{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"blastn\", bioproject = \"PRJNA716463\" and tax_phylum = \"Chordata\"", "rows": [[707111, "PRJNA716463_P_NODE_102121_length_249_cov_3.329545_g101704_i0", "PRJNA716463", "102121", "249", "3.329545", "8.29056705", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "460", "3.16e-125", "", "NTclustered", "gi|104294895|gb|AC099431.7|", "10116", "g101704", "i0", "100", "12.9919678714859", "249", "0", "100", "0", "1", "249", "25104", "25352", "Rattus norvegicus BAC CH230-126C23 (Children's Hospital Oakland Research Institute Rat (BN/SsNHsd/MCW) BAC library) complete sequence", "blastn", "3235", "460", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [707215, "PRJNA716463_P_NODE_10861_length_359_cov_1.818182_g10447_i0", "PRJNA716463", "10861", "359", "1.818182", "6.52727338", "Sus scrofa", "9823", "Chordata", "Chordata", "647", "0", "", "NTclustered", "gi|371916867|dbj|AK398941.1|", "9823", "g10447", "i0", "99.167", "9.64623955431755", "360", "2", "100", "1", "1", "359", "1905", "2264", "Sus scrofa mRNA, clone: LVRM10002H01, expressed in liver", "blastn", "3463", "647", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Suidae", "Sus", "Sus scrofa"], [707306, "PRJNA716463_P_NODE_115121_length_236_cov_4.263804_g114703_i0", "PRJNA716463", "115121", "236", "4.263804", "10.06257744", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "431", "2.33e-116", "", "NTclustered", "gi|298912478|emb|FQ214277.1|", "10116", "g114703", "i0", "99.576", "4.6271186440678", "236", "1", "100", "0", "1", "236", "589", "824", "Rattus norvegicus TL0AAA42YK17 mRNA sequence", "blastn", "1092", "431", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [707328, "PRJNA716463_P_NODE_116581_length_234_cov_3.031056_g116163_i0", "PRJNA716463", "116581", "234", "3.031056", "7.09267104", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "427", "2.9799999999999993e-115", "", "NTclustered", "gi|56693384|gb|AC153795.1|", "10090", "g116163", "i0", "99.573", "3", "234", "1", "100", "0", "1", "234", "39761", "39994", "Mus musculus BAC RP23-276L17 (Roswell Park Cancer Institute (C57BL/6J Female) Mouse BAC Library) complete sequence", "blastn", "702", "427", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [707405, "PRJNA716463_P_NODE_121881_length_224_cov_4.596026_g121463_i0", "PRJNA716463", "121881", "224", "4.596026", "10.29509824", "Peromyscus maniculatus", "10042", "Chordata", "Chordata", "60.2", "1.19e-4", "", "NTclustered", "gi|2062846887|ref|XM_006990681.3|", "230844", "g121463", "i0", "100", "0.142857142857143", "32", "0", "14", "0", "89", "120", "3692", "3661", "PREDICTED: Peromyscus maniculatus bairdii fer-1 like family member 6 (Fer1l6), mRNA", "blastn", "32", "60.2", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Cricetidae", "Peromyscus", "Peromyscus maniculatus"], [707766, "PRJNA716463_P_NODE_32981_length_300_cov_2.696035_g32564_i0", "PRJNA716463", "32981", "300", "2.696035", "8.088105", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "472", "1.81e-128", "", "NTclustered", "gi|1431167909|gb|BC027328.2|", "10090", "g32564", "i0", "94.34", "21.89", "318", "0", "100", "1", "1", "300", "286", "603", "Mus musculus bone marrow stromal cell antigen 2, mRNA (cDNA clone MGC:28276 IMAGE:4009434), complete cds", "blastn", "6567", "472", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [707794, "PRJNA716463_P_NODE_34461_length_299_cov_4.066372_g34044_i0", "PRJNA716463", "34461", "299", "4.066372", "12.15845228", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "279", "1.17e-70", "", "NTclustered", "gi|2678878424|ref|XM_039085870.2|", "10116", "g34044", "i0", "99.355", "21.5785953177258", "155", "0", "100", "1", "146", "299", "1567", "1413", "PREDICTED: Rattus norvegicus splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 3 (Spsb3), transcript variant X5, mRNA", "blastn", "6452", "279", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [708070, "PRJNA716463_P_NODE_52101_length_289_cov_2.013889_g51684_i0", "PRJNA716463", "52101", "289", "2.013889", "5.82013921", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "529", "1.01e-145", "", "NTclustered", "gi|298881442|emb|FQ217127.1|", "10116", "g51684", "i0", "99.654", "77.9446366782007", "289", "1", "100", "0", "1", "289", "506", "218", "Rattus norvegicus TL0ACA34YL21 mRNA sequence", "blastn", "22526", "529", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [708233, "PRJNA716463_P_NODE_61881_length_282_cov_2.617225_g61464_i0", "PRJNA716463", "61881", "282", "2.617225", "7.3805745", "Odocoileus virginianus", "9874", "Chordata", "Chordata", "350", "8.239999999999999e-92", "", "NTclustered", "gi|2871722593|ref|XR_011485664.1|", "9874", "g61464", "i0", "96.667", "0.74468085106383", "210", "7", "74", "0", "1", "210", "610", "401", "PREDICTED: Odocoileus virginianus uncharacterized lncRNA (LOC139033040), ncRNA", "blastn", "210", "350", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Cervidae", "Odocoileus", "Odocoileus virginianus"], [708271, "PRJNA716463_P_NODE_6481_length_432_cov_2.910864_g6070_i0", "PRJNA716463", "6481", "432", "2.910864", "12.57493248", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "503", "9.58e-138", "", "NTclustered", "gi|104294895|gb|AC099431.7|", "10116", "g6070", "i0", "100", "71.9351851851852", "272", "0", "98", "0", "1", "272", "140565", "140836", "Rattus norvegicus BAC CH230-126C23 (Children's Hospital Oakland Research Institute Rat (BN/SsNHsd/MCW) BAC library) complete sequence", "blastn", "31076", "503", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [708520, "PRJNA716463_P_NODE_81501_length_267_cov_2.670103_g81084_i0", "PRJNA716463", "81501", "267", "2.670103", "7.12917501", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "488", "1.5699999999999998e-133", "", "NTclustered", "gi|55742825|ref|NM_057213.2|", "10116", "g81084", "i0", "99.625", "51.9438202247191", "267", "1", "100", "0", "1", "267", "2100", "1834", "Rattus norvegicus ATPase H+ transporting V1 subunit B2 (Atp6v1b2), mRNA", "blastn", "13869", "488", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [708676, "PRJNA716463_P_NODE_91521_length_259_cov_1.655914_g91104_i0", "PRJNA716463", "91521", "259", "1.655914", "4.28881726", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "473", "4.25e-129", "", "NTclustered", "gi|157816946|ref|NM_001108198.1|", "10116", "g91104", "i0", "99.614", "19.7953667953668", "259", "1", "100", "0", "1", "259", "1554", "1296", "Rattus norvegicus guanylate cyclase activator 1B (Guca1b), mRNA", "blastn", "5127", "473", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [708679, "PRJNA716463_P_NODE_91681_length_259_cov_1.612903_g91264_i0", "PRJNA716463", "91681", "259", "1.612903", "4.17741877", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "479", "9.13e-131", "", "NTclustered", "gi|74141965|dbj|AK169290.1|", "10090", "g91264", "i0", "100", "95.4131274131274", "259", "0", "100", "0", "1", "259", "1008", "1266", "Mus musculus 16 days embryo kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920176G04 product:glioma tumor suppressor candidate region gene 2, full insert sequence", "blastn", "24712", "479", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [708763, "PRJNA716463_P_NODE_98421_length_252_cov_3.826816_g98004_i0", "PRJNA716463", "98421", "252", "3.826816", "9.64357632", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "466", "6.89e-127", "", "NTclustered", "gi|2678902928|ref|XM_039094446.2|", "10116", "g98004", "i0", "100", "25.2619047619048", "252", "0", "100", "0", "1", "252", "5145", "5396", "PREDICTED: Rattus norvegicus nischarin (Nisch), transcript variant X1, mRNA", "blastn", "6366", "466", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1192804, "PRJNA716463_P_NODE_2981_length_555_cov_6.560166_g2588_i0", "PRJNA716463", "2981", "555", "6.560166", "36.4089213", "Rattus", "10114", "Chordata", "Chordata", "1020", "0", "", "NTclustered", "gi|1937913044|ref|NM_013023.3|", "10116", "g2588", "i0", "99.82", "83.8990990990991", "555", "1", "100", "0", "1", "555", "920", "1474", "Rattus norvegicus S-antigen visual arrestin (Sag), mRNA", "blastn", "46564", "1026", "0.994152046783626", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1193100, "PRJNA716463_P_NODE_79521_length_269_cov_1.571429_g79104_i0", "PRJNA716463", "79521", "269", "1.571429", "4.22714401", "Bos", "9903", "Chordata", "Chordata", "108", "5.19e-19", "", "NTclustered", "gi|1068294018|gb|KX592814.1|", "9913", "g79104", "i0", "96.875", "52.8029739776952", "64", "2", "25", "0", "206", "269", "8710002", "8709939", "Bos taurus isolate Dominette_000065F genomic sequence", "blastn", "14204", "108", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos taurus"], [1983121, "PRJNA716463_P_NODE_102682_length_249_cov_1.750000_g102265_i0", "PRJNA716463", "102682", "249", "1.75", "4.3575", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "58.4", "4.84e-4", "", "NTclustered", "gi|24474481|emb|AL845292.4|", "10090", "g102265", "i0", "90.909", "0.176706827309237", "44", "2", "18", "2", "108", "151", "79715", "79756", "Mouse DNA sequence from clone RP23-386I21 on chromosome 2, complete sequence", "blastn", "44", "58.4", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [1983163, "PRJNA716463_P_NODE_105022_length_247_cov_1.770115_g104605_i0", "PRJNA716463", "105022", "247", "1.770115", "4.37218405", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "457", "4.05e-124", "", "NTclustered", "gi|38512143|gb|BC061759.1|", "10116", "g104605", "i0", "100", "50.6882591093117", "247", "0", "100", "0", "1", "247", "2493", "2247", "Rattus norvegicus prosaposin, mRNA (cDNA clone MGC:72521 IMAGE:5600088), complete cds", "blastn", "12520", "457", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1983172, "PRJNA716463_P_NODE_105682_length_246_cov_3.404624_g105264_i0", "PRJNA716463", "105682", "246", "3.404624", "8.37537504", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "455", "1.4500000000000002e-123", "", "NTclustered", "gi|2678911742|ref|XR_010059742.1|", "10116", "g105264", "i0", "100", "7.98780487804878", "246", "0", "100", "0", "1", "246", "9", "254", "PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552068 (LOC102552068), transcript variant X4, misc_RNA", "blastn", "1965", "455", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1983216, "PRJNA716463_P_NODE_109202_length_243_cov_3.123529_g108784_i0", "PRJNA716463", "109202", "243", "3.123529", "7.59017547", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "449", "6.65e-122", "", "NTclustered", "gi|298899674|emb|FQ218432.1|", "10116", "g108784", "i0", "100", "22.8148148148148", "243", "0", "100", "0", "1", "243", "1950", "2192", "Rattus norvegicus TL0ABA52YD09 mRNA sequence", "blastn", "5544", "449", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1983323, "PRJNA716463_P_NODE_11622_length_349_cov_3.380435_g11207_i0", "PRJNA716463", "11622", "349", "3.380435", "11.79771815", "Mus caroli", "10089", "Chordata", "Chordata", "436", "7.789999999999999e-118", "", "NTclustered", "gi|1195725344|ref|XM_021165399.1|", "10089", "g11207", "i0", "90.145", "14.730659025788", "345", "21", "98", "6", "2", "344", "2267", "2600", "PREDICTED: Mus caroli rhodopsin (Rho), mRNA", "blastn", "5141", "436", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus caroli"], [1983393, "PRJNA716463_P_NODE_121402_length_226_cov_2.745098_g120984_i0", "PRJNA716463", "121402", "226", "2.745098", "6.20392148", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "418", "1.7199999999999998e-112", "", "NTclustered", "gi|56540871|gb|BC087034.1|", "10116", "g120984", "i0", "100", "9.84070796460177", "226", "0", "100", "0", "1", "226", "2883", "2658", "Rattus norvegicus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:93648 IMAGE:7124310), complete cds", "blastn", "2224", "418", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1983460, "PRJNA716463_P_NODE_126602_length_197_cov_4.064516_g126184_i0", "PRJNA716463", "126602", "197", "4.064516", "8.00709652", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "364", "1.929999999999999e-96", "", "NTclustered", "gi|56789389|gb|BC087924.1|", "10090", "g126184", "i0", "100", "46.5989847715736", "197", "0", "100", "0", "1", "197", "362", "558", "Mus musculus enoyl coenzyme A hydratase 1, peroxisomal, mRNA (cDNA clone MGC:107274 IMAGE:6706361), complete cds", "blastn", "9180", "364", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [1983492, "PRJNA716463_P_NODE_13622_length_326_cov_4.083004_g13206_i0", "PRJNA716463", "13622", "326", "4.083004", "13.31059304", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "553", "6.889999999999998e-153", "", "NTclustered", "gi|2678862964|ref|XM_008760394.4|", "10116", "g13206", "i0", "97.281", "89.2944785276074", "331", "0", "100", "3", "1", "326", "4296", "3970", "PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin and Sec7 domain containing (Psd), transcript variant X1, mRNA", "blastn", "29110", "553", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1983656, "PRJNA716463_P_NODE_23742_length_310_cov_3.130802_g23325_i0", "PRJNA716463", "23742", "310", "3.130802", "9.7054862", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "278", "4.39e-70", "", "NTclustered", "gi|298901197|emb|FQ216010.1|", "10116", "g23325", "i0", "100", "16.6935483870968", "150", "0", "96", "0", "161", "310", "927", "1076", "Rattus norvegicus TL0ACA45YE24 mRNA sequence", "blastn", "5175", "278", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1984244, "PRJNA716463_P_NODE_61962_length_282_cov_2.473684_g61545_i0", "PRJNA716463", "61962", "282", "2.473684", "6.97578888", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "521", "1.6499999999999996e-143", "", "NTclustered", "gi|291190714|ref|NM_001173972.1|", "10116", "g61545", "i0", "100", "6.93617021276596", "282", "0", "100", "0", "1", "282", "5711", "5430", "Rattus norvegicus integrin subunit alpha 8 (Itga8), mRNA", "blastn", "1956", "521", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1984251, "PRJNA716463_P_NODE_62562_length_282_cov_1.459330_g62145_i0", "PRJNA716463", "62562", "282", "1.45933", "4.1153106", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "507", "4.62e-139", "", "NTclustered", "gi|2678946800|ref|XM_063288439.1|", "10116", "g62145", "i0", "99.286", "21.1843971631206", "280", "2", "99", "0", "1", "280", "2861", "3140", "PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 64 (Tmem64), transcript variant X3, mRNA", "blastn", "5974", "507", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1984328, "PRJNA716463_P_NODE_67842_length_278_cov_1.502439_g67425_i0", "PRJNA716463", "67842", "278", "1.502439", "4.17678042", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "514", "2.7199999999999996e-141", "", "NTclustered", "gi|52631144|gb|AY724531.1|", "10116", "g67425", "i0", "100", "100.028776978417", "278", "0", "100", "0", "1", "278", "2082", "2359", "Rattus norvegicus clone UI-R-FJ0-cqa-l-17-0-UI unknown mRNA", "blastn", "27808", "514", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1984538, "PRJNA716463_P_NODE_80182_length_268_cov_2.810256_g79765_i0", "PRJNA716463", "80182", "268", "2.810256", "7.53148608", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "150", "8.46e-32", "", "NTclustered", "gi|57163122|emb|BX005170.27|", "10090", "g79765", "i0", "80.808", "0.738805970149254", "198", "33", "72", "4", "65", "258", "53652", "53456", "Mouse DNA sequence from clone RP23-430A21 on chromosome X, complete sequence", "blastn", "198", "150", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [1984659, "PRJNA716463_P_NODE_87702_length_262_cov_2.423280_g87285_i0", "PRJNA716463", "87702", "262", "2.42328", "6.3489936", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "484", "1.99e-132", "", "NTclustered", "gi|298901571|emb|FQ221713.1|", "10116", "g87285", "i0", "100", "99.7671755725191", "262", "0", "100", "0", "1", "262", "1378", "1117", "Rattus norvegicus TL0ADA32YM09 mRNA sequence", "blastn", "26139", "484", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1984744, "PRJNA716463_P_NODE_92222_length_258_cov_2.913514_g91805_i0", "PRJNA716463", "92222", "258", "2.913514", "7.51686612", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "350", "7.44e-92", "", "NTclustered", "gi|56236246|gb|AC142099.3|", "10090", "g91805", "i0", "91.667", "14.6279069767442", "252", "21", "98", "0", "7", "258", "14391", "14642", "Mus musculus BAC clone RP24-350H4 from 6, complete sequence", "blastn", "3774", "350", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [1984864, "PRJNA716463_P_NODE_98902_length_252_cov_2.284916_g98485_i0", "PRJNA716463", "98902", "252", "2.284916", "5.75798832", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "466", "6.89e-127", "", "NTclustered", "gi|2678866168|ref|XM_039111529.2|", "10116", "g98485", "i0", "100", "78.4047619047619", "252", "0", "100", "0", "1", "252", "1581", "1832", "PREDICTED: Rattus norvegicus egl-9 family hypoxia-inducible factor 2 (Egln2), transcript variant X1, mRNA", "blastn", "19758", "466", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [2468374, "PRJNA716463_P_NODE_66762_length_279_cov_1.116505_g66345_i0", "PRJNA716463", "66762", "279", "1.116505", "3.11504895", "Muridae", "10066", "Chordata", "Chordata", "388", "1.7199999999999998e-103", "", "NTclustered", "gi|20068654|emb|AL662803.11|", "10090", "g66345", "i0", "92.308", "10.0716845878136", "273", "21", "98", "0", "1", "273", "143592", "143864", "Mouse DNA sequence from clone RP23-215N10 on chromosome 11, complete sequence", "blastn", "2810", "388", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [2468403, "PRJNA716463_P_NODE_71082_length_275_cov_2.881188_g70665_i0", "PRJNA716463", "71082", "275", "2.881188", "7.923267", "Rattus", "10114", "Chordata", "Chordata", "508", "1.2499999999999999e-139", "", "NTclustered", "gi|197245744|gb|BC168736.1|", "10116", "g70665", "i0", "100", "29.1018181818182", "275", "0", "100", "0", "1", "275", "1375", "1649", "Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:188830 IMAGE:6891332), complete cds", "blastn", "8003", "508", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3258407, "PRJNA716463_P_NODE_100303_length_251_cov_1.679775_g99886_i0", "PRJNA716463", "100303", "251", "1.679775", "4.21623525", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "464", "2.47e-126", "", "NTclustered", "gi|1958784522|ref|XM_039112870.1|", "10116", "g99886", "i0", "100", "19.9123505976096", "251", "0", "100", "0", "1", "251", "1790", "1540", "PREDICTED: Rattus norvegicus legumain (Lgmn), transcript variant X1, mRNA", "blastn", "4998", "464", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3258646, "PRJNA716463_P_NODE_115163_length_236_cov_3.944785_g114745_i0", "PRJNA716463", "115163", "236", "3.944785", "9.3096926", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "436", "4.999999999999999e-118", "", "NTclustered", "gi|1937902134|ref|NM_001008326.2|", "10116", "g114745", "i0", "100", "45.6864406779661", "236", "0", "100", "0", "1", "236", "1177", "942", "Rattus norvegicus RNA exonuclease 2 (Rexo2), mRNA; nuclear gene for mitochondrial product", "blastn", "10782", "436", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3258705, "PRJNA716463_P_NODE_119623_length_229_cov_2.794872_g119205_i0", "PRJNA716463", "119623", "229", "2.794872", "6.40025688", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "424", "3.76e-114", "", "NTclustered", "gi|2678966577|ref|XM_063266064.1|", "10116", "g119205", "i0", "100", "12.8384279475983", "229", "0", "100", "0", "1", "229", "4008", "3780", "PREDICTED: Rattus norvegicus collagen type V alpha 3 chain (Col5a3), transcript variant X3, mRNA", "blastn", "2940", "424", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3258719, "PRJNA716463_P_NODE_12063_length_343_cov_7.762963_g11648_i0", "PRJNA716463", "12063", "343", "7.762963", "26.62696309", "Fukomys damarensis", "885580", "Chordata", "Chordata", "52.8", "0.032", "", "NTclustered", "gi|1834361251|ref|XM_010619451.3|", "885580", "g11648", "i0", "100", "0.73469387755102", "28", "0", "8", "0", "114", "141", "11645", "11618", "PREDICTED: Fukomys damarensis WD repeat and FYVE domain containing 3 (Wdfy3), transcript variant X4, mRNA", "blastn", "252", "52.8", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Bathyergidae", "Fukomys", "Fukomys damarensis"], [3258747, "PRJNA716463_P_NODE_122423_length_221_cov_4.290541_g122005_i0", "PRJNA716463", "122423", "221", "4.290541", "9.48209561", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "409", "1.0100000000000001e-109", "", "NTclustered", "gi|2678967700|ref|XM_056984524.2|", "10116", "g122005", "i0", "100", "28.4027149321267", "221", "0", "100", "0", "1", "221", "10728", "10948", "PREDICTED: Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 13 homolog C (Vps13c), transcript variant X4, mRNA", "blastn", "6277", "409", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3258953, "PRJNA716463_P_NODE_21963_length_310_cov_3.379747_g21546_i0", "PRJNA716463", "21963", "310", "3.379747", "10.4772157", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "438", "1.9e-118", "", "NTclustered", "gi|2678903521|ref|XM_063275506.1|", "10116", "g21546", "i0", "90.634", "65.5451612903226", "331", "10", "100", "2", "1", "310", "3523", "3193", "PREDICTED: Rattus norvegicus SURP and G patch domain containing 2 (Sugp2), transcript variant X6, mRNA", "blastn", "20319", "438", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3259173, "PRJNA716463_P_NODE_37263_length_299_cov_3.013274_g36846_i0", "PRJNA716463", "37263", "299", "3.013274", "9.00968926", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "285", "2.52e-72", "", "NTclustered", "gi|2678881548|ref|XR_358018.5|", "10116", "g36846", "i0", "100", "72.4147157190636", "154", "0", "100", "0", "1", "154", "100", "253", "PREDICTED: Rattus norvegicus matrix remodeling associated 7 (Mxra7), transcript variant X3, misc_RNA", "blastn", "21652", "285", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3259438, "PRJNA716463_P_NODE_54163_length_288_cov_1.181395_g53746_i0", "PRJNA716463", "54163", "288", "1.181395", "3.4024176", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "527", "3.63e-145", "", "NTclustered", "gi|298898969|emb|FQ212220.1|", "10116", "g53746", "i0", "99.653", "2", "288", "1", "100", "0", "1", "288", "5541", "5828", "Rattus norvegicus TL0AAA65YC10 mRNA sequence", "blastn", "576", "527", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3259465, "PRJNA716463_P_NODE_56023_length_286_cov_3.023474_g55606_i0", "PRJNA716463", "56023", "286", "3.023474", "8.64713564", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "523", "4.659999999999998e-144", "", "NTclustered", "gi|30911037|emb|AL929079.14|", "10090", "g55606", "i0", "99.65", "3", "286", "1", "100", "0", "1", "286", "36126", "35841", "Mouse DNA sequence from clone RP23-387F9 on chromosome 2, complete sequence", "blastn", "858", "523", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [3259496, "PRJNA716463_P_NODE_58783_length_284_cov_3.170616_g58366_i0", "PRJNA716463", "58783", "284", "3.170616", "9.00454944", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "525", "1.2899999999999994e-144", "", "NTclustered", "gi|298881588|emb|FQ220004.1|", "10116", "g58366", "i0", "100", "76.2077464788732", "284", "0", "100", "0", "1", "284", "792", "509", "Rattus norvegicus TL0ADA44YI16 mRNA sequence", "blastn", "21643", "525", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3259604, "PRJNA716463_P_NODE_64423_length_280_cov_3.086957_g64006_i0", "PRJNA716463", "64423", "280", "3.086957", "8.6434796", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "518", "2.12e-142", "", "NTclustered", "gi|71051375|gb|BC099176.1|", "10116", "g64006", "i0", "100", "34.1714285714286", "280", "0", "100", "0", "1", "280", "853", "1132", "Rattus norvegicus family with sequence similarity 40, member A, mRNA (cDNA clone IMAGE:7382712), partial cds", "blastn", "9568", "518", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3259641, "PRJNA716463_P_NODE_66483_length_279_cov_1.495146_g66066_i0", "PRJNA716463", "66483", "279", "1.495146", "4.17145734", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "516", "7.58e-142", "", "NTclustered", "gi|1907206284|ref|XM_006527706.5|", "10090", "g66066", "i0", "100", "50.2114695340502", "279", "0", "100", "0", "1", "279", "523", "801", "PREDICTED: Mus musculus EF-hand domain (C-terminal) containing 2 (Efhc2), transcript variant X1, mRNA", "blastn", "14009", "516", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [3259747, "PRJNA716463_P_NODE_72963_length_274_cov_1.965174_g72546_i0", "PRJNA716463", "72963", "274", "1.965174", "5.38457676", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "499", "7.48e-137", "", "NTclustered", "gi|2678880430|ref|XM_063269519.1|", "10116", "g72546", "i0", "99.635", "7.91970802919708", "274", "0", "100", "1", "1", "274", "5574", "5846", "PREDICTED: Rattus norvegicus RNA polymerase II subunit A (Polr2a), transcript variant X2, mRNA", "blastn", "2170", "499", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3259806, "PRJNA716463_P_NODE_76743_length_271_cov_2.116162_g76326_i0", "PRJNA716463", "76743", "271", "2.116162", "5.73479902", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "204", "6.479999999999998e-48", "", "NTclustered", "gi|354790363|gb|JN954864.1|", "10090", "g76326", "i0", "82.239", "4.77859778597786", "259", "25", "93", "6", "1", "252", "29992", "30236", "Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged mutant allele Whrn:tm3a(EUCOMM)Wtsi; transgenic", "blastn", "1295", "204", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [3259870, "PRJNA716463_P_NODE_80223_length_268_cov_2.697436_g79806_i0", "PRJNA716463", "80223", "268", "2.697436", "7.22912848", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "490", "4.39e-134", "", "NTclustered", "gi|726965664|gb|KM577635.1|", "10116", "g79806", "i0", "99.627", "99.9850746268657", "268", "1", "100", "0", "1", "268", "9113", "9380", "Rattus norvegicus isolate 67 mitochondrion, complete genome", "blastn", "26796", "490", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3259903, "PRJNA716463_P_NODE_82363_length_266_cov_4.082902_g81946_i0", "PRJNA716463", "82363", "266", "4.082902", "10.86051932", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "486", "5.629999999999999e-133", "", "NTclustered", "gi|2678970650|ref|XM_063267104.1|", "10116", "g81946", "i0", "99.624", "30", "266", "1", "100", "0", "1", "266", "2364", "2099", "PREDICTED: Rattus norvegicus tight junction associated protein 1 (Tjap1), transcript variant X16, mRNA", "blastn", "7980", "486", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3744388, "PRJNA716463_P_NODE_11763_length_347_cov_4.255474_g11348_i0", "PRJNA716463", "11763", "347", "4.255474", "14.76649478", "Rattus", "10114", "Chordata", "Chordata", "627", "4.2899999999999987e-175", "", "NTclustered", "gi|1937907478|ref|NM_013021.2|", "10116", "g11348", "i0", "99.422", "18.0662824207493", "346", "0", "99", "1", "2", "347", "1559", "1216", "Rattus norvegicus peripherin 2 (Prph2), mRNA", "blastn", "6269", "628", "0.998407643312102", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [3744406, "PRJNA716463_P_NODE_12123_length_343_cov_3.029630_g11708_i0", "PRJNA716463", "12123", "343", "3.02963", "10.3916309", "Mus", "10088", "Chordata", "Chordata", "634", "2.5299999999999996e-177", "", "NTclustered", "gi|846387676|dbj|LC061971.1|", "10090", "g11708", "i0", "100", "100", "343", "0", "100", "0", "1", "343", "1626", "1284", "Mus musculus mitochondrion DNA, including COX1, tRNA-Ser, tRNA-Asp, COX2, tRNA-Lys, ATP8, ATP6 genes, complete sequence, sequence_id: (5951..8605)_20", "blastn", "34300", "634", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [4535445, "PRJNA716463_P_NODE_101064_length_250_cov_2.824859_g100647_i0", "PRJNA716463", "101064", "250", "2.824859", "7.0621475", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "156", "1.68e-33", "", "NTclustered", "gi|21998271|emb|AL805973.6|", "10090", "g100647", "i0", "88.148", "151.672", "135", "10", "52", "4", "120", "248", "109603", "109737", "Mouse DNA sequence from clone RP23-69G24 on chromosome 4, complete sequence", "blastn", "37918", "156", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [4535473, "PRJNA716463_P_NODE_10324_length_366_cov_2.621160_g9910_i0", "PRJNA716463", "10324", "366", "2.62116", "9.5934456", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "676", "0", "", "NTclustered", "gi|298908397|emb|FQ228750.1|", "10116", "g9910", "i0", "100", "48.0437158469945", "366", "0", "100", "0", "1", "366", "1556", "1191", "Rattus norvegicus TL0ADA52YC18 mRNA sequence", "blastn", "17584", "676", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [4535547, "PRJNA716463_P_NODE_10884_length_358_cov_4.529825_g10470_i0", "PRJNA716463", "10884", "358", "4.529825", "16.2167735", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "514", "3.5999999999999996e-141", "", "NTclustered", "gi|298882364|emb|FQ222948.1|", "10116", "g10470", "i0", "91.223", "102.974860335196", "376", "15", "100", "1", "1", "358", "703", "328", "Rattus norvegicus TL0ADA17YF02 mRNA sequence", "blastn", "36865", "514", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [4535588, "PRJNA716463_P_NODE_111564_length_241_cov_2.857143_g111146_i0", "PRJNA716463", "111564", "241", "2.857143", "6.88571463", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "435", "1.84e-117", "", "NTclustered", "gi|39540561|gb|AC102566.9|", "10090", "g111146", "i0", "99.17", "4", "241", "2", "100", "0", "1", "241", "158241", "158481", "Mus musculus chromosome 9, clone RP23-223D10, complete sequence", "blastn", "964", "435", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [4535625, "PRJNA716463_P_NODE_113764_length_238_cov_5.042424_g113346_i0", "PRJNA716463", "113764", "238", "5.042424", "12.00096912", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "440", "3.899999999999999e-119", "", "NTclustered", "gi|145279185|ref|NM_057100.2|", "10116", "g113346", "i0", "100", "13.0546218487395", "238", "0", "100", "0", "1", "238", "2236", "2473", "Rattus norvegicus growth arrest specific 6 (Gas6), mRNA", "blastn", "3107", "440", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [4535737, "PRJNA716463_P_NODE_120864_length_227_cov_2.681818_g120446_i0", "PRJNA716463", "120864", "227", "2.681818", "6.08772686", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "414", "2.2399999999999998e-111", "", "NTclustered", "gi|38304319|gb|AC107755.12|", "10090", "g120446", "i0", "99.561", "1.00440528634361", "228", "0", "100", "1", "1", "227", "120519", "120746", "Mus musculus chromosome 9, clone RP23-225C11, complete sequence", "blastn", "228", "414", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [4536074, "PRJNA716463_P_NODE_27904_length_310_cov_2.738397_g27487_i0", "PRJNA716463", "27904", "310", "2.738397", "8.4890307", "Bos taurus", "9913", "Chordata", "Chordata", "466", "8.73e-127", "", "NTclustered", "gi|402745660|ref|NM_001046513.2|", "9913", "g27487", "i0", "92.308", "104.161290322581", "325", "10", "100", "1", "1", "310", "67", "391", "Bos taurus chemokine (C-X-C motif) ligand 3 (CXCL3), mRNA", "blastn", "32290", "466", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos taurus"], [4536756, "PRJNA716463_P_NODE_70064_length_276_cov_2.226601_g69647_i0", "PRJNA716463", "70064", "276", "2.226601", "6.14541876", "Bos taurus", "9913", "Chordata", "Chordata", "505", "1.62e-138", "", "NTclustered", "gi|1717507386|ref|NM_001029846.2|", "9913", "g69647", "i0", "99.638", "61.9166666666667", "276", "1", "100", "0", "1", "276", "4371", "4646", "Bos taurus 2',5'-oligoadenylate synthetase 1, 40/46kDa (OAS1Z), mRNA", "blastn", "17089", "505", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos taurus"], [4536827, "PRJNA716463_P_NODE_74544_length_273_cov_1.445000_g74127_i0", "PRJNA716463", "74544", "273", "1.445", "3.94485", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "499", "7.45e-137", "", "NTclustered", "gi|2678947058|ref|XM_039110881.2|", "10116", "g74127", "i0", "99.634", "7.76923076923077", "273", "1", "100", "0", "1", "273", "1947", "2219", "PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase 4A2 (Ptp4a2), transcript variant X4, mRNA", "blastn", "2121", "499", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [4537100, "PRJNA716463_P_NODE_89304_length_261_cov_1.585106_g88887_i0", "PRJNA716463", "89304", "261", "1.585106", "4.13712666", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "483", "7.12e-132", "", "NTclustered", "gi|33354291|gb|AC112406.5|", "10116", "g88887", "i0", "100", "1", "261", "0", "100", "0", "1", "261", "140159", "139899", "Rattus norvegicus 11 BAC CH230-329D3 (Children's Hospital Oakland Research Institute) complete sequence", "blastn", "261", "483", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [4537204, "PRJNA716463_P_NODE_96944_length_254_cov_1.701657_g96527_i0", "PRJNA716463", "96944", "254", "1.701657", "4.32220878", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "470", "5.37e-128", "", "NTclustered", "gi|209447118|ref|NM_001135840.1|", "10116", "g96527", "i0", "100", "69.9566929133858", "254", "0", "100", "0", "1", "254", "838", "1091", "Rattus norvegicus GTP binding protein 6 (putative) (Gtpbp6), mRNA", "blastn", "17769", "470", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [5020988, "PRJNA716463_P_NODE_11824_length_346_cov_8.956044_g11409_i0", "PRJNA716463", "11824", "346", "8.956044", "30.98791224", "Rattus", "10114", "Chordata", "Chordata", "634", "2.5599999999999996e-177", "", "NTclustered", "gi|187960166|gb|BC166770.1|", "10116", "g11409", "i0", "99.711", "99.1849710982659", "346", "1", "100", "0", "1", "346", "1917", "1572", "Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7934005", "blastn", "34318", "634", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [5021184, "PRJNA716463_P_NODE_38044_length_299_cov_2.836283_g37627_i0", "PRJNA716463", "38044", "299", "2.836283", "8.48048617", "Bos", "9903", "Chordata", "Chordata", "477", "3.8699999999999984e-130", "", "NTclustered", "gi|2633723705|ref|XM_061438284.1|", "9906", "g37627", "i0", "94.904", "104.19397993311", "314", "1", "100", "1", "1", "299", "98", "411", "PREDICTED: Bos javanicus ribosomal protein L8 (RPL8), transcript variant X1, mRNA", "blastn", "31154", "477", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos javanicus"], [5810805, "PRJNA716463_P_NODE_106485_length_246_cov_0.890173_g106067_i0", "PRJNA716463", "106485", "246", "0.890173", "2.18982558", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "213", "9.63e-51", "", "NTclustered", "gi|20177349|emb|AL691478.5|", "10090", "g106067", "i0", "100", "1.86991869918699", "115", "0", "47", "0", "64", "178", "70580", "70466", "Mouse DNA sequence from clone RP23-137F6 on chromosome 3, complete sequence", "blastn", "460", "213", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [5810867, "PRJNA716463_P_NODE_110565_length_242_cov_2.514793_g110147_i0", "PRJNA716463", "110565", "242", "2.514793", "6.08579906", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "438", "1.4299999999999999e-118", "", "NTclustered", "gi|157820454|ref|NM_001109384.1|", "10116", "g110147", "i0", "100", "70.9297520661157", "237", "0", "98", "0", "6", "242", "737", "501", "Rattus norvegicus alkB homolog 7 (Alkbh7), mRNA; nuclear gene for mitochondrial product", "blastn", "17165", "438", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [5811010, "PRJNA716463_P_NODE_119505_length_229_cov_3.275641_g119087_i0", "PRJNA716463", "119505", "229", "3.275641", "7.50121789", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "424", "3.76e-114", "", "NTclustered", "gi|2195004362|ref|NM_001401615.1|", "10116", "g119087", "i0", "100", "20.1397379912664", "229", "0", "100", "0", "1", "229", "3512", "3740", "Rattus norvegicus RUN and FYVE domain containing 3 (Rufy3), transcript variant 3, mRNA", "blastn", "4612", "424", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [5811100, "PRJNA716463_P_NODE_126765_length_196_cov_4.113821_g126347_i0", "PRJNA716463", "126765", "196", "4.113821", "8.06308916", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "363", "6.899999999999998e-96", "", "NTclustered", "gi|2678964409|ref|XM_039081341.2|", "10116", "g126347", "i0", "100", "99.0969387755102", "196", "0", "100", "0", "1", "196", "1461", "1656", "PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 57 (Cep57), transcript variant X6, mRNA", "blastn", "19423", "363", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [5811105, "PRJNA716463_P_NODE_12925_length_334_cov_3.980843_g12510_i0", "PRJNA716463", "12925", "334", "3.980843", "13.29601562", "Manacus candei", "415023", "Chordata", "Chordata", "54.7", "0.009", "", "NTclustered", "gi|2325443574|ref|XM_051811551.1|", "415023", "g12510", "i0", "96.97", "0.0988023952095808", "33", "0", "10", "1", "12", "44", "2812", "2843", "PREDICTED: Manacus candei choline dehydrogenase (CHDH), mRNA", "blastn", "33", "54.7", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Aves", "Passeriformes", "Pipridae", "Manacus", "Manacus candei"], [5811188, "PRJNA716463_P_NODE_18025_length_310_cov_4.434599_g17608_i0", "PRJNA716463", "18025", "310", "4.434599", "13.7472569", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "278", "4.39e-70", "", "NTclustered", "gi|2678863939|ref|XR_005500363.2|", "10116", "g17608", "i0", "100", "21.6516129032258", "150", "0", "97", "0", "161", "310", "1209", "1060", "PREDICTED: Rattus norvegicus calpain, small subunit 1 (Capns1), transcript variant X1, misc_RNA", "blastn", "6712", "278", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [5811401, "PRJNA716463_P_NODE_32405_length_301_cov_4.381579_g31988_i0", "PRJNA716463", "32405", "301", "4.381579", "13.18855279", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "455", "1.83e-123", "", "NTclustered", "gi|56775|emb|X04084.1|", "10116", "g31988", "i0", "93.438", "2.51162790697674", "320", "0", "100", "3", "1", "301", "3139", "2822", "Rat ribosomal DNA nontranscribed spacer (partial)", "blastn", "756", "455", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [5811524, "PRJNA716463_P_NODE_4105_length_497_cov_5.507075_g3705_i0", "PRJNA716463", "4105", "497", "5.507075", "27.37016275", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "588", "2.99e-163", "", "NTclustered", "gi|1204322234|gb|M55171.2|MUSOPS", "10090", "g3705", "i0", "91.076", "12.374245472837", "437", "36", "87", "2", "61", "494", "8975", "9411", "Mouse opsin (MOPS) gene, complete cds", "blastn", "6150", "588", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [5811758, "PRJNA716463_P_NODE_56065_length_286_cov_2.906103_g55648_i0", "PRJNA716463", "56065", "286", "2.906103", "8.31145458", "Cairina moschata", "8855", "Chordata", "Chordata", "481", "2.84e-131", "", "NTclustered", "gi|2921976312|gb|CP130421.1|", "8855", "g55648", "i0", "96.875", "1.00699300699301", "288", "7", "100", "1", "1", "286", "6803133", "6802846", "Cairina moschata breed yongchun chromosome 6", "blastn", "288", "481", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Aves", "Anseriformes", "Anatidae", "Cairina", "Cairina moschata"], [5811988, "PRJNA716463_P_NODE_69745_length_276_cov_3.034483_g69328_i0", "PRJNA716463", "69745", "276", "3.034483", "8.37517308", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "505", "1.62e-138", "", "NTclustered", "gi|54606951|gb|AC121299.16|", "10090", "g69328", "i0", "99.638", "2.8804347826087", "276", "1", "100", "0", "1", "276", "152034", "152309", "Mus musculus chromosome 17, clone RP23-402P8, complete sequence", "blastn", "795", "505", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [5812170, "PRJNA716463_P_NODE_81905_length_267_cov_1.871134_g81488_i0", "PRJNA716463", "81905", "267", "1.871134", "4.99592778", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "488", "1.5699999999999998e-133", "", "NTclustered", "gi|40317606|gb|AY212508.1|", "10116", "g81488", "i0", "99.625", "61.3707865168539", "267", "1", "100", "0", "1", "267", "880", "1146", "Rattus norvegicus rod outer segment membrane protein 1 (Rom1), complete cds", "blastn", "16386", "488", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [5812199, "PRJNA716463_P_NODE_83785_length_265_cov_3.432292_g83368_i0", "PRJNA716463", "83785", "265", "3.432292", "9.0955738", "Bos taurus", "9913", "Chordata", "Chordata", "484", "2.0199999999999998e-132", "", "NTclustered", "gi|2587618257|ref|XR_009493754.1|", "9913", "g83368", "i0", "99.623", "13.0603773584906", "265", "1", "100", "0", "1", "265", "3588", "3324", "PREDICTED: Bos taurus uncharacterized lncRNA (LOC132344790), transcript variant X2, ncRNA", "blastn", "3461", "484", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos taurus"], [5812233, "PRJNA716463_P_NODE_8585_length_392_cov_4.673981_g8172_i0", "PRJNA716463", "8585", "392", "4.673981", "18.32200552", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "723", "0", "", "NTclustered", "gi|39645152|gb|BC063811.1|", "10116", "g8172", "i0", "100", "98.4948979591837", "391", "0", "99", "0", "2", "392", "1377", "987", "Rattus norvegicus ribosomal protein L4, mRNA (cDNA clone MGC:72833 IMAGE:6919340), complete cds", "blastn", "38610", "723", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [5812392, "PRJNA716463_P_NODE_95205_length_255_cov_4.115385_g94788_i0", "PRJNA716463", "95205", "255", "4.115385", "10.49423175", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "472", "1.5e-128", "", "NTclustered", "gi|298899300|emb|FQ215661.1|", "10116", "g94788", "i0", "100", "99.0509803921569", "255", "0", "100", "0", "1", "255", "904", "650", "Rattus norvegicus TL0ACA47YE20 mRNA sequence", "blastn", "25258", "472", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [5812452, "PRJNA716463_P_NODE_98985_length_252_cov_2.134078_g98568_i0", "PRJNA716463", "98985", "252", "2.134078", "5.37787656", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "466", "6.89e-127", "", "NTclustered", "gi|157817024|ref|NM_001106476.1|", "10116", "g98568", "i0", "100", "4.16666666666667", "252", "0", "100", "0", "1", "252", "1922", "2173", "Rattus norvegicus methionyl aminopeptidase 1 (Metap1), mRNA", "blastn", "1050", "466", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [6296666, "PRJNA716463_P_NODE_107985_length_244_cov_3.385965_g107567_i0", "PRJNA716463", "107985", "244", "3.385965", "8.2617546", "Rattus", "10114", "Chordata", "Chordata", "451", "1.86e-122", "", "NTclustered", "gi|436778|dbj|D26073.1|RATPSAP", "10116", "g107567", "i0", "100", "97.4877049180328", "244", "0", "100", "0", "1", "244", "1224", "981", "Rattus norvegicus mRNA for phosphoribosylpyrophosphate synthetase-associated protein (39 kDa), complete cds", "blastn", "23787", "451", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [6297151, "PRJNA716463_P_NODE_83505_length_266_cov_1.191710_g83088_i0", "PRJNA716463", "83505", "266", "1.19171", "3.1699486", "Mus", "10088", "Chordata", "Chordata", "492", "1.2099999999999999e-134", "", "NTclustered", "gi|756142290|gb|KP260515.1|", "10090", "g83088", "i0", "100", "100", "266", "0", "100", "0", "1", "266", "3356", "3621", "Mus musculus strain ME mitochondrion, complete genome", "blastn", "26600", "492", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [7085773, "PRJNA716463_P_NODE_100026_length_251_cov_2.258427_g99609_i0", "PRJNA716463", "100026", "251", "2.258427", "5.66865177", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "453", "5.34e-123", "", "NTclustered", "gi|56606318|gb|AC119220.11|", "10090", "g99609", "i0", "99.203", "1", "251", "2", "100", "0", "1", "251", "52265", "52015", "Mus musculus chromosome 1, clone RP24-201K16, complete sequence", "blastn", "251", "453", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [7085913, "PRJNA716463_P_NODE_108686_length_244_cov_0.900585_g108268_i0", "PRJNA716463", "108686", "244", "0.900585", "2.1974274", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "446", "8.639999999999999e-121", "", "NTclustered", "gi|2708395107|ref|NM_001256465.3|", "10116", "g108268", "i0", "100", "2.98770491803279", "241", "0", "99", "0", "1", "241", "3206", "3446", "Rattus norvegicus copine 1 (Cpne1), mRNA", "blastn", "729", "446", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [7085937, "PRJNA716463_P_NODE_110266_length_242_cov_3.562130_g109848_i0", "PRJNA716463", "110266", "242", "3.56213", "8.6203546", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "448", "2.3799999999999995e-121", "", "NTclustered", "gi|2415900878|ref|NM_001415034.1|", "10116", "g109848", "i0", "100", "17.099173553719", "242", "0", "100", "0", "1", "242", "3966", "3725", "Rattus norvegicus SIN3 transcription regulator family member B (Sin3b), transcript variant 2, mRNA", "blastn", "4138", "448", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [7085941, "PRJNA716463_P_NODE_110666_length_242_cov_2.266272_g110248_i0", "PRJNA716463", "110666", "242", "2.266272", "5.48437824", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "448", "2.3799999999999995e-121", "", "NTclustered", "gi|56090418|ref|NM_001007676.1|", "10116", "g110248", "i0", "100", "12.8595041322314", "242", "0", "100", "0", "1", "242", "973", "732", "Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1 (Timmdc1), mRNA; nuclear gene for mitochondrial product", "blastn", "3112", "448", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [7085981, "PRJNA716463_P_NODE_11326_length_353_cov_3.296429_g10911_i0", "PRJNA716463", "11326", "353", "3.296429", "11.63639437", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "588", "2.0599999999999994e-163", "", "NTclustered", "gi|2678867815|ref|XM_039099119.2|", "10116", "g10911", "i0", "97.167", "100.543909348442", "353", "0", "100", "1", "1", "353", "4327", "3985", "PREDICTED: Rattus norvegicus erythrocyte membrane protein band 4.1-like 2 (Epb41l2), transcript variant X24, mRNA", "blastn", "35492", "588", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [7086099, "PRJNA716463_P_NODE_120106_length_228_cov_3.167742_g119688_i0", "PRJNA716463", "120106", "228", "3.167742", "7.22245176", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "422", "1.34e-113", "", "NTclustered", "gi|91980279|gb|DQ455823.1|", "10116", "g119688", "i0", "100", "37.7587719298246", "228", "0", "100", "0", "1", "228", "1751", "1978", "Rattus norvegicus MFGE8 long form mRNA, complete cds, alternatively spliced", "blastn", "8609", "422", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [7086280, "PRJNA716463_P_NODE_18806_length_310_cov_4.075949_g18389_i0", "PRJNA716463", "18806", "310", "4.075949", "12.6354419", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "278", "4.39e-70", "", "NTclustered", "gi|2784630610|ref|NM_001433240.1|", "10116", "g18389", "i0", "100", "6.75483870967742", "150", "0", "96", "0", "161", "310", "3505", "3356", "Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 85C (Ccdc85c), transcript variant 2, mRNA", "blastn", "2094", "278", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [7086639, "PRJNA716463_P_NODE_40726_length_298_cov_3.013333_g40309_i0", "PRJNA716463", "40726", "298", "3.013333", "8.97973234", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "545", "1.04e-150", "", "NTclustered", "gi|56236326|gb|AC140461.4|", "10090", "g40309", "i0", "99.666", "7.11409395973154", "299", "0", "100", "1", "1", "298", "115913", "116211", "Mus musculus BAC clone RP23-11M24 from 1, complete sequence", "blastn", "2120", "545", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [7086858, "PRJNA716463_P_NODE_55246_length_287_cov_1.789720_g54829_i0", "PRJNA716463", "55246", "287", "1.78972", "5.1364964", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "523", "4.6799999999999984e-144", "", "NTclustered", "gi|2678879622|ref|XM_006247619.5|", "10116", "g54829", "i0", "99.652", "22.8501742160279", "287", "0", "100", "1", "1", "287", "2419", "2134", "PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 16, member 6 (Slc16a6), transcript variant X3, mRNA", "blastn", "6558", "523", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [7086907, "PRJNA716463_P_NODE_58266_length_285_cov_1.452830_g57849_i0", "PRJNA716463", "58266", "285", "1.45283", "4.1405655", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "527", "3.59e-145", "", "NTclustered", "gi|2393986391|gb|OM502741.1|", "10116", "g57849", "i0", "100", "100", "285", "0", "100", "0", "1", "285", "314", "30", "Rattus norvegicus isolate PL6767 cytochrome b (CYTB) gene, partial cds; mitochondrial", "blastn", "28500", "527", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [7087024, "PRJNA716463_P_NODE_65226_length_280_cov_1.487923_g64809_i0", "PRJNA716463", "65226", "280", "1.487923", "4.1661844", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "95.3", "4.23e-15", "", "NTclustered", "gi|72534995|gb|AC160958.2|", "10090", "g64809", "i0", "87.952", "26.275", "83", "7", "29", "3", "92", "172", "162078", "161997", "Mus musculus BAC clone RP24-224I13 from chromosome 13, complete sequence", "blastn", "7357", "95.3", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [7087280, "PRJNA716463_P_NODE_80786_length_268_cov_1.579487_g80369_i0", "PRJNA716463", "80786", "268", "1.579487", "4.23302516", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "496", "9.429999999999999e-136", "", "NTclustered", "gi|2678951275|ref|XM_006239771.5|", "10116", "g80369", "i0", "100", "16.3544776119403", "268", "0", "100", "0", "1", "268", "5102", "4835", "PREDICTED: Rattus norvegicus photoreceptor cilium actin regulator (Pcare), transcript variant X1, mRNA", "blastn", "4383", "496", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [7087333, "PRJNA716463_P_NODE_8366_length_396_cov_2.978328_g7953_i0", "PRJNA716463", "8366", "396", "2.978328", "11.79417888", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "388", "2.54e-103", "", "NTclustered", "gi|28972446|dbj|AK122395.1|", "10090", "g7953", "i0", "88.125", "80.209595959596", "320", "27", "100", "8", "1", "311", "4580", "4263", "Mus musculus premature mRNA for mKIAA0890 protein", "blastn", "31763", "388", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [7087379, "PRJNA716463_P_NODE_8706_length_390_cov_4.249211_g8293_i0", "PRJNA716463", "8706", "390", "4.249211", "16.5719229", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "721", "0", "", "NTclustered", "gi|2678863041|ref|XM_006230009.5|", "10116", "g8293", "i0", "100", "10.5923076923077", "390", "0", "100", "0", "1", "390", "3628", "4017", "PREDICTED: Rattus norvegicus dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 3 (Dkk3), transcript variant X2, mRNA", "blastn", "4131", "721", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [7087409, "PRJNA716463_P_NODE_89506_length_260_cov_4.422460_g89089_i0", "PRJNA716463", "89506", "260", "4.42246", "11.498396", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "479", "9.17e-131", "", "NTclustered", "gi|2678895339|ref|XM_039092046.2|", "10116", "g89089", "i0", "100", "57.9769230769231", "259", "0", "99", "0", "1", "259", "5775", "5517", "PREDICTED: Rattus norvegicus myotubularin related protein 3 (Mtmr3), transcript variant X11, mRNA", "blastn", "15074", "479", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [7087503, "PRJNA716463_P_NODE_95486_length_255_cov_2.961538_g95069_i0", "PRJNA716463", "95486", "255", "2.961538", "7.5519219", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "472", "1.5e-128", "", "NTclustered", "gi|298903561|emb|FQ212572.1|", "10116", "g95069", "i0", "100", "83.7450980392157", "255", "0", "100", "0", "1", "255", "512", "258", "Rattus norvegicus TL0AAA52YJ07 mRNA sequence", "blastn", "21355", "472", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [7570608, "PRJNA716463_P_NODE_17186_length_310_cov_5.097046_g16769_i0", "PRJNA716463", "17186", "310", "5.097046", "15.8008426", "Bovidae", "9895", "Chordata", "Chordata", "278", "4.39e-70", "", "NTclustered", "gi|2633867324|ref|XM_061417809.1|", "9906", "g16769", "i0", "100", "41.9129032258065", "150", "0", "95", "0", "161", "310", "1833", "1982", "PREDICTED: Bos javanicus cyclin dependent kinase inhibitor 1B (CDKN1B), mRNA", "blastn", "12993", "278", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos javanicus"], [7570956, "PRJNA716463_P_NODE_83286_length_266_cov_1.595855_g82869_i0", "PRJNA716463", "83286", "266", "1.595855", "4.2449743", "Rattus", "10114", "Chordata", "Chordata", "333", "7.759999999999999e-87", "", "NTclustered", "gi|2678959573|ref|XM_006240987.4|", "10116", "g82869", "i0", "100", "67.3270676691729", "180", "0", "79", "0", "87", "266", "4364", "4543", "PREDICTED: Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase kinase 2 (Map2k2), transcript variant X3, mRNA", "blastn", "17909", "333", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 334, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "blastn", "p1": "PRJNA716463", "p2": "Chordata"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA716463&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "PRJNA716463", "label": "PRJNA716463", "count": 334, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&tax_phylum=Chordata", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA716463&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 334, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA716463&tax_phylum=Chordata", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA716463&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "Eukaryota", "label": "Eukaryota", "count": 334, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA716463&tax_phylum=Chordata&tax_superkingdom=Eukaryota", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA716463&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "Opisthokonta", "label": "Opisthokonta", "count": 334, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA716463&tax_phylum=Chordata&tax_clade=Opisthokonta", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA716463&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "Metazoa", "label": "Metazoa", "count": 334, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA716463&tax_phylum=Chordata&tax_kingdom=Metazoa", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA716463&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "Chordata", "label": "Chordata", "count": 334, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA716463", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": "7570956", "next_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA716463&tax_phylum=Chordata&_next=7570956", "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 162.44759899927885}