{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"blastn\", bioproject = \"PRJNA437204\" and tax_phylum = \"Spirochaetota\"", "rows": [[432338, "PRJNA437204_P_NODE_29541_length_358_cov_27.231579_g29242_i0", "PRJNA437204", "29541", "358", "27.231579", "97.48905282", "Treponema bryantii", "163", "Bacteria", "Bacteria", "235", "3.1399999999999996e-57", "", "NTclustered", "gi|2581915939|dbj|AP025286.1|", "163", "g29242", "i0", "79.032", "1.38268156424581", "372", "57", "99", "11", "3", "355", "2063204", "2063573", "Treponema bryantii JCM 32280 DNA, complete genome", "blastn", "495", "235", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema bryantii"], [1090277, "PRJNA437204_P_NODE_8981_length_562_cov_1.300613_g8684_i0", "PRJNA437204", "8981", "562", "1.300613", "7.30944506", "Treponema", "157", "Bacteria", "Bacteria", "693", "0", "", "NTclustered", "gi|2189493055|gb|CP091738.1|", "167", "g8684", "i0", "89.209", "203.274021352313", "556", "59", "99", "1", "3", "557", "287494", "286939", "MAG: Treponema succinifaciens isolate nC27_bin.114.fa chromosome", "blastn", "114240", "693", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema succinifaciens"], [1706366, "PRJNA437204_P_NODE_100702_length_247_cov_0.885057_g100403_i0", "PRJNA437204", "100702", "247", "0.885057", "2.18609079", "Leptospira sp. 'Mane'", "3387407", "Bacteria", "Bacteria", "52.8", "0.022", "", "NTclustered", "gi|2889308543|gb|CP177134.1|", "3387407", "g100403", "i0", "100", "0.11336032388664", "28", "0", "11", "0", "48", "75", "2737128", "2737101", "Leptospira sp. 'Mane' chromosome 1, complete sequence", "blastn", "28", "52.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Leptospirales", "Leptospiraceae", "Leptospira", "Leptospira sp. 'Mane'"], [1706595, "PRJNA437204_P_NODE_111922_length_244_cov_0.900585_g111623_i0", "PRJNA437204", "111922", "244", "0.900585", "2.1974274", "Treponema ruminis", "744515", "Bacteria", "Bacteria", "424", "4.05e-114", "", "NTclustered", "gi|1996301026|gb|CP031518.1|", "744515", "g111623", "i0", "97.951", "84.1598360655738", "244", "5", "100", "0", "1", "244", "644477", "644234", "Treponema ruminis strain RU1 chromosome, complete genome", "blastn", "20535", "424", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema ruminis"], [1707038, "PRJNA437204_P_NODE_18322_length_425_cov_4.159091_g18023_i0", "PRJNA437204", "18322", "425", "4.159091", "17.67613675", "Treponema peruense", "2787628", "Bacteria", "Bacteria", "431", "4.4999999999999996e-116", "", "NTclustered", "gi|1946838279|gb|CP064936.1|", "2787628", "g18023", "i0", "85.047", "55.08", "428", "58", "100", "4", "1", "425", "1010705", "1011129", "Treponema peruense strain RCC2812 chromosome, complete genome", "blastn", "23409", "431", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema peruense"], [1707464, "PRJNA437204_P_NODE_40682_length_322_cov_6.309237_g40383_i0", "PRJNA437204", "40682", "322", "6.309237", "20.31574314", "Sphaerochaeta pleomorpha", "1131707", "Bacteria", "Bacteria", "147", "1.35e-30", "", "NTclustered", "gi|359350094|gb|CP003155.1|", "158190", "g40383", "i0", "76.61", "48.0031055900621", "295", "51", "89", "14", "8", "294", "487154", "487438", "Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes, complete genome", "blastn", "15457", "147", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Sphaerochaetaceae", "Sphaerochaeta", "Sphaerochaeta pleomorpha"], [1707754, "PRJNA437204_P_NODE_54402_length_291_cov_1.412844_g54103_i0", "PRJNA437204", "54402", "291", "1.412844", "4.11137604", "Treponema bryantii", "163", "Bacteria", "Bacteria", "340", "5.139999999999999e-89", "", "NTclustered", "gi|2581915939|dbj|AP025286.1|", "163", "g54103", "i0", "89.051", "67.7044673539519", "274", "30", "94", "0", "5", "278", "2409638", "2409365", "Treponema bryantii JCM 32280 DNA, complete genome", "blastn", "19702", "340", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema bryantii"], [2982145, "PRJNA437204_P_NODE_100463_length_247_cov_0.885057_g100164_i0", "PRJNA437204", "100463", "247", "0.885057", "2.18609079", "Treponema ruminis", "744515", "Bacteria", "Bacteria", "424", "4.1099999999999996e-114", "", "NTclustered", "gi|1996301026|gb|CP031518.1|", "744515", "g100164", "i0", "97.571", "1", "247", "6", "100", "0", "1", "247", "524441", "524687", "Treponema ruminis strain RU1 chromosome, complete genome", "blastn", "247", "424", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema ruminis"], [2982603, "PRJNA437204_P_NODE_125603_length_241_cov_0.916667_g125304_i0", "PRJNA437204", "125603", "241", "0.916667", "2.20916747", "Treponema ruminis", "744515", "Bacteria", "Bacteria", "180", "9.539999999999999e-41", "", "NTclustered", "gi|1996301026|gb|CP031518.1|", "744515", "g125304", "i0", "83.019", "0.879668049792531", "212", "23", "86", "9", "19", "225", "2213178", "2213381", "Treponema ruminis strain RU1 chromosome, complete genome", "blastn", "212", "180", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema ruminis"], [2982854, "PRJNA437204_P_NODE_22863_length_392_cov_1.028213_g22564_i0", "PRJNA437204", "22863", "392", "1.028213", "4.03059496", "Treponema bryantii", "163", "Bacteria", "Bacteria", "364", "4.239999999999998e-96", "", "NTclustered", "gi|2581915939|dbj|AP025286.1|", "163", "g22564", "i0", "83.698", "18.5688775510204", "411", "41", "99", "14", "1", "390", "466714", "466309", "Treponema bryantii JCM 32280 DNA, complete genome", "blastn", "7279", "364", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema bryantii"], [2982862, "PRJNA437204_P_NODE_23403_length_388_cov_16.539683_g23104_i0", "PRJNA437204", "23403", "388", "16.539683", "64.17397004", "Treponema ruminis", "744515", "Bacteria", "Bacteria", "547", "3.8799999999999996e-151", "", "NTclustered", "gi|1996301026|gb|CP031518.1|", "744515", "g23104", "i0", "92.526", "26.1262886597938", "388", "19", "100", "5", "1", "388", "1470573", "1470196", "Treponema ruminis strain RU1 chromosome, complete genome", "blastn", "10137", "547", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema ruminis"], [2983130, "PRJNA437204_P_NODE_36723_length_333_cov_3.580769_g36424_i0", "PRJNA437204", "36723", "333", "3.580769", "11.92396077", "Treponema bryantii", "163", "Bacteria", "Bacteria", "477", "4.37e-130", "", "NTclustered", "gi|2581915939|dbj|AP025286.1|", "163", "g36424", "i0", "92.492", "86.8978978978979", "333", "25", "100", "0", "1", "333", "704541", "704209", "Treponema bryantii JCM 32280 DNA, complete genome", "blastn", "28937", "477", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema bryantii"], [2983341, "PRJNA437204_P_NODE_45863_length_310_cov_0.974684_g45564_i0", "PRJNA437204", "45863", "310", "0.974684", "3.0215204", "Treponema bryantii", "163", "Bacteria", "Bacteria", "219", "2.7e-52", "", "NTclustered", "gi|2581915939|dbj|AP025286.1|", "163", "g45564", "i0", "79.805", "0.990322580645161", "307", "56", "98", "5", "7", "310", "3105472", "3105169", "Treponema bryantii JCM 32280 DNA, complete genome", "blastn", "307", "219", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema bryantii"], [2983451, "PRJNA437204_P_NODE_51403_length_297_cov_1.919643_g51104_i0", "PRJNA437204", "51403", "297", "1.919643", "5.70133971", "Treponema ruminis", "744515", "Bacteria", "Bacteria", "333", "8.8e-87", "", "NTclustered", "gi|1996301026|gb|CP031518.1|", "744515", "g51104", "i0", "87.248", "26.7878787878788", "298", "31", "99", "4", "2", "295", "1470536", "1470242", "Treponema ruminis strain RU1 chromosome, complete genome", "blastn", "7956", "333", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema ruminis"], [2984286, "PRJNA437204_P_NODE_96463_length_248_cov_0.880000_g96164_i0", "PRJNA437204", "96463", "248", "0.88", "2.1824", "Spirochaetia bacterium", "2053615", "Bacteria", "Bacteria", "176", "1.28e-39", "", "NTclustered", "gi|2907625707|emb|OZ223267.1|", "2053615", "g96164", "i0", "79.762", "17.8064516129032", "252", "43", "100", "6", "1", "248", "195310", "195557", "MAG: Spirochaetia bacterium isolate 50ab941f-e521-41e2-bb97-00a459704a5b genome assembly, chromosome: 4", "blastn", "4416", "176", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", null, null, null, "Spirochaetia bacterium"], [4259457, "PRJNA437204_P_NODE_33884_length_342_cov_2.167286_g33585_i0", "PRJNA437204", "33884", "342", "2.167286", "7.41211812", "Treponema bryantii", "163", "Bacteria", "Bacteria", "158", "6.6599999999999985e-34", "", "NTclustered", "gi|2581915939|dbj|AP025286.1|", "163", "g33585", "i0", "81.068", "0.60233918128655", "206", "31", "59", "8", "3", "205", "622313", "622113", "Treponema bryantii JCM 32280 DNA, complete genome", "blastn", "206", "158", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema bryantii"], [4260412, "PRJNA437204_P_NODE_84644_length_250_cov_0.870056_g84345_i0", "PRJNA437204", "84644", "250", "0.870056", "2.17514", "Treponema ruminis", "744515", "Bacteria", "Bacteria", "316", "7.269999999999998e-82", "", "NTclustered", "gi|1996301026|gb|CP031518.1|", "744515", "g84345", "i0", "89.558", "0.996", "249", "26", "99", "0", "1", "249", "1979022", "1979270", "Treponema ruminis strain RU1 chromosome, complete genome", "blastn", "249", "316", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema ruminis"], [5535269, "PRJNA437204_P_NODE_102365_length_246_cov_0.890173_g102066_i0", "PRJNA437204", "102365", "246", "0.890173", "2.18982558", "Treponema ruminis", "744515", "Bacteria", "Bacteria", "435", "1.8900000000000003e-117", "", "NTclustered", "gi|1996301026|gb|CP031518.1|", "744515", "g102066", "i0", "98.77", "2", "244", "3", "99", "0", "1", "244", "743215", "742972", "Treponema ruminis strain RU1 chromosome, complete genome", "blastn", "492", "435", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema ruminis"], [5535648, "PRJNA437204_P_NODE_123565_length_242_cov_0.911243_g123266_i0", "PRJNA437204", "123565", "242", "0.911243", "2.20520806", "Treponema ruminis", "744515", "Bacteria", "Bacteria", "226", "1.2099999999999997e-54", "", "NTclustered", "gi|1996301026|gb|CP031518.1|", "744515", "g123266", "i0", "84.188", "7.97933884297521", "234", "35", "96", "2", "10", "242", "2039349", "2039117", "Treponema ruminis strain RU1 chromosome, complete genome", "blastn", "1931", "226", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema ruminis"], [5536481, "PRJNA437204_P_NODE_5085_length_700_cov_144.491228_g4802_i0", "PRJNA437204", "5085", "700", "144.491228", "1011.438596", "Treponema ruminis", "744515", "Bacteria", "Bacteria", "180", "3.07e-40", "", "NTclustered", "gi|1996301026|gb|CP031518.1|", "744515", "g4802", "i0", "99", "15.0228571428571", "100", "1", "14", "0", "198", "297", "707885", "707984", "Treponema ruminis strain RU1 chromosome, complete genome", "blastn", "10516", "180", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema ruminis"], [6809809, "PRJNA437204_P_NODE_15666_length_451_cov_40.751323_g15367_i0", "PRJNA437204", "15666", "451", "40.751323", "183.78846673", "Treponema sp. Marseille-Q4132", "2766701", "Bacteria", "Bacteria", "167", "1.5e-36", "", "NTclustered", "gi|1897717435|gb|CP060591.1|", "2766701", "g15367", "i0", "76.997", "7.74722838137472", "313", "59", "69", "11", "44", "353", "330801", "330499", "Treponema sp. Marseille-Q4132 chromosome", "blastn", "3494", "167", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp. Marseille-Q4132"], [6809995, "PRJNA437204_P_NODE_25806_length_375_cov_1.778146_g25507_i0", "PRJNA437204", "25806", "375", "1.778146", "6.6680475", "Treponema ruminis", "744515", "Bacteria", "Bacteria", "346", "1.46e-90", "", "NTclustered", "gi|1996301026|gb|CP031518.1|", "744515", "g25507", "i0", "84.857", "1.94933333333333", "350", "45", "93", "7", "28", "375", "1470230", "1470573", "Treponema ruminis strain RU1 chromosome, complete genome", "blastn", "731", "346", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema ruminis"], [8085292, "PRJNA437204_P_NODE_130167_length_220_cov_5.938776_g129868_i0", "PRJNA437204", "130167", "220", "5.938776", "13.0653072", "Treponema succinifaciens", "167", "Bacteria", "Bacteria", "169", "1.85e-37", "", "NTclustered", "gi|328447254|gb|CP002631.1|", "869209", "g129868", "i0", "81.279", "2.59545454545455", "219", "32", "97", "9", "1", "213", "841802", "841587", "Treponema succinifaciens DSM 2489, complete genome", "blastn", "571", "169", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema succinifaciens"], [8085624, "PRJNA437204_P_NODE_31847_length_349_cov_12.456522_g31548_i0", "PRJNA437204", "31847", "349", "12.456522", "43.47326178", "Treponema ruminis", "744515", "Bacteria", "Bacteria", "623", "5.569999999999999e-174", "", "NTclustered", "gi|1996301026|gb|CP031518.1|", "744515", "g31548", "i0", "98.854", "1", "349", "4", "100", "0", "1", "349", "893382", "893730", "Treponema ruminis strain RU1 chromosome, complete genome", "blastn", "349", "623", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema ruminis"], [8086115, "PRJNA437204_P_NODE_55547_length_289_cov_1.342593_g55248_i0", "PRJNA437204", "55547", "289", "1.342593", "3.88009377", "Treponema peruense", "2787628", "Bacteria", "Bacteria", "252", "2.46e-62", "", "NTclustered", "gi|1946838279|gb|CP064936.1|", "2787628", "g55248", "i0", "85.081", "3.30449826989619", "248", "35", "85", "2", "16", "262", "1099486", "1099240", "Treponema peruense strain RCC2812 chromosome, complete genome", "blastn", "955", "252", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema peruense"], [8086487, "PRJNA437204_P_NODE_75107_length_257_cov_1.673913_g74808_i0", "PRJNA437204", "75107", "257", "1.673913", "4.30195641", "Treponema parvum", "138851", "Bacteria", "Bacteria", "163", "1.04e-35", "", "NTclustered", "gi|2023444933|gb|CP054257.1|", "138851", "g74808", "i0", "83.77", "60.8210116731518", "191", "12", "74", "8", "1", "191", "1121393", "1121564", "Treponema parvum strain ATCC 700773 chromosome, complete genome", "blastn", "15631", "163", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema parvum"], [9360356, "PRJNA437204_P_NODE_25408_length_377_cov_4.500000_g25109_i0", "PRJNA437204", "25408", "377", "4.5", "16.965", "Treponema succinifaciens", "167", "Bacteria", "Bacteria", "265", "4.24e-66", "", "NTclustered", "gi|328447254|gb|CP002631.1|", "869209", "g25109", "i0", "82.792", "4.72679045092838", "308", "42", "81", "9", "29", "334", "1328786", "1329084", "Treponema succinifaciens DSM 2489, complete genome", "blastn", "1782", "265", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema succinifaciens"], [9361607, "PRJNA437204_P_NODE_92648_length_248_cov_1.834286_g92349_i0", "PRJNA437204", "92648", "248", "1.834286", "4.54902928", "Treponema succinifaciens", "167", "Bacteria", "Bacteria", "250", "7.41e-62", "", "NTclustered", "gi|328447254|gb|CP002631.1|", "869209", "g92349", "i0", "85.772", "2.79838709677419", "246", "23", "97", "10", "3", "242", "841795", "841556", "Treponema succinifaciens DSM 2489, complete genome", "blastn", "694", "250", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema succinifaciens"], [10636597, "PRJNA437204_P_NODE_47009_length_307_cov_1.316239_g46710_i0", "PRJNA437204", "47009", "307", "1.316239", "4.04085373", "Treponema sp.", "166", "Bacteria", "Bacteria", "263", "1.22e-65", "", "NTclustered", "gi|2189480979|gb|CP091737.1|", "166", "g46710", "i0", "86.066", "9.42671009771987", "244", "34", "79", "0", "3", "246", "645090", "645333", "MAG: Treponema sp. isolate nC27_bin.160.fa chromosome", "blastn", "2894", "263", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [10637009, "PRJNA437204_P_NODE_67989_length_268_cov_1.266667_g67690_i0", "PRJNA437204", "67989", "268", "1.266667", "3.39466756", "Treponema ruminis", "744515", "Bacteria", "Bacteria", "337", "6.05e-88", "", "NTclustered", "gi|1996301026|gb|CP031518.1|", "744515", "g67690", "i0", "89.474", "0.992537313432836", "266", "28", "99", "0", "3", "268", "2137213", "2136948", "Treponema ruminis strain RU1 chromosome, complete genome", "blastn", "266", "337", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema ruminis"], [10637286, "PRJNA437204_P_NODE_8289_length_579_cov_1.768775_g7993_i0", "PRJNA437204", "8289", "579", "1.768775", "10.24120725", "Treponema succinifaciens", "167", "Bacteria", "Bacteria", "553", "1.2899999999999995e-152", "", "NTclustered", "gi|328447254|gb|CP002631.1|", "869209", "g7993", "i0", "85.499", "23.4784110535406", "531", "75", "92", "2", "1", "530", "2000298", "1999769", "Treponema succinifaciens DSM 2489, complete genome", "blastn", "13594", "553", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema succinifaciens"], [11910493, "PRJNA437204_P_NODE_11470_length_509_cov_1.412844_g11172_i0", "PRJNA437204", "11470", "509", "1.412844", "7.19137596", "Treponema bryantii", "163", "Bacteria", "Bacteria", "448", "5.44e-121", "", "NTclustered", "gi|2581915939|dbj|AP025286.1|", "163", "g11172", "i0", "84.144", "31.6876227897839", "473", "63", "91", "9", "28", "488", "469834", "469362", "Treponema bryantii JCM 32280 DNA, complete genome", "blastn", "16129", "448", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema bryantii"], [11910750, "PRJNA437204_P_NODE_129850_length_229_cov_4.262821_g129551_i0", "PRJNA437204", "129850", "229", "4.262821", "9.76186009", "Treponema bryantii", "163", "Bacteria", "Bacteria", "278", "3.1e-70", "", "NTclustered", "gi|2581915939|dbj|AP025286.1|", "163", "g129551", "i0", "88.596", "1.51091703056769", "228", "26", "99", "0", "2", "229", "2408938", "2409165", "Treponema bryantii JCM 32280 DNA, complete genome", "blastn", "346", "278", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema bryantii"], [11911033, "PRJNA437204_P_NODE_26990_length_369_cov_8.949324_g26691_i0", "PRJNA437204", "26990", "369", "8.949324", "33.02300556", "Treponema sp.", "166", "Bacteria", "Bacteria", "283", "1.14e-71", "", "NTclustered", "gi|2189480979|gb|CP091737.1|", "166", "g26691", "i0", "81.016", "155.525745257453", "374", "55", "99", "14", "1", "368", "2006278", "2006641", "MAG: Treponema sp. isolate nC27_bin.160.fa chromosome", "blastn", "57389", "283", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema sp."], [13185798, "PRJNA437204_P_NODE_16811_length_440_cov_1.258856_g16512_i0", "PRJNA437204", "16811", "440", "1.258856", "5.5389664", "Treponema bryantii", "163", "Bacteria", "Bacteria", "298", "4.95e-76", "", "NTclustered", "gi|2581915939|dbj|AP025286.1|", "163", "g16512", "i0", "79.212", "1.03863636363636", "457", "73", "99", "11", "2", "438", "2059849", "2060303", "Treponema bryantii JCM 32280 DNA, complete genome", "blastn", "457", "298", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema bryantii"], [13186907, "PRJNA437204_P_NODE_74571_length_258_cov_1.535135_g74272_i0", "PRJNA437204", "74571", "258", "1.535135", "3.9606483", "Treponema ruminis", "744515", "Bacteria", "Bacteria", "390", "4.38e-104", "", "NTclustered", "gi|1996301026|gb|CP031518.1|", "744515", "g74272", "i0", "94.466", "154.786821705426", "253", "14", "98", "0", "3", "255", "705938", "706190", "Treponema ruminis strain RU1 chromosome, complete genome", "blastn", "39935", "390", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema ruminis"], [13843328, "PRJNA437204_P_NODE_38831_length_327_cov_2.374016_g38532_i0", "PRJNA437204", "38831", "327", "2.374016", "7.76303232", "Treponema", "157", "Bacteria", "Bacteria", "305", "2.14e-78", "", "NTclustered", "gi|2189493055|gb|CP091738.1|", "167", "g38532", "i0", "83.841", "110.929663608563", "328", "45", "100", "8", "1", "321", "286539", "286865", "MAG: Treponema succinifaciens isolate nC27_bin.114.fa chromosome", "blastn", "36274", "305", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema succinifaciens"], [14460485, "PRJNA437204_P_NODE_111972_length_244_cov_0.900585_g111673_i0", "PRJNA437204", "111972", "244", "0.900585", "2.1974274", "Treponema bryantii", "163", "Bacteria", "Bacteria", "141", "4.57e-29", "", "NTclustered", "gi|2581915939|dbj|AP025286.1|", "163", "g111673", "i0", "79.098", "1.2827868852459", "244", "22", "99", "16", "4", "244", "1919760", "1919543", "Treponema bryantii JCM 32280 DNA, complete genome", "blastn", "313", "141", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema bryantii"], [14460878, "PRJNA437204_P_NODE_15612_length_452_cov_1.807388_g15313_i0", "PRJNA437204", "15612", "452", "1.807388", "8.16939376", "Treponema bryantii", "163", "Bacteria", "Bacteria", "344", "6.449999999999999e-90", "", "NTclustered", "gi|2581915939|dbj|AP025286.1|", "163", "g15313", "i0", "82.09", "3.7787610619469", "402", "72", "89", "0", "16", "417", "2231505", "2231104", "Treponema bryantii JCM 32280 DNA, complete genome", "blastn", "1708", "344", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema bryantii"], [14460983, "PRJNA437204_P_NODE_20952_length_404_cov_2.326284_g20653_i0", "PRJNA437204", "20952", "404", "2.326284", "9.39818736", "Treponema peruense", "2787628", "Bacteria", "Bacteria", "289", "2.71e-73", "", "NTclustered", "gi|1946838279|gb|CP064936.1|", "2787628", "g20653", "i0", "79.95", "17.9975247524752", "404", "71", "99", "10", "1", "399", "1011127", "1010729", "Treponema peruense strain RCC2812 chromosome, complete genome", "blastn", "7271", "289", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema peruense"], [15734377, "PRJNA437204_P_NODE_114993_length_244_cov_0.900585_g114694_i0", "PRJNA437204", "114993", "244", "0.900585", "2.1974274", "Treponema ruminis", "744515", "Bacteria", "Bacteria", "204", "5.74e-48", "", "NTclustered", "gi|1996301026|gb|CP031518.1|", "744515", "g114694", "i0", "93.431", "0.561475409836066", "137", "9", "56", "0", "8", "144", "1509641", "1509505", "Treponema ruminis strain RU1 chromosome, complete genome", "blastn", "137", "204", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema ruminis"], [15734494, "PRJNA437204_P_NODE_12113_length_498_cov_2.482353_g11815_i0", "PRJNA437204", "12113", "498", "2.482353", "12.36211794", "Treponema bryantii", "163", "Bacteria", "Bacteria", "451", "4.099999999999999e-122", "", "NTclustered", "gi|2581915939|dbj|AP025286.1|", "163", "g11815", "i0", "83.333", "5.01606425702811", "504", "68", "99", "14", "1", "496", "1428743", "1428248", "Treponema bryantii JCM 32280 DNA, complete genome", "blastn", "2498", "451", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema bryantii"], [17008790, "PRJNA437204_P_NODE_101734_length_246_cov_1.728324_g101435_i0", "PRJNA437204", "101734", "246", "1.728324", "4.25167704", "Treponema ruminis", "744515", "Bacteria", "Bacteria", "176", "1.26e-39", "", "NTclustered", "gi|1996301026|gb|CP031518.1|", "744515", "g101435", "i0", "94.69", "0.939024390243902", "113", "6", "46", "0", "1", "113", "2325145", "2325257", "Treponema ruminis strain RU1 chromosome, complete genome", "blastn", "231", "176", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema ruminis"], [17009550, "PRJNA437204_P_NODE_25934_length_375_cov_1.013245_g25635_i0", "PRJNA437204", "25934", "375", "1.013245", "3.79966875", "Spirochaetia bacterium", "2053615", "Bacteria", "Bacteria", "283", "1.16e-71", "", "NTclustered", "gi|2621785583|emb|OY782041.1|", "2053615", "g25635", "i0", "81.953", "5.32533333333333", "338", "58", "90", "3", "7", "342", "608617", "608281", "MAG: Spirochaetia bacterium isolate d8b3d310-4ac7-4817-9bde-c02243007ba8 genome assembly, chromosome: 1", "blastn", "1997", "283", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", null, null, null, "Spirochaetia bacterium"], [17667362, "PRJNA437204_P_NODE_34634_length_340_cov_1.153558_g34335_i0", "PRJNA437204", "34634", "340", "1.153558", "3.9220972", "Treponema", "157", "Bacteria", "Bacteria", "431", "3.529999999999999e-116", "", "NTclustered", "gi|2581915939|dbj|AP025286.1|", "163", "g34335", "i0", "89.535", "31", "344", "31", "100", "5", "1", "340", "1069941", "1070283", "Treponema bryantii JCM 32280 DNA, complete genome", "blastn", "10540", "433", "0.995381062355658", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema bryantii"], [18283896, "PRJNA437204_P_NODE_25055_length_379_cov_8.722222_g24756_i0", "PRJNA437204", "25055", "379", "8.722222", "33.05722138", "Treponema peruense", "2787628", "Bacteria", "Bacteria", "270", "9.16e-68", "", "NTclustered", "gi|1946838279|gb|CP064936.1|", "2787628", "g24756", "i0", "80.84", "1.00527704485488", "381", "42", "100", "22", "1", "379", "1703213", "1703564", "Treponema peruense strain RCC2812 chromosome, complete genome", "blastn", "381", "270", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema peruense"], [18284042, "PRJNA437204_P_NODE_33555_length_343_cov_13.477778_g33256_i0", "PRJNA437204", "33555", "343", "13.477778", "46.22877854", "Treponema succinifaciens", "167", "Bacteria", "Bacteria", "185", "3.0599999999999995e-42", "", "NTclustered", "gi|328447254|gb|CP002631.1|", "869209", "g33256", "i0", "86.628", "3.58600583090379", "172", "18", "50", "3", "52", "222", "1329049", "1328882", "Treponema succinifaciens DSM 2489, complete genome", "blastn", "1230", "185", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema succinifaciens"], [19558272, "PRJNA437204_P_NODE_31156_length_352_cov_1.440860_g30857_i0", "PRJNA437204", "31156", "352", "1.44086", "5.0718272", "Treponema ruminis", "744515", "Bacteria", "Bacteria", "217", "1.11e-51", "", "NTclustered", "gi|1996301026|gb|CP031518.1|", "744515", "g30857", "i0", "87.978", "0.519886363636364", "183", "22", "52", "0", "1", "183", "2136269", "2136087", "Treponema ruminis strain RU1 chromosome, complete genome", "blastn", "183", "217", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema ruminis"], [19559178, "PRJNA437204_P_NODE_75776_length_256_cov_1.683060_g75477_i0", "PRJNA437204", "75776", "256", "1.68306", "4.3086336", "Treponema bryantii", "163", "Bacteria", "Bacteria", "252", "2.14e-62", "", "NTclustered", "gi|2581915939|dbj|AP025286.1|", "163", "g75477", "i0", "86.047", "18.29296875", "258", "9", "100", "8", "1", "256", "734531", "734763", "Treponema bryantii JCM 32280 DNA, complete genome", "blastn", "4683", "252", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema bryantii"], [20834047, "PRJNA437204_P_NODE_30537_length_355_cov_0.698582_g30238_i0", "PRJNA437204", "30537", "355", "0.698582", "2.4799661", "Treponema medium", "58231", "Bacteria", "Bacteria", "473", "6.05e-129", "", "NTclustered", "gi|1996291085|gb|CP027017.1|", "58231", "g30238", "i0", "99.615", "270.239436619718", "260", "0", "73", "1", "96", "355", "1015267", "1015525", "Treponema medium strain T19 chromosome, complete genome", "blastn", "95935", "473", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema medium"], [23384026, "PRJNA437204_P_NODE_118619_length_243_cov_0.905882_g118320_i0", "PRJNA437204", "118619", "243", "0.905882", "2.20129326", "Treponema bryantii", "163", "Bacteria", "Bacteria", "241", "4.36e-59", "", "NTclustered", "gi|2581915939|dbj|AP025286.1|", "163", "g118320", "i0", "85.837", "0.958847736625514", "233", "25", "95", "6", "1", "230", "488933", "488706", "Treponema bryantii JCM 32280 DNA, complete genome", "blastn", "233", "241", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema bryantii"], [23384575, "PRJNA437204_P_NODE_30799_length_353_cov_18.450000_g30500_i0", "PRJNA437204", "30799", "353", "18.45", "65.1285", "Treponema peruense", "2787628", "Bacteria", "Bacteria", "263", "1.42e-65", "", "NTclustered", "gi|1946838279|gb|CP064936.1|", "2787628", "g30500", "i0", "85.771", "10.4844192634561", "253", "31", "71", "4", "102", "353", "1703319", "1703567", "Treponema peruense strain RCC2812 chromosome, complete genome", "blastn", "3701", "263", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema peruense"], [23385177, "PRJNA437204_P_NODE_62059_length_277_cov_2.171569_g61760_i0", "PRJNA437204", "62059", "277", "2.171569", "6.01524613", "Treponema ruminis", "744515", "Bacteria", "Bacteria", "490", "4.56e-134", "", "NTclustered", "gi|1996301026|gb|CP031518.1|", "744515", "g61760", "i0", "98.561", "1.00361010830325", "278", "2", "100", "2", "1", "277", "2469399", "2469123", "Treponema ruminis strain RU1 chromosome, complete genome", "blastn", "278", "490", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema ruminis"], [23385800, "PRJNA437204_P_NODE_95059_length_248_cov_0.880000_g94760_i0", "PRJNA437204", "95059", "248", "0.88", "2.1824", "Treponema bryantii", "163", "Bacteria", "Bacteria", "296", "9.39e-76", "", "NTclustered", "gi|2581915939|dbj|AP025286.1|", "163", "g94760", "i0", "91.244", "63.1935483870968", "217", "19", "88", "0", "24", "240", "474672", "474456", "Treponema bryantii JCM 32280 DNA, complete genome", "blastn", "15672", "296", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema bryantii"], [24657830, "PRJNA437204_P_NODE_101620_length_246_cov_1.780347_g101321_i0", "PRJNA437204", "101620", "246", "1.780347", "4.37965362", "Treponema peruense", "2787628", "Bacteria", "Bacteria", "204", "5.799999999999998e-48", "", "NTclustered", "gi|1946838279|gb|CP064936.1|", "2787628", "g101321", "i0", "82", "3.04878048780488", "250", "36", "100", "9", "1", "246", "1269678", "1269922", "Treponema peruense strain RCC2812 chromosome, complete genome", "blastn", "750", "204", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema peruense"], [24658303, "PRJNA437204_P_NODE_128180_length_241_cov_0.916667_g127881_i0", "PRJNA437204", "128180", "241", "0.916667", "2.20916747", "Treponema ruminis", "744515", "Bacteria", "Bacteria", "281", "2.54e-71", "", "NTclustered", "gi|1996301026|gb|CP031518.1|", "744515", "g127881", "i0", "87.866", "0.991701244813278", "239", "29", "99", "0", "3", "241", "2323550", "2323788", "Treponema ruminis strain RU1 chromosome, complete genome", "blastn", "239", "281", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Spirochaetota", "Spirochaetia", "Spirochaetales", "Treponemataceae", "Treponema", "Treponema ruminis"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 56, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "blastn", "p1": "PRJNA437204", "p2": "Spirochaetota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA437204&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [{"value": "PRJNA437204", "label": "PRJNA437204", "count": 56, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&tax_phylum=Spirochaetota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA437204&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 56, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA437204&tax_phylum=Spirochaetota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA437204&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 56, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA437204&tax_phylum=Spirochaetota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA437204&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA437204&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 56, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA437204&tax_phylum=Spirochaetota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA437204&tax_phylum=Spirochaetota", "results": [{"value": "Spirochaetota", "label": "Spirochaetota", "count": 56, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA437204", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 180.57571099780034}