{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"blastn\", bioproject = \"PRJNA436017\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[430921, "PRJNA436017_P_NODE_3421_length_505_cov_15.297009_g3141_i0", "PRJNA436017", "3421", "505", "15.297009", "77.24989545", "Bdellovibrio sp. qaytius", "1916293", "Bacteria", "Bacteria", "828", "0", "", "NTclustered", "gi|1552089877|gb|CP025734.1|", "1916293", "g3141", "i0", "96.238", "236.578217821782", "505", "19", "100", "0", "1", "505", "666828", "666324", "Bdellovibrio sp. qaytius chromosome, complete genome", "blastn", "119472", "828", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. qaytius"], [1089109, "PRJNA436017_P_NODE_8381_length_304_cov_1.936330_g8084_i0", "PRJNA436017", "8381", "304", "1.93633", "5.8864432", "Pseudobdellovibrio", "2862745", "Bacteria", "Bacteria", "496", "1.09e-135", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g8084", "i0", "96.053", "95.6118421052632", "304", "12", "100", "0", "1", "304", "1356", "1659", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "29066", "496", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [1705881, "PRJNA436017_P_NODE_7582_length_322_cov_1.968421_g7285_i0", "PRJNA436017", "7582", "322", "1.968421", "6.33831562", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "183", "1.03e-41", "", "NTclustered", "gi|578016248|gb|CP002190.1|", "765869", "g7285", "i0", "77.961", "5.03105590062112", "304", "59", "93", "7", "23", "322", "611895", "611596", "Bdellovibrio bacteriovorus W, complete genome", "blastn", "1620", "183", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [2981553, "PRJNA436017_P_NODE_2643_length_578_cov_5.390018_g2381_i0", "PRJNA436017", "2643", "578", "5.390018", "31.15430404", "Peredibacter starrii", "28202", "Bacteria", "Bacteria", "752", "0", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g2381", "i0", "93.064", "48.3529411764706", "519", "29", "89", "7", "2", "516", "512478", "511963", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "27948", "752", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [2981692, "PRJNA436017_P_NODE_7023_length_336_cov_5.100334_g6726_i0", "PRJNA436017", "7023", "336", "5.100334", "17.13712224", "Peredibacter sp. HCB2-198", "3383025", "Bacteria", "Bacteria", "499", "9.42e-137", "", "NTclustered", "gi|2867657404|gb|CP174607.1|", "3383025", "g6726", "i0", "93.491", "179.485119047619", "338", "18", "100", "3", "1", "336", "1292617", "1292282", "Peredibacter sp. HCB2-198 chromosome, complete genome", "blastn", "60307", "499", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter sp. HCB2-198"], [4917117, "PRJNA436017_P_NODE_13644_length_226_cov_4.746032_g13346_i0", "PRJNA436017", "13644", "226", "4.746032", "10.72603232", "Pseudobdellovibrionaceae", "213483", "Bacteria", "Bacteria", "180", "8.84e-41", "", "NTclustered", "gi|1552089877|gb|CP025734.1|", "1916293", "g13346", "i0", "81.498", "138.300884955752", "227", "34", "98", "8", "5", "226", "665724", "665947", "Bdellovibrio sp. qaytius chromosome, complete genome", "blastn", "31256", "180", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. qaytius"], [8084250, "PRJNA436017_P_NODE_5127_length_402_cov_4.980822_g4831_i0", "PRJNA436017", "5127", "402", "4.980822", "20.02290444", "Pseudobdellovibrio sp. HCB154", "3386277", "Bacteria", "Bacteria", "737", "0", "", "NTclustered", "gi|2872995934|gb|CP176530.1|", "3386277", "g4831", "i0", "99.751", "91.6169154228856", "402", "1", "100", "0", "1", "402", "700273", "700674", "Pseudobdellovibrio sp. HCB154 chromosome, complete genome", "blastn", "36830", "737", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio sp. HCB154"], [11292182, "PRJNA436017_P_NODE_16109_length_205_cov_4.345238_g15811_i0", "PRJNA436017", "16109", "205", "4.345238", "8.9077379", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "204", "4.67e-48", "", "NTclustered", "gi|1210342126|gb|CP020946.1|", "959", "g15811", "i0", "86.772", "119.409756097561", "189", "18", "90", "7", "17", "201", "2952106", "2952291", "Bdellovibrio bacteriovorus strain SSB218315, complete genome", "blastn", "24479", "204", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [14459415, "PRJNA436017_P_NODE_11972_length_245_cov_5.947115_g11674_i0", "PRJNA436017", "11972", "245", "5.947115", "14.57043175", "Pseudobdellovibrio sp. HCB154", "3386277", "Bacteria", "Bacteria", "206", "1.6e-48", "", "NTclustered", "gi|2872995934|gb|CP176530.1|", "3386277", "g11674", "i0", "83.482", "83.9510204081633", "224", "33", "90", "4", "1", "221", "699366", "699144", "Pseudobdellovibrio sp. HCB154 chromosome, complete genome", "blastn", "20568", "206", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio sp. HCB154"], [14459517, "PRJNA436017_P_NODE_16872_length_200_cov_1.865031_g16574_i0", "PRJNA436017", "16872", "200", "1.865031", "3.730062", "Pseudobdellovibrio exovorus", "453816", "Bacteria", "Bacteria", "193", "9.81e-45", "", "NTclustered", "gi|469929247|gb|CP003537.1|", "1184267", "g16574", "i0", "86.034", "1.81", "179", "25", "90", "0", "1", "179", "2324122", "2324300", "Bdellovibrio exovorus JSS, complete genome", "blastn", "362", "193", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [17008303, "PRJNA436017_P_NODE_9214_length_286_cov_18.755020_g8916_i0", "PRJNA436017", "9214", "286", "18.75502", "53.6393572", "Bdellovibrio sp. qaytius", "1916293", "Bacteria", "Bacteria", "425", "1.35e-114", "", "NTclustered", "gi|1552089877|gb|CP025734.1|", "1916293", "g8916", "i0", "93.426", "223.643356643357", "289", "15", "100", "4", "1", "286", "666828", "666541", "Bdellovibrio sp. qaytius chromosome, complete genome", "blastn", "63962", "425", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. qaytius"], [19556546, "PRJNA436017_P_NODE_15436_length_211_cov_1.287356_g15138_i0", "PRJNA436017", "15436", "211", "1.287356", "2.71632116", "Bdellovibrio sp. HCB337", "3394358", "Bacteria", "Bacteria", "244", "2.85e-60", "", "NTclustered", "gi|2895525383|gb|CP178621.1|", "3394358", "g15138", "i0", "87.736", "88.2227488151659", "212", "23", "100", "3", "1", "211", "3447019", "3447228", "Bdellovibrio sp. HCB337 chromosome, complete genome", "blastn", "18615", "244", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB337"], [19556578, "PRJNA436017_P_NODE_1756_length_712_cov_6.397037_g1532_i0", "PRJNA436017", "1756", "712", "6.397037", "45.54690344", "Peredibacter starrii", "28202", "Bacteria", "Bacteria", "1171", "0", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g1532", "i0", "96.484", "142.442415730337", "711", "21", "99", "3", "4", "712", "511414", "510706", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "101419", "1171", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [19556902, "PRJNA436017_P_NODE_8356_length_304_cov_34.052434_g8059_i0", "PRJNA436017", "8356", "304", "34.052434", "103.51939936", "Bdellovibrio sp. qaytius", "1916293", "Bacteria", "Bacteria", "451", "2.39e-122", "", "NTclustered", "gi|1552089877|gb|CP025734.1|", "1916293", "g8059", "i0", "93.421", "167.351973684211", "304", "20", "100", "0", "1", "304", "666577", "666274", "Bdellovibrio sp. qaytius chromosome, complete genome", "blastn", "50875", "451", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. qaytius"], [20215276, "PRJNA436017_P_NODE_2436_length_606_cov_104.595782_g2183_i0", "PRJNA436017", "2436", "606", "104.595782", "633.85043892", "Peredibacter", "263370", "Bacteria", "Bacteria", "1044", "0", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g2183", "i0", "98.007", "259.981848184818", "602", "10", "99", "1", "5", "604", "512108", "511507", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "157549", "1050", "0.994285714285714", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [20832307, "PRJNA436017_P_NODE_14177_length_221_cov_2.684783_g13879_i0", "PRJNA436017", "14177", "221", "2.684783", "5.93337043", "Bdellovibrio sp. qaytius", "1916293", "Bacteria", "Bacteria", "126", "1.1399999999999999e-24", "", "NTclustered", "gi|1552089877|gb|CP025734.1|", "1916293", "g13879", "i0", "88.571", "1.66968325791855", "105", "10", "47", "2", "1", "104", "180216", "180113", "Bdellovibrio sp. qaytius chromosome, complete genome", "blastn", "369", "126", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. qaytius"], [22766056, "PRJNA436017_P_NODE_5078_length_404_cov_6.261580_g4782_i0", "PRJNA436017", "5078", "404", "6.26158", "25.2967832", "Pseudobdellovibrio", "2862745", "Bacteria", "Bacteria", "520", "8.84e-143", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g4782", "i0", "89.926", "113.495049504951", "407", "35", "99", "6", "1", "403", "499", "95", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "45852", "520", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [22766092, "PRJNA436017_P_NODE_9798_length_276_cov_5.543933_g9500_i0", "PRJNA436017", "9798", "276", "5.543933", "15.30125508", "Pseudobdellovibrionaceae", "213483", "Bacteria", "Bacteria", "344", "3.74e-90", "", "NTclustered", "gi|2872995934|gb|CP176530.1|", "3386277", "g9500", "i0", "89.17", "173.800724637681", "277", "28", "100", "2", "1", "276", "699976", "699701", "Pseudobdellovibrio sp. HCB154 chromosome, complete genome", "blastn", "47969", "344", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio sp. HCB154"], [23382875, "PRJNA436017_P_NODE_15519_length_210_cov_1.676301_g15221_i0", "PRJNA436017", "15519", "210", "1.676301", "3.5202321", "uncultured Micavibrio sp.", "362447", "Bacteria", "Bacteria", "289", "1.29e-73", "", "NTclustered", "gi|2621703983|emb|OY762938.1|", "362447", "g15221", "i0", "93.333", "175.552380952381", "195", "13", "93", "0", "16", "210", "961896", "961702", "MAG: uncultured Micavibrio sp. isolate 194a20bb-105a-45c9-9846-0688499aae06 genome assembly, chromosome: 1", "blastn", "36866", "289", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "uncultured Micavibrio sp."], [24040804, "PRJNA436017_P_NODE_17939_length_193_cov_10.525641_g17641_i0", "PRJNA436017", "17939", "193", "10.525641", "20.31448713", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "220", "4.31e-53", "", "NTclustered", "gi|2800948966|gb|CP168973.1|", "959", "g17641", "i0", "87.629", "286.20725388601", "194", "19", "100", "5", "1", "193", "815235", "815424", "Bdellovibrio bacteriovorus strain HK2 chromosome, complete genome", "blastn", "55238", "220", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [24040819, "PRJNA436017_P_NODE_20199_length_182_cov_1.075862_g19901_i0", "PRJNA436017", "20199", "182", "1.075862", "1.95806884", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "189", "1.13e-43", "", "NTclustered", "gi|2800914199|gb|CP168971.1|", "959", "g19901", "i0", "86.286", "4.17032967032967", "175", "23", "96", "1", "8", "181", "2553594", "2553420", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd16 chromosome, complete genome", "blastn", "759", "189", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [24656966, "PRJNA436017_P_NODE_14260_length_220_cov_43.415301_g13962_i0", "PRJNA436017", "14260", "220", "43.415301", "95.5136622", "uncultured Bdellovibrio sp.", "239744", "Bacteria", "Bacteria", "357", "3.69e-94", "", "NTclustered", "gi|111607566|gb|DQ847445.1|", "239744", "g13962", "i0", "96.313", "96.8272727272727", "217", "8", "99", "0", "1", "217", "21", "237", "Uncultured Bdellovibrio sp. clone GR2-101 16S ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "21302", "357", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "uncultured Bdellovibrio sp."]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 22, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "blastn", "p1": "PRJNA436017", "p2": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA436017&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA436017", "label": "PRJNA436017", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA436017&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA436017&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA436017&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA436017&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA436017&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA436017&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA436017&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA436017&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 22, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA436017", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 232.951623002009}