{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"blastn\", bioproject = \"PRJNA520845\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[490377, "PRJNA520845_P_NODE_221781_length_250_cov_0.870056_g220282_i0", "PRJNA520845", "221781", "250", "0.870056", "2.17514", "Bdellovibrio sp. HCB209", "3394354", "Bacteria", "Bacteria", "230", "9.75e-56", "", "NTclustered", "gi|2895998570|gb|CP178618.1|", "3394354", "g220282", "i0", "83.267", "12.112", "251", "40", "100", "2", "1", "250", "2779304", "2779553", "Bdellovibrio sp. HCB209 chromosome, complete genome", "blastn", "3028", "230", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB209"], [1766710, "PRJNA520845_P_NODE_262222_length_242_cov_0.911243_g260723_i0", "PRJNA520845", "262222", "242", "0.911243", "2.20520806", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "448", "2.3799999999999995e-121", "", "NTclustered", "gi|635300599|gb|CP007656.1|", "959", "g260723", "i0", "100", "29.4710743801653", "242", "0", "100", "0", "1", "242", "2751598", "2751357", "Bdellovibrio bacteriovorus strain 109J, complete genome", "blastn", "7132", "448", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [5595229, "PRJNA520845_P_NODE_257305_length_243_cov_0.905882_g255806_i0", "PRJNA520845", "257305", "243", "0.905882", "2.20129326", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "444", "3.09e-120", "", "NTclustered", "gi|635300599|gb|CP007656.1|", "959", "g255806", "i0", "99.588", "20.5390946502058", "243", "1", "100", "0", "1", "243", "3266345", "3266587", "Bdellovibrio bacteriovorus strain 109J, complete genome", "blastn", "4991", "444", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [6214849, "PRJNA520845_P_NODE_165985_length_289_cov_1.097222_g164486_i0", "PRJNA520845", "165985", "289", "1.097222", "3.17097158", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "459", "1.3499999999999999e-124", "", "NTclustered", "gi|2800924434|gb|CP168967.1|", "959", "g164486", "i0", "95.47", "169.377162629758", "287", "13", "99", "0", "2", "288", "783653", "783939", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd4 chromosome, complete genome", "blastn", "48950", "459", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [6867778, "PRJNA520845_P_NODE_206646_length_256_cov_1.497268_g205147_i0", "PRJNA520845", "206646", "256", "1.497268", "3.83300608", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "346", "9.53e-91", "", "NTclustered", "gi|1210342126|gb|CP020946.1|", "959", "g205147", "i0", "91.016", "3.984375", "256", "23", "100", "0", "1", "256", "1347264", "1347519", "Bdellovibrio bacteriovorus strain SSB218315, complete genome", "blastn", "1020", "346", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [7489743, "PRJNA520845_P_NODE_234746_length_247_cov_0.885057_g233247_i0", "PRJNA520845", "234746", "247", "0.885057", "2.18609079", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "381", "2.5099999999999995e-101", "", "NTclustered", "gi|2771112236|gb|CP160486.1|", "959", "g233247", "i0", "94.694", "13.8947368421053", "245", "13", "99", "0", "1", "245", "3432184", "3432428", "Bdellovibrio bacteriovorus strain MHI39 chromosome", "blastn", "3432", "381", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [7489885, "PRJNA520845_P_NODE_267746_length_241_cov_0.916667_g266247_i0", "PRJNA520845", "267746", "241", "0.916667", "2.20916747", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "368", "1.9e-97", "", "NTclustered", "gi|2800927921|gb|CP168969.1|", "959", "g266247", "i0", "94.191", "16.954356846473", "241", "14", "100", "0", "1", "241", "774398", "774158", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd10 chromosome, complete genome", "blastn", "4086", "370", "0.994594594594595", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [13243427, "PRJNA520845_P_NODE_187851_length_271_cov_2.085859_g186352_i0", "PRJNA520845", "187851", "271", "2.085859", "5.65267789", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "335", "2.2e-87", "", "NTclustered", "gi|635300599|gb|CP007656.1|", "959", "g186352", "i0", "88.93", "15.0073800738007", "271", "30", "100", "0", "1", "271", "2871020", "2870750", "Bdellovibrio bacteriovorus strain 109J, complete genome", "blastn", "4067", "335", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [14519219, "PRJNA520845_P_NODE_215812_length_251_cov_0.865169_g214313_i0", "PRJNA520845", "215812", "251", "0.865169", "2.17157419", "Silvanigrella aquatica", "1915309", "Bacteria", "Bacteria", "62.1", "3.78e-5", "", "NTclustered", "gi|1114626566|gb|CP017834.1|", "1915309", "g214313", "i0", "90", "1.50597609561753", "50", "2", "20", "2", "156", "205", "2253328", "2253374", "Silvanigrella aquatica strain MWH-Nonnen-W8red chromosome", "blastn", "378", "62.1", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", "Silvanigrellales", "Silvanigrellaceae", "Silvanigrella", "Silvanigrella aquatica"], [16414024, "PRJNA520845_P_NODE_154173_length_300_cov_1.938326_g152674_i0", "PRJNA520845", "154173", "300", "1.938326", "5.814978", "Bacteriovorax", "146784", "Bacteria", "Bacteria", "555", "1.7399999999999995e-153", "", "NTclustered", "gi|1700689994|gb|CP030035.1|", "960", "g152674", "i0", "100", "470.536666666667", "300", "0", "100", "0", "1", "300", "1662222", "1661923", "Bacteriovorax stolpii strain AC01 chromosome, complete genome", "blastn", "141161", "555", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [18963428, "PRJNA520845_P_NODE_268375_length_238_cov_2.254545_g266876_i0", "PRJNA520845", "268375", "238", "2.254545", "5.3658171", "Pseudobdellovibrio", "2862745", "Bacteria", "Bacteria", "346", "8.76e-91", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g266876", "i0", "92.857", "79.5546218487395", "238", "17", "100", "0", "1", "238", "1433", "1670", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "18934", "346", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [22167411, "PRJNA520845_P_NODE_229818_length_248_cov_0.880000_g228319_i0", "PRJNA520845", "229818", "248", "0.88", "2.1824", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "392", "1.1599999999999999e-104", "", "NTclustered", "gi|425858678|gb|CP002930.1|", "1069642", "g228319", "i0", "95.161", "17.0120967741935", "248", "12", "100", "0", "1", "248", "3692541", "3692294", "Bdellovibrio bacteriovorus str. Tiberius, complete genome", "blastn", "4219", "392", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 12, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "blastn", "p1": "PRJNA520845", "p2": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA520845&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA520845", "label": "PRJNA520845", "count": 12, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA520845&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 12, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA520845&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA520845&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 12, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA520845&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA520845&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA520845&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 12, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA520845&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA520845&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 12, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA520845", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 341.22586800003774}