{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"blastn\", bioproject = \"PRJNA694770\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[674312, "PRJNA694770_P_NODE_37401_length_335_cov_1.175573_g37107_i0", "PRJNA694770", "37401", "335", "1.175573", "3.93816955", "Bdellovibrio sp. HCB337", "3394358", "Bacteria", "Bacteria", "335", "2.8e-87", "", "NTclustered", "gi|2895525383|gb|CP178621.1|", "3394358", "g37107", "i0", "85.893", "10.5820895522388", "319", "39", "94", "6", "1", "316", "2954428", "2954743", "Bdellovibrio sp. HCB337 chromosome, complete genome", "blastn", "3545", "335", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB337"], [675927, "PRJNA694770_P_NODE_95121_length_243_cov_0.905882_g94827_i0", "PRJNA694770", "95121", "243", "0.905882", "2.20129326", "Bdellovibrio sp. HAGR004", "3113895", "Bacteria", "Bacteria", "449", "6.65e-122", "", "NTclustered", "gi|2663432256|dbj|AP029176.1|", "3113895", "g94827", "i0", "100", "1", "243", "0", "100", "0", "1", "243", "2557295", "2557537", "Bdellovibrio sp. HAGR004 DNA, complete genome", "blastn", "243", "449", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HAGR004"], [1951184, "PRJNA694770_P_NODE_69402_length_265_cov_1.406250_g69108_i0", "PRJNA694770", "69402", "265", "1.40625", "3.7265625", "Bdellovibrio sp. HCB209", "3394354", "Bacteria", "Bacteria", "302", "2.18e-77", "", "NTclustered", "gi|2895998570|gb|CP178618.1|", "3394354", "g69108", "i0", "87.218", "28.9094339622641", "266", "32", "100", "2", "1", "265", "1220543", "1220807", "Bdellovibrio sp. HCB209 chromosome, complete genome", "blastn", "7661", "302", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB209"], [5008485, "PRJNA694770_P_NODE_26344_length_381_cov_1.000000_g26050_i0", "PRJNA694770", "26344", "381", "1", "3.81", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "435", "3.09e-117", "", "NTclustered", "gi|2800917394|gb|CP168972.1|", "959", "g26050", "i0", "87.5", "10.1023622047244", "376", "47", "99", "0", "6", "381", "3460764", "3460389", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd19 chromosome, complete genome", "blastn", "3849", "435", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [7054339, "PRJNA694770_P_NODE_87486_length_247_cov_0.885057_g87192_i0", "PRJNA694770", "87486", "247", "0.885057", "2.18609079", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "235", "2.07e-57", "", "NTclustered", "gi|2800920897|gb|CP168968.1|", "959", "g87192", "i0", "85.59", "8.41295546558704", "229", "28", "92", "4", "1", "228", "92164", "92388", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd5 chromosome, complete genome", "blastn", "2078", "235", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [8833126, "PRJNA694770_P_NODE_26327_length_381_cov_1.250000_g26033_i0", "PRJNA694770", "26327", "381", "1.25", "4.7625", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "213", "1.57e-50", "", "NTclustered", "gi|2258818259|gb|CP060220.1|", "2026715", "g26033", "i0", "79.605", "1.6246719160105", "304", "56", "79", "4", "75", "375", "2478611", "2478911", "MAG: Pseudobdellovibrionaceae bacterium isolate HK-STAS-BDEL-7 chromosome", "blastn", "619", "213", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [10878243, "PRJNA694770_P_NODE_33249_length_350_cov_1.389892_g32955_i0", "PRJNA694770", "33249", "350", "1.389892", "4.864622", "Bdellovibrio sp. HAGR004", "3113895", "Bacteria", "Bacteria", "647", "0", "", "NTclustered", "gi|2663432256|dbj|AP029176.1|", "3113895", "g32955", "i0", "100", "1", "350", "0", "100", "0", "1", "350", "2575464", "2575115", "Bdellovibrio sp. HAGR004 DNA, complete genome", "blastn", "350", "647", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HAGR004"], [17759103, "PRJNA694770_P_NODE_85374_length_248_cov_0.880000_g85080_i0", "PRJNA694770", "85374", "248", "0.88", "2.1824", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "348", "2.55e-91", "", "NTclustered", "gi|2800914199|gb|CP168971.1|", "959", "g85080", "i0", "91.935", "82.0725806451613", "248", "20", "100", "0", "1", "248", "750708", "750461", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd16 chromosome, complete genome", "blastn", "20354", "348", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [18526427, "PRJNA694770_P_NODE_42975_length_317_cov_1.520492_g42681_i0", "PRJNA694770", "42975", "317", "1.520492", "4.81995964", "Bdellovibrio sp. HAGR004", "3113895", "Bacteria", "Bacteria", "580", "3.0599999999999993e-161", "", "NTclustered", "gi|2663432256|dbj|AP029176.1|", "3113895", "g42681", "i0", "99.685", "1", "317", "1", "100", "0", "1", "317", "2585855", "2586171", "Bdellovibrio sp. HAGR004 DNA, complete genome", "blastn", "317", "580", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HAGR004"], [18527050, "PRJNA694770_P_NODE_66195_length_270_cov_1.477157_g65901_i0", "PRJNA694770", "66195", "270", "1.477157", "3.9883239", "Bdellovibrio sp. HAGR004", "3113895", "Bacteria", "Bacteria", "497", "2.6399999999999998e-136", "", "NTclustered", "gi|2663432256|dbj|AP029176.1|", "3113895", "g65901", "i0", "100", "0.996296296296296", "269", "0", "99", "0", "2", "270", "2550201", "2550469", "Bdellovibrio sp. HAGR004 DNA, complete genome", "blastn", "269", "497", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HAGR004"], [18527131, "PRJNA694770_P_NODE_69115_length_265_cov_1.921875_g68821_i0", "PRJNA694770", "69115", "265", "1.921875", "5.09296875", "Bdellovibrio sp. HAGR004", "3113895", "Bacteria", "Bacteria", "490", "4.3299999999999986e-134", "", "NTclustered", "gi|2663432256|dbj|AP029176.1|", "3113895", "g68821", "i0", "100", "1", "265", "0", "100", "0", "1", "265", "2540619", "2540355", "Bdellovibrio sp. HAGR004 DNA, complete genome", "blastn", "265", "490", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HAGR004"], [19802222, "PRJNA694770_P_NODE_74636_length_256_cov_1.683060_g74342_i0", "PRJNA694770", "74636", "256", "1.68306", "4.3086336", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "147", "1.04e-30", "", "NTclustered", "gi|2800948966|gb|CP168973.1|", "959", "g74342", "i0", "78.099", "26.2109375", "242", "45", "93", "7", "20", "256", "521255", "521493", "Bdellovibrio bacteriovorus strain HK2 chromosome, complete genome", "blastn", "6710", "147", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [21076055, "PRJNA694770_P_NODE_101777_length_213_cov_2.714286_g101483_i0", "PRJNA694770", "101777", "213", "2.714286", "5.78142918", "Bdellovibrio sp. HCB290", "3394356", "Bacteria", "Bacteria", "52.8", "0.019", "", "NTclustered", "gi|2895991164|gb|CP178620.1|", "3394356", "g101483", "i0", "100", "0.131455399061033", "28", "0", "13", "0", "71", "98", "1886036", "1886063", "Bdellovibrio sp. HCB290 chromosome, complete genome", "blastn", "28", "52.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB290"], [23626888, "PRJNA694770_P_NODE_30399_length_362_cov_1.065744_g30105_i0", "PRJNA694770", "30399", "362", "1.065744", "3.85799328", "Bdellovibrio sp. NC01", "2220073", "Bacteria", "Bacteria", "163", "1.52e-35", "", "NTclustered", "gi|1700686220|gb|CP030034.1|", "2220073", "g30105", "i0", "97.872", "48.4364640883978", "94", "2", "26", "0", "47", "140", "1756787", "1756880", "Bdellovibrio sp. NC01 chromosome, complete genome", "blastn", "17534", "163", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. NC01"], [23627714, "PRJNA694770_P_NODE_60979_length_278_cov_1.502439_g60685_i0", "PRJNA694770", "60979", "278", "1.502439", "4.17678042", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "263", "1.09e-65", "", "NTclustered", "gi|2800924434|gb|CP168967.1|", "959", "g60685", "i0", "85.057", "7.50719424460432", "261", "35", "93", "4", "1", "259", "3641734", "3641476", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd4 chromosome, complete genome", "blastn", "2087", "263", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [23628183, "PRJNA694770_P_NODE_78839_length_251_cov_0.865169_g78545_i0", "PRJNA694770", "78839", "251", "0.865169", "2.17157419", "Pseudobdellovibrio exovorus", "453816", "Bacteria", "Bacteria", "339", "1.56e-88", "", "NTclustered", "gi|469929247|gb|CP003537.1|", "1184267", "g78545", "i0", "91.2", "1.9840637450199201", "250", "20", "99", "2", "3", "251", "1887763", "1888011", "Bdellovibrio exovorus JSS, complete genome", "blastn", "498", "339", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [24900961, "PRJNA694770_P_NODE_49580_length_298_cov_1.368889_g49286_i0", "PRJNA694770", "49580", "298", "1.368889", "4.07928922", "Bdellovibrio sp. HAGR004", "3113895", "Bacteria", "Bacteria", "551", "2.239999999999999e-152", "", "NTclustered", "gi|2663432256|dbj|AP029176.1|", "3113895", "g49286", "i0", "100", "1.09395973154362", "298", "0", "100", "0", "1", "298", "2594309", "2594606", "Bdellovibrio sp. HAGR004 DNA, complete genome", "blastn", "326", "551", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HAGR004"], [24901214, "PRJNA694770_P_NODE_59200_length_281_cov_1.110577_g58906_i0", "PRJNA694770", "59200", "281", "1.110577", "3.12072137", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "279", "1.09e-70", "", "NTclustered", "gi|2800914199|gb|CP168971.1|", "959", "g58906", "i0", "84.643", "2.8576512455516", "280", "43", "99", "0", "2", "281", "1214405", "1214126", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd16 chromosome, complete genome", "blastn", "803", "279", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 18, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "blastn", "p1": "PRJNA694770", "p2": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA694770&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA694770", "label": "PRJNA694770", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA694770&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA694770&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA694770&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA694770&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA694770&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA694770&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA694770&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA694770&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA694770", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 155.40282300003128}