{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"blastn\", bioproject = \"PRJNA488043\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[1098079, "PRJNA488043_S_NODE_661_length_227_cov_8.823232_g650_i0", "PRJNA488043", "661", "227", "8.823232", "20.02873664", "Bacteriovorax", "146784", "Bacteria", "Bacteria", "340", "3.8499999999999996e-89", "", "NTclustered", "gi|1700689994|gb|CP030035.1|", "960", "g650", "i0", "93.506", "334.092511013216", "231", "11", "100", "3", "1", "227", "1661465", "1661695", "Bacteriovorax stolpii strain AC01 chromosome, complete genome", "blastn", "75839", "340", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [1724763, "PRJNA488043_S_NODE_862_length_203_cov_5.517241_g851_i0", "PRJNA488043", "862", "203", "5.517241", "11.19999923", "Peredibacter starrii", "28202", "Bacteria", "Bacteria", "342", "9.369999999999999e-90", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g851", "i0", "97.044", "147.325123152709", "203", "6", "100", "0", "1", "203", "512231", "512433", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "29907", "342", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [4277093, "PRJNA488043_S_NODE_704_length_221_cov_22.520833_g693_i0", "PRJNA488043", "704", "221", "22.520833", "49.77104093", "Bdellovibrio sp. HCB337", "3394358", "Bacteria", "Bacteria", "163", "8.67e-36", "", "NTclustered", "gi|2895525383|gb|CP178621.1|", "3394358", "g693", "i0", "83.077", "126.009049773756", "195", "18", "86", "13", "7", "195", "3447971", "3448156", "Bdellovibrio sp. HCB337 chromosome, complete genome", "blastn", "27848", "163", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB337"], [5553606, "PRJNA488043_S_NODE_85_length_482_cov_27.474614_g74_i0", "PRJNA488043", "85", "482", "27.474614", "132.42763948", "Bdellovibrio sp. HCB337", "3394358", "Bacteria", "Bacteria", "298", "5.46e-76", "", "NTclustered", "gi|2895525383|gb|CP178621.1|", "3394358", "g74", "i0", "89.407", "296.794605809129", "236", "25", "49", "0", "3", "238", "3446972", "3447207", "Bdellovibrio sp. HCB337 chromosome, complete genome", "blastn", "143055", "298", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB337"], [6201023, "PRJNA488043_P_NODE_16265_length_210_cov_52.116022_g14023_i0", "PRJNA488043", "16265", "210", "52.116022", "109.4436462", "Peredibacter", "263370", "Bacteria", "Bacteria", "222", "1.33e-53", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g14023", "i0", "99.187", "2.34285714285714", "123", "1", "59", "0", "88", "210", "513727", "513849", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "492", "222", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [6201195, "PRJNA488043_S_NODE_1365_length_165_cov_3.330882_g1354_i0", "PRJNA488043", "1365", "165", "3.330882", "5.4959553", "Peredibacter", "263370", "Bacteria", "Bacteria", "267", "4.53e-67", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g1354", "i0", "98.039", "42.2181818181818", "153", "3", "93", "0", "13", "165", "513594", "513442", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "6966", "267", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [6201203, "PRJNA488043_S_NODE_405_length_290_cov_9.429119_g394_i0", "PRJNA488043", "405", "290", "9.429119", "27.3444451", "Peredibacter", "263370", "Bacteria", "Bacteria", "508", "1.33e-139", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g394", "i0", "98.276", "224.089655172414", "290", "5", "100", "0", "1", "290", "511176", "511465", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "64986", "508", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [8102884, "PRJNA488043_P_NODE_13707_length_248_cov_3.264840_g11465_i0", "PRJNA488043", "13707", "248", "3.26484", "8.0968032", "Bdellovibrio sp. qaytius", "1916293", "Bacteria", "Bacteria", "364", "2.539999999999999e-96", "", "NTclustered", "gi|1552089877|gb|CP025734.1|", "1916293", "g11465", "i0", "93.802", "197.995967741935", "242", "15", "98", "0", "6", "247", "666243", "666484", "Bdellovibrio sp. qaytius chromosome, complete genome", "blastn", "49103", "364", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. qaytius"], [10026357, "PRJNA488043_S_NODE_728_length_217_cov_4.063830_g717_i0", "PRJNA488043", "728", "217", "4.06383", "8.8185111", "Bacteriovorax", "146784", "Bacteria", "Bacteria", "274", "3.76e-69", "", "NTclustered", "gi|1700689994|gb|CP030035.1|", "960", "g717", "i0", "91.5", "243.3133640553", "200", "16", "92", "1", "18", "216", "1662082", "1661883", "Bacteriovorax stolpii strain AC01 chromosome, complete genome", "blastn", "52799", "274", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [10653712, "PRJNA488043_S_NODE_1489_length_159_cov_5.784615_g1478_i0", "PRJNA488043", "1489", "159", "5.784615", "9.19753785", "Peredibacter sp. HCB2-198", "3383025", "Bacteria", "Bacteria", "289", "9.22e-74", "", "NTclustered", "gi|2867657404|gb|CP174607.1|", "3383025", "g1478", "i0", "99.371", "19.3962264150943", "159", "1", "100", "0", "1", "159", "1292617", "1292459", "Peredibacter sp. HCB2-198 chromosome, complete genome", "blastn", "3084", "289", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter sp. HCB2-198"], [11928470, "PRJNA488043_P_NODE_14290_length_238_cov_3.559809_g12048_i0", "PRJNA488043", "14290", "238", "3.559809", "8.47234542", "Peredibacter starrii", "28202", "Bacteria", "Bacteria", "418", "1.8299999999999998e-112", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g12048", "i0", "99.138", "146.96218487395", "232", "2", "97", "0", "1", "232", "512686", "512917", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "34977", "418", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [14478320, "PRJNA488043_P_NODE_11492_length_295_cov_36.244361_g9251_i0", "PRJNA488043", "11492", "295", "36.244361", "106.92086495", "Peredibacter starrii", "28202", "Bacteria", "Bacteria", "542", "1.33e-149", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g9251", "i0", "100", "523.918644067797", "293", "0", "99", "0", "1", "293", "512090", "511798", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "154556", "542", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [15126012, "PRJNA488043_P_NODE_7632_length_433_cov_3.183168_g5468_i0", "PRJNA488043", "7632", "433", "3.183168", "13.78311744", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "278", "6.34e-70", "", "NTclustered", "gi|2663425168|dbj|AP029173.1|", "3113893", "g5468", "i0", "79.475", "160.004618937644", "419", "65", "94", "15", "29", "433", "756177", "755766", "Bdellovibrio sp. CKG001 DNA, complete genome", "blastn", "69282", "278", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. CKG001"], [17675640, "PRJNA488043_P_NODE_4154_length_683_cov_9.527523_g2408_i0", "PRJNA488043", "4154", "683", "9.527523", "65.07298209", "Peredibacter", "263370", "Bacteria", "Bacteria", "1171", "0", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g2408", "i0", "97.654", "129.294289897511", "682", "16", "99", "0", "2", "683", "511371", "510690", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "88308", "1171", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [18949407, "PRJNA488043_P_NODE_18335_length_188_cov_3.509434_g16093_i0", "PRJNA488043", "18335", "188", "3.509434", "6.59773592", "Pseudobdellovibrionaceae", "213483", "Bacteria", "Bacteria", "259", "8.84e-65", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g16093", "i0", "93.22", "166.345744680851", "177", "10", "94", "2", "6", "181", "805", "980", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "31273", "261", "0.992337164750958", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [18949567, "PRJNA488043_S_NODE_455_length_275_cov_9.593496_g444_i0", "PRJNA488043", "455", "275", "9.593496", "26.382114", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "387", "6.1e-103", "", "NTclustered", "gi|2800948966|gb|CP168973.1|", "959", "g444", "i0", "91.844", "113.072727272727", "282", "16", "100", "4", "1", "275", "816342", "816623", "Bdellovibrio bacteriovorus strain HK2 chromosome, complete genome", "blastn", "31095", "387", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [20851416, "PRJNA488043_P_NODE_13097_length_259_cov_3.556522_g10856_i0", "PRJNA488043", "13097", "259", "3.556522", "9.21139198", "Bdellovibrio sp. HCB337", "3394358", "Bacteria", "Bacteria", "381", "2.6499999999999995e-101", "", "NTclustered", "gi|2895525383|gb|CP178621.1|", "3394358", "g10856", "i0", "93.411", "88.5868725868726", "258", "15", "99", "2", "2", "258", "3446692", "3446948", "Bdellovibrio sp. HCB337 chromosome, complete genome", "blastn", "22944", "381", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB337"], [20851620, "PRJNA488043_P_NODE_6877_length_473_cov_6.777027_g4775_i0", "PRJNA488043", "6877", "473", "6.777027", "32.05533771", "Peredibacter starrii", "28202", "Bacteria", "Bacteria", "822", "0", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g4775", "i0", "98.097", "115.875264270613", "473", "8", "100", "1", "1", "473", "512074", "512545", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "54809", "822", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [22126432, "PRJNA488043_P_NODE_6878_length_473_cov_6.623874_g4775_i1", "PRJNA488043", "6878", "473", "6.623874", "31.33092402", "Peredibacter starrii", "28202", "Bacteria", "Bacteria", "800", "0", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g4775", "i1", "97.252", "114.526427061311", "473", "12", "100", "1", "1", "473", "512074", "512545", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "54171", "800", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [22126490, "PRJNA488043_S_NODE_438_length_278_cov_170.248996_g427_i0", "PRJNA488043", "438", "278", "170.248996", "473.29220888", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "403", "6.13e-108", "", "NTclustered", "gi|2800948966|gb|CP168973.1|", "959", "g427", "i0", "92.832", "163.41726618705", "279", "18", "100", "2", "1", "278", "816402", "816125", "Bdellovibrio bacteriovorus strain HK2 chromosome, complete genome", "blastn", "45430", "403", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [22126494, "PRJNA488043_S_NODE_738_length_216_cov_7.695187_g727_i0", "PRJNA488043", "738", "216", "7.695187", "16.62160392", "Bdellovibrio sp. HCB337", "3394358", "Bacteria", "Bacteria", "311", "2.85e-80", "", "NTclustered", "gi|2895525383|gb|CP178621.1|", "3394358", "g727", "i0", "92.627", "92.3564814814815", "217", "15", "100", "1", "1", "216", "3446995", "3446779", "Bdellovibrio sp. HCB337 chromosome, complete genome", "blastn", "19949", "311", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB337"], [23402332, "PRJNA488043_S_NODE_919_length_197_cov_9.351190_g908_i0", "PRJNA488043", "919", "197", "9.35119", "18.4218443", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "309", "9.17e-80", "", "NTclustered", "gi|578016248|gb|CP002190.1|", "765869", "g908", "i0", "94.924", "198.939086294416", "197", "10", "100", "0", "1", "197", "611196", "611000", "Bdellovibrio bacteriovorus W, complete genome", "blastn", "39191", "309", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [24049802, "PRJNA488043_P_NODE_19359_length_178_cov_63.046980_g17117_i0", "PRJNA488043", "19359", "178", "63.04698", "112.2236244", "Peredibacter", "263370", "Bacteria", "Bacteria", "222", "1.08e-53", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g17117", "i0", "99.187", "2.76404494382022", "123", "1", "69", "0", "1", "123", "513849", "513727", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "492", "222", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 23, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "blastn", "p1": "PRJNA488043", "p2": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA488043&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA488043", "label": "PRJNA488043", "count": 23, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA488043&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 23, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA488043&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA488043&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 23, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA488043&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA488043&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA488043&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 23, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA488043&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA488043&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 23, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA488043", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 257.55020799988415}