{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"blastn\", bioproject = \"PRJNA550047\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[3065598, "PRJNA550047_P_NODE_298823_length_297_cov_10.281250_g296854_i0", "PRJNA550047", "298823", "297", "10.28125", "30.5353125", "uncultured Oligoflexales bacterium", "2735263", "Bacteria", "Bacteria", "176", "1.57e-39", "", "NTclustered", "gi|2531963191|emb|OY282434.1|", "2735263", "g296854", "i0", "87.662", "123.097643097643", "154", "15", "51", "4", "147", "297", "955964", "956116", "MAG: uncultured Oligoflexales bacterium genome assembly, chromosome: 1", "blastn", "36560", "176", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", "Oligoflexales", null, null, "uncultured Oligoflexales bacterium"], [5618817, "PRJNA550047_P_NODE_323125_length_294_cov_4.194570_g321155_i0", "PRJNA550047", "323125", "294", "4.19457", "12.3320358", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "215", "3.29e-51", "", "NTclustered", "gi|2800924434|gb|CP168967.1|", "959", "g321155", "i0", "80.496", "3.58163265306122", "282", "53", "96", "2", "12", "292", "1044116", "1043836", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd4 chromosome, complete genome", "blastn", "1053", "215", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [6225932, "PRJNA550047_P_NODE_590405_length_201_cov_4.992188_g588432_i0", "PRJNA550047", "590405", "201", "4.992188", "10.03429788", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "174", "3.58e-39", "", "NTclustered", "gi|2801803968|gb|CP169237.1|", "959", "g588432", "i0", "83.871", "76.4676616915423", "186", "26", "92", "4", "1", "184", "3058838", "3059021", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd3 chromosome, complete genome", "blastn", "15370", "174", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [8775244, "PRJNA550047_P_NODE_598607_length_198_cov_12.920000_g596634_i0", "PRJNA550047", "598607", "198", "12.92", "25.5816", "Peredibacter", "263370", "Bacteria", "Bacteria", "348", "1.95e-91", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g596634", "i0", "98.477", "96.8434343434343", "197", "3", "99", "0", "1", "197", "512880", "513076", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "19175", "348", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [11992778, "PRJNA550047_P_NODE_231830_length_301_cov_5.460526_g229861_i0", "PRJNA550047", "231830", "301", "5.460526", "16.43618326", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "134", "9.72e-27", "", "NTclustered", "gi|2258818259|gb|CP060220.1|", "2026715", "g229861", "i0", "87.395", "0.395348837209302", "119", "12", "39", "3", "1", "118", "3251757", "3251641", "MAG: Pseudobdellovibrionaceae bacterium isolate HK-STAS-BDEL-7 chromosome", "blastn", "119", "134", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [15815285, "PRJNA550047_P_NODE_111453_length_345_cov_7.444853_g109493_i0", "PRJNA550047", "111453", "345", "7.444853", "25.68474285", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "113", "1.48e-20", "", "NTclustered", "gi|2800914199|gb|CP168971.1|", "959", "g109493", "i0", "81.618", "0.666666666666667", "136", "25", "39", "0", "13", "148", "2941147", "2941282", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd16 chromosome, complete genome", "blastn", "230", "113", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [15817649, "PRJNA550047_P_NODE_310493_length_296_cov_4.049327_g308524_i0", "PRJNA550047", "310493", "296", "4.049327", "11.98600792", "Peredibacter sp. HCB2-198", "3383025", "Bacteria", "Bacteria", "150", "9.469999999999999e-32", "", "NTclustered", "gi|2867657404|gb|CP174607.1|", "3383025", "g308524", "i0", "92.523", "0.722972972972973", "107", "5", "35", "3", "15", "118", "3401396", "3401502", "Peredibacter sp. HCB2-198 chromosome, complete genome", "blastn", "214", "150", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter sp. HCB2-198"], [17096465, "PRJNA550047_P_NODE_93934_length_345_cov_9.033088_g91974_i0", "PRJNA550047", "93934", "345", "9.033088", "31.1641536", "Micavibrio aeruginosavorus", "349221", "Bacteria", "Bacteria", "128", "5.27e-25", "", "NTclustered", "gi|469926873|gb|CP003538.1|", "349215", "g91974", "i0", "83.453", "11.3536231884058", "139", "21", "40", "2", "198", "335", "1068445", "1068308", "Micavibrio aeruginosavorus EPB, complete genome", "blastn", "3917", "128", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [18367622, "PRJNA550047_P_NODE_399675_length_265_cov_6.947917_g397703_i0", "PRJNA550047", "399675", "265", "6.947917", "18.41198005", "Peredibacter sp. HCB2-198", "3383025", "Bacteria", "Bacteria", "309", "1.3e-79", "", "NTclustered", "gi|2867657404|gb|CP174607.1|", "3383025", "g397703", "i0", "87.879", "1.97358490566038", "264", "30", "99", "2", "3", "265", "92568", "92306", "Peredibacter sp. HCB2-198 chromosome, complete genome", "blastn", "523", "309", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter sp. HCB2-198"], [20918031, "PRJNA550047_P_NODE_396157_length_266_cov_12.031088_g394185_i0", "PRJNA550047", "396157", "266", "12.031088", "32.00269408", "Micavibrio aeruginosavorus", "349221", "Bacteria", "Bacteria", "464", "2.64e-126", "", "NTclustered", "gi|469926873|gb|CP003538.1|", "349215", "g394185", "i0", "98.12", "1", "266", "5", "100", "0", "1", "266", "788335", "788070", "Micavibrio aeruginosavorus EPB, complete genome", "blastn", "266", "464", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [21522694, "PRJNA550047_P_NODE_259237_length_300_cov_5.436123_g257268_i0", "PRJNA550047", "259237", "300", "5.436123", "16.308369", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "97.1", "1.27e-15", "", "NTclustered", "gi|2801803968|gb|CP169237.1|", "959", "g257268", "i0", "90.411", "0.486666666666667", "73", "7", "24", "0", "221", "293", "1181072", "1181144", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd3 chromosome, complete genome", "blastn", "146", "97.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [22191489, "PRJNA550047_P_NODE_296498_length_297_cov_15.785714_g294529_i0", "PRJNA550047", "296498", "297", "15.785714", "46.88357058", "Pseudobdellovibrio sp. HCB154", "3386277", "Bacteria", "Bacteria", "119", "2.68e-22", "", "NTclustered", "gi|2872995934|gb|CP176530.1|", "3386277", "g294529", "i0", "94.737", "27.5387205387205", "76", "4", "26", "0", "222", "297", "61783", "61858", "Pseudobdellovibrio sp. HCB154 chromosome, complete genome", "blastn", "8179", "119", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio sp. HCB154"], [24074068, "PRJNA550047_P_NODE_554419_length_212_cov_8.892086_g552446_i0", "PRJNA550047", "554419", "212", "8.892086", "18.85122232", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "239", "1.33e-58", "", "NTclustered", "gi|1950812799|gb|CP066681.1|", "349221", "g552446", "i0", "87.5", "180.278301886792", "208", "24", "98", "2", "6", "212", "658671", "658465", "Micavibrio aeruginosavorus isolate NC_groundwater_70_Ag_B-0.1um_54_66 chromosome", "blastn", "38219", "239", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "Micavibrio aeruginosavorus"], [24743504, "PRJNA550047_P_NODE_514000_length_226_cov_5.143791_g512027_i0", "PRJNA550047", "514000", "226", "5.143791", "11.62496766", "Peredibacter starrii", "28202", "Bacteria", "Bacteria", "372", "1.36e-98", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g512027", "i0", "96.444", "11.5176991150442", "225", "8", "99", "0", "2", "226", "512412", "512188", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "2603", "372", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [25347767, "PRJNA550047_P_NODE_415520_length_259_cov_6.166667_g413548_i0", "PRJNA550047", "415520", "259", "6.166667", "15.97166753", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "195", "3.7e-45", "", "NTclustered", "gi|2800924434|gb|CP168967.1|", "959", "g413548", "i0", "88.485", "3.95752895752896", "165", "14", "63", "5", "94", "256", "2018744", "2018905", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd4 chromosome, complete genome", "blastn", "1025", "195", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 15, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "blastn", "p1": "PRJNA550047", "p2": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA550047&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA550047", "label": "PRJNA550047", "count": 15, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA550047&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 15, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA550047&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA550047&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 15, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA550047&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA550047&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA550047&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 15, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA550047&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA550047&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 15, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA550047", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 159.58148601930588}