{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"blastn\", bioproject = \"PRJNA565584\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[554695, "PRJNA565584_P_NODE_126601_length_277_cov_2.764706_g125449_i0", "PRJNA565584", "126601", "277", "2.764706", "7.65823562", "Bacteriovorax stolpii", "960", "Bacteria", "Bacteria", "259", "1.4e-64", "", "NTclustered", "gi|1700689994|gb|CP030035.1|", "960", "g125449", "i0", "84.701", "0.967509025270758", "268", "31", "96", "5", "4", "268", "2648010", "2648270", "Bacteriovorax stolpii strain AC01 chromosome, complete genome", "blastn", "268", "259", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [1133929, "PRJNA565584_P_NODE_129661_length_275_cov_3.029703_g128509_i0", "PRJNA565584", "129661", "275", "3.029703", "8.33168325", "Bacteriovorax", "146784", "Bacteria", "Bacteria", "449", "7.670000000000001e-122", "", "NTclustered", "gi|1700689994|gb|CP030035.1|", "960", "g128509", "i0", "96.337", "232.447272727273", "273", "10", "99", "0", "3", "275", "1660726", "1660454", "Bacteriovorax stolpii strain AC01 chromosome, complete genome", "blastn", "63923", "449", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [2410377, "PRJNA565584_P_NODE_39182_length_480_cov_1.113022_g38031_i0", "PRJNA565584", "39182", "480", "1.113022", "5.3425056", "Peredibacter", "263370", "Bacteria", "Bacteria", "765", "0", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g38031", "i0", "95.417", "162.0125", "480", "22", "100", "0", "1", "480", "511695", "511216", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "77766", "771", "0.992217898832685", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [3685206, "PRJNA565584_P_NODE_120383_length_281_cov_2.307692_g119231_i0", "PRJNA565584", "120383", "281", "2.307692", "6.48461452", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "257", "5.11e-64", "", "NTclustered", "gi|1210342126|gb|CP020946.1|", "959", "g119231", "i0", "87.665", "232.701067615658", "227", "20", "79", "6", "2", "224", "2950116", "2950338", "Bdellovibrio bacteriovorus strain SSB218315, complete genome", "blastn", "65389", "257", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [3685393, "PRJNA565584_P_NODE_137863_length_270_cov_1.563452_g136711_i0", "PRJNA565584", "137863", "270", "1.563452", "4.2213204", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "237", "6.37e-58", "", "NTclustered", "gi|2801803968|gb|CP169237.1|", "959", "g136711", "i0", "85.043", "2.50740740740741", "234", "33", "86", "2", "5", "237", "591999", "591767", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd3 chromosome, complete genome", "blastn", "677", "237", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [5661679, "PRJNA565584_P_NODE_92885_length_310_cov_2.497890_g91733_i0", "PRJNA565584", "92885", "310", "2.49789", "7.743459", "Bdellovibrio sp. HCB-162", "3394234", "Bacteria", "Bacteria", "152", "2.7799999999999996e-32", "", "NTclustered", "gi|2898207634|gb|CP178861.1|", "3394234", "g91733", "i0", "86.429", "4.39354838709677", "140", "17", "45", "2", "169", "307", "2312022", "2312160", "Bdellovibrio sp. HCB-162 chromosome, complete genome", "blastn", "1362", "152", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB-162"], [7512208, "PRJNA565584_P_NODE_173586_length_250_cov_0.870056_g172434_i0", "PRJNA565584", "173586", "250", "0.870056", "2.17514", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "202", "2.12e-47", "", "NTclustered", "gi|2800920897|gb|CP168968.1|", "959", "g172434", "i0", "83.645", "8.044", "214", "35", "86", "0", "1", "214", "2186416", "2186629", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd5 chromosome, complete genome", "blastn", "2011", "204", "0.990196078431373", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [9484420, "PRJNA565584_P_NODE_198248_length_244_cov_2.181287_g197096_i0", "PRJNA565584", "198248", "244", "2.181287", "5.32234028", "Bdellovibrio sp. 22V", "3044166", "Bacteria", "Bacteria", "172", "1.62e-38", "", "NTclustered", "gi|2514198184|gb|CP125854.1|", "3044166", "g197096", "i0", "84.181", "18.7049180327869", "177", "28", "73", "0", "1", "177", "3354235", "3354059", "Bdellovibrio sp. 22V chromosome, complete genome", "blastn", "4564", "172", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. 22V"], [14584460, "PRJNA565584_P_NODE_171192_length_250_cov_1.728814_g170040_i0", "PRJNA565584", "171192", "250", "1.728814", "4.322035", "Bacteriovorax sp. HI3", "2984118", "Bacteria", "Bacteria", "294", "3.41e-75", "", "NTclustered", "gi|2321225508|dbj|AP026946.1|", "2984118", "g170040", "i0", "88.889", "1.476", "243", "22", "95", "3", "9", "246", "95534", "95776", "Bacteriovorax sp. HI3 DNA, complete genome", "blastn", "369", "294", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax sp. HI3"], [15163681, "PRJNA565584_P_NODE_85812_length_321_cov_1.008065_g84660_i0", "PRJNA565584", "85812", "321", "1.008065", "3.23588865", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "237", "7.750000000000001e-58", "", "NTclustered", "gi|2800924434|gb|CP168967.1|", "959", "g84660", "i0", "82.657", "6.07476635514019", "271", "43", "84", "4", "1", "269", "236433", "236701", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd4 chromosome, complete genome", "blastn", "1950", "237", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [15858757, "PRJNA565584_P_NODE_200513_length_244_cov_0.900585_g199361_i0", "PRJNA565584", "200513", "244", "0.900585", "2.1974274", "Bdellovibrio sp. HCB337", "3394358", "Bacteria", "Bacteria", "158", "4.53e-34", "", "NTclustered", "gi|2895525383|gb|CP178621.1|", "3394358", "g199361", "i0", "81.579", "18.094262295082", "190", "35", "78", "0", "11", "200", "4186394", "4186583", "Bdellovibrio sp. HCB337 chromosome, complete genome", "blastn", "4415", "158", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB337"], [16436328, "PRJNA565584_P_NODE_104453_length_292_cov_2.100457_g103301_i0", "PRJNA565584", "104453", "292", "2.100457", "6.13333444", "Pigmentibacter", "2838409", "Bacteria", "Bacteria", "255", "1.92e-63", "", "NTclustered", "gi|2651759839|dbj|AP029159.1|", "2683196", "g103301", "i0", "82.712", "195.27397260274", "295", "44", "99", "6", "1", "291", "507192", "507483", "Pigmentibacter ruber GTC16762 DNA, complete genome", "blastn", "57020", "255", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", "Silvanigrellales", "Silvanigrellaceae", "Pigmentibacter", "Pigmentibacter ruber"], [18406431, "PRJNA565584_P_NODE_109455_length_288_cov_2.051163_g108303_i0", "PRJNA565584", "109455", "288", "2.051163", "5.90734944", "Bdellovibrio sp. NC01", "2220073", "Bacteria", "Bacteria", "75", "5.69e-9", "", "NTclustered", "gi|1700686220|gb|CP030034.1|", "2220073", "g108303", "i0", "78.814", "6.40972222222222", "118", "19", "40", "4", "2", "116", "1460545", "1460431", "Bdellovibrio sp. NC01 chromosome, complete genome", "blastn", "1846", "75", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. NC01"], [18408148, "PRJNA565584_P_NODE_205775_length_243_cov_0.905882_g204623_i0", "PRJNA565584", "205775", "243", "0.905882", "2.20129326", "Bdellovibrio sp. HAGR004", "3113895", "Bacteria", "Bacteria", "449", "6.65e-122", "", "NTclustered", "gi|2663432256|dbj|AP029176.1|", "3113895", "g204623", "i0", "100", "1", "243", "0", "100", "0", "1", "243", "2541558", "2541800", "Bdellovibrio sp. HAGR004 DNA, complete genome", "blastn", "243", "449", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HAGR004"], [24780796, "PRJNA565584_P_NODE_117300_length_283_cov_2.133333_g116148_i0", "PRJNA565584", "117300", "283", "2.133333", "6.03733239", "Bdellovibrio sp. NC01", "2220073", "Bacteria", "Bacteria", "296", "1.09e-75", "", "NTclustered", "gi|1700686220|gb|CP030034.1|", "2220073", "g116148", "i0", "86.496", "68.3003533568905", "274", "31", "96", "6", "11", "283", "861457", "861189", "Bdellovibrio sp. NC01 chromosome, complete genome", "blastn", "19329", "296", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. NC01"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 15, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "blastn", "p1": "PRJNA565584", "p2": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA565584&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA565584", "label": "PRJNA565584", "count": 15, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA565584&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 15, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA565584&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA565584&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 15, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA565584&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA565584&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA565584&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 15, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA565584&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA565584&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 15, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA565584", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 153.19048200035468}