", "gi|2867657404|gb|CP174607.1|", "3383025", "g38123", "i0", "86.122", "2.58847736625514", "245", "30", "99", "4", "1", "242", "2185968", "2185725", "Peredibacter sp. HCB2-198 chromosome, complete genome", "blastn", "629", "261", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter sp. HCB2-198"], [8895021, "PRJNA888821_P_NODE_8807_length_310_cov_12.860759_g8725_i0", "PRJNA888821", "8807", "310", "12.860759", "39.8683529", "Bacteriovorax", "146784", "Bacteria", "Bacteria", "206", "2.1e-48", "", "NTclustered", "gi|1700689994|gb|CP030035.1|", "960", "g8725", "i0", "93.525", "1.38387096774194", "139", "8", "45", "1", "5", "142", "672789", "672927", "Bacteriovorax stolpii strain AC01 chromosome, complete genome", "blastn", "429", "206", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [9791198, "PRJNA888821_P_NODE_888_length_566_cov_5.438134_g816_i0", "PRJNA888821", "888", "566", "5.438134", "30.77983844", "Bacteriovorax sp. HI3", "2984118", "Bacteria", "Bacteria", "231", "6.6799999999999995e-56", "", "NTclustered", "gi|2321225508|dbj|AP026946.1|", "2984118", "g816", "i0", "83.951", "1.7773851590106", "243", "37", "69", "2", "163", "404", "656126", "656367", "Bacteriovorax sp. HI3 DNA, complete genome", "blastn", "1006", "231", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax sp. HI3"], [10170663, "PRJNA888821_P_NODE_53368_length_196_cov_18.983740_g53285_i0", "PRJNA888821", "53368", "196", "18.98374", "37.2081304", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "189", "1.24e-43", "", "NTclustered", "gi|2800914199|gb|CP168971.1|", "959", "g53285", "i0", "95.763", "33.2397959183673", "118", "4", "60", "1", "76", "193", "3234382", "3234498", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd16 chromosome, complete genome", "blastn", "6515", "189", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [12342177, "PRJNA888821_P_NODE_43050_length_228_cov_6.845161_g42967_i0", "PRJNA888821", "43050", "228", "6.845161", "15.60696708", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "150", "7.01e-32", "", "NTclustered", "gi|578016248|gb|CP002190.1|", "765869", "g42967", "i0", "80.729", "0.842105263157895", "192", "37", "84", "0", "33", "224", "1470573", "1470382", "Bdellovibrio bacteriovorus W, complete genome", "blastn", "192", "150", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [15269622, "PRJNA888821_P_NODE_20732_length_309_cov_11.076271_g20650_i0", "PRJNA888821", "20732", "309", "11.076271", "34.22567739", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "226", "1.6099999999999998e-54", "", "NTclustered", "gi|2216477995|gb|CP093442.1|", "2835041", "g20650", "i0", "93.96", "22.6925566343042", "149", "9", "48", "0", "161", "309", "2444491", "2444343", "Bdellovibrio reynosensis strain LBG001 chromosome, complete genome", "blastn", "7012", "226", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio reynosensis"], [16165494, "PRJNA888821_P_NODE_27153_length_282_cov_10.555024_g27071_i0", "PRJNA888821", "27153", "282", "10.555024", "29.76516768", "Bacteriovorax stolpii", "960", "Bacteria", "Bacteria", "488", "1.6699999999999998e-133", "", "NTclustered", "gi|1700689994|gb|CP030035.1|", "960", "g27071", "i0", "97.872", "6.50709219858156", "282", "6", "100", "0", "1", "282", "2388531", "2388250", "Bacteriovorax stolpii strain AC01 chromosome, complete genome", "blastn", "1835", "488", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [19093537, "PRJNA888821_P_NODE_49115_length_208_cov_8.518519_g49032_i0", "PRJNA888821", "49115", "208", "8.518519", "17.71851952", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "374", "3.4199999999999996e-99", "", "NTclustered", "gi|2328635023|gb|CP106855.1|", "1732569", "g49032", "i0", "99.038", "201.495192307692", "208", "2", "100", "0", "1", "208", "2944899", "2944692", "Bdellovibrio sp. SKB1291214 chromosome, complete genome", "blastn", "41911", "374", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. SKB1291214"], [19989681, "PRJNA888821_P_NODE_44056_length_224_cov_19.218543_g43973_i0", "PRJNA888821", "44056", "224", "19.218543", "43.04953632", "Bdellovibrio sp. BIS2", "3395379", "Bacteria", "Bacteria", "392", "1.0299999999999999e-104", "", "NTclustered", "gi|2884284196|dbj|AP035879.1|", "3395379", "g43973", "i0", "98.222", "3.38839285714286", "225", "3", "100", "1", "1", "224", "1674857", "1675081", "Bdellovibrio sp. BIS2 DNA, complete genome", "blastn", "759", "392", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. BIS2"], [21644031, "PRJNA888821_P_NODE_34077_length_253_cov_5.016667_g33994_i0", "PRJNA888821", "34077", "253", "5.016667", "12.69216751", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "159", "1.31e-34", "", "NTclustered", "gi|2800924434|gb|CP168967.1|", "959", "g33994", "i0", "79.386", "2.70355731225296", "228", "45", "90", "2", "13", "239", "753172", "753398", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd4 chromosome, complete genome", "blastn", "684", "159", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [22540085, "PRJNA888821_P_NODE_9598_length_310_cov_11.632911_g9516_i0", "PRJNA888821", "9598", "310", "11.632911", "36.0620241", "Bdellovibrio sp. HCB337", "3394358", "Bacteria", "Bacteria", "424", "5.3299999999999996e-114", "", "NTclustered", "gi|2895525383|gb|CP178621.1|", "3394358", "g9516", "i0", "91.586", "87.5903225806452", "309", "18", "99", "1", "1", "309", "3447315", "3447015", "Bdellovibrio sp. HCB337 chromosome, complete genome", "blastn", "27153", "424", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB337"], [22919715, "PRJNA888821_P_NODE_6558_length_311_cov_5.831933_g6476_i0", "PRJNA888821", "6558", "311", "5.831933", "18.13731163", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "145", "4.66e-30", "", "NTclustered", "gi|2800917394|gb|CP168972.1|", "959", "g6476", "i0", "88.333", "0.87459807073955", "120", "14", "39", "0", "192", "311", "2256946", "2257065", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd19 chromosome, complete genome", "blastn", "272", "145", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [24193251, "PRJNA888821_P_NODE_2099_length_434_cov_72.598338_g2024_i0", "PRJNA888821", "2099", "434", "72.598338", "315.07678692", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "752", "0", "", "NTclustered", "gi|2313021230|gb|CP102930.1|", "959", "g2024", "i0", "97.926", "126.760368663594", "434", "9", "100", "0", "1", "434", "2388059", "2388492", "Bdellovibrio bacteriovorus strain kdesi chromosome, complete genome", "blastn", "55014", "752", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [24193257, "PRJNA888821_P_NODE_21339_length_309_cov_7.415254_g21257_i0", "PRJNA888821", "21339", "309", "7.415254", "22.91313486", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "167", "9.88e-37", "", "NTclustered", "gi|2801803968|gb|CP169237.1|", "959", "g21257", "i0", "86.667", "4.84142394822006", "150", "20", "49", "0", "1", "150", "1371013", "1370864", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd3 chromosome, complete genome", "blastn", "1496", "167", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 16, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "blastn", "p1": "PRJNA888821", "p2": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA888821&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA888821", "label": "PRJNA888821", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA888821&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA888821&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA888821&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA888821&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA888821&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA888821&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA888821&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA888821&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA888821", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 257.450600998709}