{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"blastn\", bioproject = \"PRJNA771359\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[3758510, "PRJNA771359_S_NODE_3923_length_170_cov_2.052632_g3840_i0", "PRJNA771359", "3923", "170", "2.052632", "3.4894744", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "183", "4.829999999999999e-42", "", "NTclustered", "gi|2800917394|gb|CP168972.1|", "959", "g3840", "i0", "86.207", "466.052941176471", "174", "18", "99", "3", "1", "168", "750465", "750292", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd19 chromosome, complete genome", "blastn", "79229", "183", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [5850537, "PRJNA771359_S_NODE_105_length_881_cov_10.978673_g29_i1", "PRJNA771359", "105", "881", "10.978673", "96.72210913", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "776", "0", "", "NTclustered", "gi|2800948966|gb|CP168973.1|", "959", "g29", "i1", "83.855", "192.797956867196", "830", "118", "98", "14", "1", "823", "1677275", "1678095", "Bdellovibrio bacteriovorus strain HK2 chromosome, complete genome", "blastn", "169855", "776", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [5850553, "PRJNA771359_S_NODE_1725_length_255_cov_2.183486_g1642_i0", "PRJNA771359", "1725", "255", "2.183486", "5.5678893", "Pseudobdellovibrio exovorus", "453816", "Bacteria", "Bacteria", "198", "2.81e-46", "", "NTclustered", "gi|469929247|gb|CP003537.1|", "1184267", "g1642", "i0", "81.609", "1.02352941176471", "261", "28", "100", "15", "1", "255", "878462", "878708", "Bdellovibrio exovorus JSS, complete genome", "blastn", "261", "198", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [7125772, "PRJNA771359_S_NODE_3386_length_182_cov_4.903448_g3303_i0", "PRJNA771359", "3386", "182", "4.903448", "8.92427536", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "270", "3.93e-68", "", "NTclustered", "gi|2800948966|gb|CP168973.1|", "959", "g3303", "i0", "93.407", "177.884615384615", "182", "12", "100", "0", "1", "182", "816313", "816132", "Bdellovibrio bacteriovorus strain HK2 chromosome, complete genome", "blastn", "32375", "270", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [8400293, "PRJNA771359_S_NODE_4987_length_153_cov_1.327586_g4904_i0", "PRJNA771359", "4987", "153", "1.327586", "2.03120658", "Peredibacter starrii", "28202", "Bacteria", "Bacteria", "272", "8.84e-69", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g4904", "i0", "98.693", "6.7843137254902", "153", "2", "100", "0", "1", "153", "511076", "510924", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "1038", "272", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [8859932, "PRJNA771359_S_NODE_2707_length_203_cov_20.096386_g2624_i0", "PRJNA771359", "2707", "203", "20.096386", "40.79566358", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "348", "2.0100000000000006e-91", "", "NTclustered", "gi|2524301767|gb|OR186335.1|", "28201", "g2624", "i0", "98.477", "97.4088669950739", "197", "3", "97", "0", "7", "203", "242", "438", "Bdellovibrio sp. strain YBD-1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "19774", "348", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp."], [8859947, "PRJNA771359_S_NODE_4167_length_165_cov_8.585938_g4084_i0", "PRJNA771359", "4167", "165", "8.585938", "14.1667977", "Pseudobdellovibrio", "2862745", "Bacteria", "Bacteria", "261", "2.11e-65", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g4084", "i0", "95.181", "35.3212121212121", "166", "6", "100", "2", "1", "165", "498", "334", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "5828", "261", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [13960716, "PRJNA771359_S_NODE_311_length_535_cov_9.228916_g234_i0", "PRJNA771359", "311", "535", "9.228916", "49.3747006", "Pseudobdellovibrio", "2862745", "Bacteria", "Bacteria", "732", "0", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g234", "i0", "94.351", "88.8841121495327", "478", "25", "89", "2", "1", "477", "1258", "1734", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "47553", "732", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [16049671, "PRJNA771359_S_NODE_493_length_441_cov_11.841584_g410_i0", "PRJNA771359", "493", "441", "11.841584", "52.22138544", "Bdellovibrio sp. qaytius", "1916293", "Bacteria", "Bacteria", "595", "1.5699999999999995e-165", "", "NTclustered", "gi|1552089877|gb|CP025734.1|", "1916293", "g410", "i0", "90.971", "230.138321995465", "443", "38", "100", "2", "1", "441", "666800", "666358", "Bdellovibrio sp. qaytius chromosome, complete genome", "blastn", "101491", "595", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. qaytius"], [22424326, "PRJNA771359_S_NODE_2038_length_232_cov_2.369231_g1955_i0", "PRJNA771359", "2038", "232", "2.369231", "5.49661592", "Bdellovibrio sp. HCB288", "3394355", "Bacteria", "Bacteria", "174", "4.24e-39", "", "NTclustered", "gi|2895994964|gb|CP178619.1|", "3394355", "g1955", "i0", "82.673", "243.137931034483", "202", "29", "87", "5", "24", "221", "574849", "574650", "Bdellovibrio sp. HCB288 chromosome, complete genome", "blastn", "56408", "174", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB288"], [22884457, "PRJNA771359_S_NODE_2058_length_231_cov_5.247423_g1975_i0", "PRJNA771359", "2058", "231", "5.247423", "12.12154713", "Pseudobdellovibrio", "2862745", "Bacteria", "Bacteria", "320", "5.12e-83", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g1975", "i0", "91.775", "154.978354978355", "231", "18", "99", "1", "1", "230", "325", "95", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "35800", "320", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [22884482, "PRJNA771359_S_NODE_4678_length_157_cov_4.008333_g4595_i0", "PRJNA771359", "4678", "157", "4.008333", "6.29308281", "Pseudobdellovibrio", "2862745", "Bacteria", "Bacteria", "255", "9.2e-64", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g4595", "i0", "96.154", "99.4968152866242", "156", "6", "99", "0", "2", "157", "1872", "1717", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "15621", "255", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [24158392, "PRJNA771359_S_NODE_1439_length_281_cov_6.118852_g1356_i0", "PRJNA771359", "1439", "281", "6.118852", "17.19397412", "Pseudobdellovibrio", "2862745", "Bacteria", "Bacteria", "381", "2.909999999999999e-101", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g1356", "i0", "91.135", "193.822064056939", "282", "23", "100", "2", "1", "281", "325", "45", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "54464", "381", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [24158419, "PRJNA771359_S_NODE_479_length_445_cov_11.311275_g396_i0", "PRJNA771359", "479", "445", "11.311275", "50.33517375", "Pseudobdellovibrio", "2862745", "Bacteria", "Bacteria", "656", "0", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g396", "i0", "93.258", "326.543820224719", "445", "30", "100", "0", "1", "445", "1364", "920", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "145312", "656", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [24973666, "PRJNA771359_S_NODE_3700_length_175_cov_1.239130_g3617_i0", "PRJNA771359", "3700", "175", "1.23913", "2.1684775", "Peredibacter starrii", "28202", "Bacteria", "Bacteria", "215", "1.78e-51", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g3617", "i0", "89.017", "208.662857142857", "173", "19", "99", "0", "1", "173", "512410", "512238", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "36516", "215", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [24973678, "PRJNA771359_S_NODE_420_length_467_cov_7.016279_g134_i1", "PRJNA771359", "420", "467", "7.016279", "32.76602293", "Bdellovibrio sp. HCB337", "3394358", "Bacteria", "Bacteria", "595", "1.6699999999999995e-165", "", "NTclustered", "gi|2895525383|gb|CP178621.1|", "3394358", "g134", "i1", "92.927", "98.2955032119914", "410", "28", "96", "1", "1", "409", "3447207", "3446798", "Bdellovibrio sp. HCB337 chromosome, complete genome", "blastn", "45904", "595", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB337"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 16, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "blastn", "p1": "PRJNA771359", "p2": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA771359&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA771359", "label": "PRJNA771359", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA771359&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA771359&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA771359&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA771359&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA771359&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA771359&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA771359&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA771359&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 16, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA771359", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 272.7560130006168}