{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"blastn\", bioproject = \"PRJNA682078\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[3210566, "PRJNA682078_P_NODE_187943_length_270_cov_1.385787_g186166_i0", "PRJNA682078", "187943", "270", "1.385787", "3.7416249", "Bacteriovorax stolpii", "960", "Bacteria", "Bacteria", "241", "4.92e-59", "", "NTclustered", "gi|1700689994|gb|CP030035.1|", "960", "g186166", "i0", "83.588", "2.91481481481481", "262", "37", "96", "4", "11", "269", "1360028", "1360286", "Bacteriovorax stolpii strain AC01 chromosome, complete genome", "blastn", "787", "241", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [4489297, "PRJNA682078_P_NODE_254524_length_246_cov_1.300578_g252747_i0", "PRJNA682078", "254524", "246", "1.300578", "3.19942188", "Bacteriovorax stolpii", "960", "Bacteria", "Bacteria", "302", "2e-77", "", "NTclustered", "gi|1700689994|gb|CP030035.1|", "960", "g252747", "i0", "89.256", "1.97967479674797", "242", "24", "98", "2", "6", "246", "3794109", "3793869", "Bacteriovorax stolpii strain AC01 chromosome, complete genome", "blastn", "487", "302", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [5761664, "PRJNA682078_P_NODE_121465_length_323_cov_4.076000_g119688_i0", "PRJNA682078", "121465", "323", "4.076", "13.16548", "uncultured Bdellovibrio sp.", "239744", "Bacteria", "Bacteria", "584", "2.419999999999999e-162", "", "NTclustered", "gi|354780212|gb|JN412381.1|", "239744", "g119688", "i0", "99.381", "114.835913312693", "323", "1", "100", "1", "1", "323", "20", "341", "Uncultured Bdellovibrio sp. clone PM62 16S ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "37092", "584", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "uncultured Bdellovibrio sp."], [5765417, "PRJNA682078_P_NODE_271265_length_244_cov_0.900585_g269488_i0", "PRJNA682078", "271265", "244", "0.900585", "2.1974274", "Bacteriovorax sp. HI3", "2984118", "Bacteria", "Bacteria", "322", "1.52e-83", "", "NTclustered", "gi|2321225508|dbj|AP026946.1|", "2984118", "g269488", "i0", "91.139", "2.91803278688525", "237", "21", "97", "0", "8", "244", "3055887", "3055651", "Bacteriovorax sp. HI3 DNA, complete genome", "blastn", "712", "322", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax sp. HI3"], [6277405, "PRJNA682078_P_NODE_282025_length_242_cov_0.911243_g280248_i0", "PRJNA682078", "282025", "242", "0.911243", "2.20520806", "Bacteriovorax", "146784", "Bacteria", "Bacteria", "448", "2.3799999999999995e-121", "", "NTclustered", "gi|1700689994|gb|CP030035.1|", "960", "g280248", "i0", "100", "10.5537190082645", "242", "0", "100", "0", "1", "242", "1661712", "1661953", "Bacteriovorax stolpii strain AC01 chromosome, complete genome", "blastn", "2554", "448", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [7038950, "PRJNA682078_P_NODE_213086_length_255_cov_2.510989_g211309_i0", "PRJNA682078", "213086", "255", "2.510989", "6.40302195", "Micavibrio aeruginosavorus", "349221", "Bacteria", "Bacteria", "211", "3.61e-50", "", "NTclustered", "gi|347589306|gb|CP002382.1|", "856793", "g211309", "i0", "82.305", "15.2078431372549", "243", "43", "95", "0", "1", "243", "1584346", "1584104", "Micavibrio aeruginosavorus ARL-13, complete genome", "blastn", "3878", "211", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [7550753, "PRJNA682078_P_NODE_214166_length_255_cov_1.291209_g212389_i0", "PRJNA682078", "214166", "255", "1.291209", "3.29258295", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "451", "1.95e-122", "", "NTclustered", "gi|2663425168|dbj|AP029173.1|", "3113893", "g212389", "i0", "98.814", "16.1803921568627", "253", "3", "99", "0", "3", "255", "2943861", "2943609", "Bdellovibrio sp. CKG001 DNA, complete genome", "blastn", "4126", "455", "0.991208791208791", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. CKG001"], [7552071, "PRJNA682078_P_NODE_71666_length_408_cov_1.847761_g69891_i0", "PRJNA682078", "71666", "408", "1.847761", "7.53886488", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "726", "0", "", "NTclustered", "gi|1210342126|gb|CP020946.1|", "959", "g69891", "i0", "98.775", "205.561274509804", "408", "5", "100", "0", "1", "408", "2948434", "2948027", "Bdellovibrio bacteriovorus strain SSB218315, complete genome", "blastn", "83869", "726", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [8313995, "PRJNA682078_P_NODE_231587_length_250_cov_0.870056_g229810_i0", "PRJNA682078", "231587", "250", "0.870056", "2.17514", "Peredibacter sp. HCB2-198", "3383025", "Bacteria", "Bacteria", "213", "9.81e-51", "", "NTclustered", "gi|2867657404|gb|CP174607.1|", "3383025", "g229810", "i0", "82.8", "2.008", "250", "31", "99", "7", "4", "250", "3691891", "3691651", "Peredibacter sp. HCB2-198 chromosome, complete genome", "blastn", "502", "213", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter sp. HCB2-198"], [8315065, "PRJNA682078_P_NODE_274447_length_243_cov_1.270588_g272670_i0", "PRJNA682078", "274447", "243", "1.270588", "3.08752884", "Bacteriovorax stolpii", "960", "Bacteria", "Bacteria", "287", "5.52e-73", "", "NTclustered", "gi|1700689994|gb|CP030035.1|", "960", "g272670", "i0", "88.285", "35.40329218107", "239", "28", "98", "0", "4", "242", "1854516", "1854278", "Bacteriovorax stolpii strain AC01 chromosome, complete genome", "blastn", "8603", "287", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [10863440, "PRJNA682078_P_NODE_175909_length_277_cov_1.441176_g174132_i0", "PRJNA682078", "175909", "277", "1.441176", "3.99205752", "Bacteriovorax stolpii", "960", "Bacteria", "Bacteria", "303", "6.37e-78", "", "NTclustered", "gi|1326041851|gb|CP025704.1|", "960", "g174132", "i0", "87.266", "1.92779783393502", "267", "33", "96", "1", "12", "277", "2715853", "2715587", "Bacteriovorax stolpii strain DSM 12778 chromosome, complete genome", "blastn", "534", "303", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [12140363, "PRJNA682078_P_NODE_238070_length_249_cov_0.875000_g236293_i0", "PRJNA682078", "238070", "249", "0.875", "2.17875", "Bacteriovorax sp. HI3", "2984118", "Bacteria", "Bacteria", "267", "7.39e-67", "", "NTclustered", "gi|2321225508|dbj|AP026946.1|", "2984118", "g236293", "i0", "86.179", "1.88755020080321", "246", "34", "99", "0", "3", "248", "598477", "598722", "Bacteriovorax sp. HI3 DNA, complete genome", "blastn", "470", "267", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax sp. HI3"], [13415331, "PRJNA682078_P_NODE_25391_length_677_cov_2.269868_g23680_i0", "PRJNA682078", "25391", "677", "2.269868", "15.36700636", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "531", "7.109999999999999e-146", "", "NTclustered", "gi|2258818259|gb|CP060220.1|", "2026715", "g23680", "i0", "81.791", "301.096011816839", "659", "97", "96", "20", "31", "677", "3251792", "3251145", "MAG: Pseudobdellovibrionaceae bacterium isolate HK-STAS-BDEL-7 chromosome", "blastn", "203842", "531", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [15961831, "PRJNA682078_P_NODE_160553_length_287_cov_0.995327_g158776_i0", "PRJNA682078", "160553", "287", "0.995327", "2.85658849", "Peredibacter starrii", "28202", "Bacteria", "Bacteria", "503", "6.1e-138", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g158776", "i0", "98.258", "134.177700348432", "287", "5", "100", "0", "1", "287", "512689", "512975", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "38509", "503", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [15963642, "PRJNA682078_P_NODE_233593_length_249_cov_1.818182_g231816_i0", "PRJNA682078", "233593", "249", "1.818182", "4.52727318", "Bacteriovorax stolpii", "960", "Bacteria", "Bacteria", "309", "1.21e-79", "", "NTclustered", "gi|1700689994|gb|CP030035.1|", "960", "g231816", "i0", "89.669", "2.93975903614458", "242", "25", "97", "0", "8", "249", "1168414", "1168655", "Bacteriovorax stolpii strain AC01 chromosome, complete genome", "blastn", "732", "309", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [18513516, "PRJNA682078_P_NODE_257035_length_246_cov_0.890173_g255258_i0", "PRJNA682078", "257035", "246", "0.890173", "2.18982558", "Bacteriovorax stolpii", "960", "Bacteria", "Bacteria", "195", "3.49e-45", "", "NTclustered", "gi|1326041851|gb|CP025704.1|", "960", "g255258", "i0", "94.444", "0.51219512195122", "126", "7", "51", "0", "8", "133", "1544939", "1545064", "Bacteriovorax stolpii strain DSM 12778 chromosome, complete genome", "blastn", "126", "195", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [23613188, "PRJNA682078_P_NODE_211419_length_256_cov_2.153005_g209642_i0", "PRJNA682078", "211419", "256", "2.153005", "5.5116928", "Bdellovibrio sp. HCB288", "3394355", "Bacteria", "Bacteria", "226", "1.3e-54", "", "NTclustered", "gi|2895994964|gb|CP178619.1|", "3394355", "g209642", "i0", "82.677", "4.8203125", "254", "44", "99", "0", "3", "256", "2916740", "2916487", "Bdellovibrio sp. HCB288 chromosome, complete genome", "blastn", "1234", "226", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB288"], [24886690, "PRJNA682078_P_NODE_221280_length_251_cov_1.460674_g219503_i0", "PRJNA682078", "221280", "251", "1.460674", "3.66629174", "Bdellovibrio sp. HCB-162", "3394234", "Bacteria", "Bacteria", "222", "1.64e-53", "", "NTclustered", "gi|2898207634|gb|CP178861.1|", "3394234", "g219503", "i0", "83.613", "0.948207171314741", "238", "37", "94", "2", "15", "251", "936232", "936468", "Bdellovibrio sp. HCB-162 chromosome, complete genome", "blastn", "238", "222", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB-162"], [24887386, "PRJNA682078_P_NODE_249420_length_247_cov_0.885057_g247643_i0", "PRJNA682078", "249420", "247", "0.885057", "2.18609079", "Bacteriovorax stolpii", "960", "Bacteria", "Bacteria", "230", "9.61e-56", "", "NTclustered", "gi|1700689994|gb|CP030035.1|", "960", "g247643", "i0", "83.401", "2", "247", "41", "100", "0", "1", "247", "2749909", "2750155", "Bacteriovorax stolpii strain AC01 chromosome, complete genome", "blastn", "494", "230", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 19, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "blastn", "p1": "PRJNA682078", "p2": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA682078&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA682078", "label": "PRJNA682078", "count": 19, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA682078&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 19, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA682078&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA682078&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 19, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA682078&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA682078&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA682078&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 19, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA682078&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA682078&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 19, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA682078", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 162.97323000617325}