{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"blastn\", bioproject = \"PRJNA322517\" and tax_phylum = \"Chordata\"", "rows": [[389321, "PRJNA322517_P_NODE_5041_length_173_cov_2.467742_g5019_i0", "PRJNA322517", "5041", "173", "2.467742", "4.26919366", "Mesoplodon densirostris", "48708", "Chordata", "Chordata", "89.8", "1.11e-13", "", "NTclustered", "gi|2589194213|ref|XM_060078496.1|", "48708", "g5019", "i0", "81.416", "8.41040462427746", "113", "18", "64", "3", "28", "138", "180", "291", "PREDICTED: Mesoplodon densirostris deoxyribonuclease 1 (DNASE1), transcript variant X4, mRNA", "blastn", "1455", "89.8", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Ziphiidae", "Mesoplodon", "Mesoplodon densirostris"], [389335, "PRJNA322517_P_NODE_5441_length_167_cov_0.864407_g5419_i0", "PRJNA322517", "5441", "167", "0.864407", "1.44355969", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "303", "3.5e-78", "", "NTclustered", "gi|5901754|gb|AF178845.1|AF178845", "10116", "g5419", "i0", "99.401", "31.9640718562874", "167", "1", "100", "0", "1", "167", "1338", "1504", "Rattus norvegicus calmodulin mRNA, complete cds", "blastn", "5338", "303", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [389345, "PRJNA322517_P_NODE_5741_length_165_cov_0.879310_g5719_i0", "PRJNA322517", "5741", "165", "0.87931", "1.4508615", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "296", "5.77e-76", "", "NTclustered", "gi|2678936033|ref|XM_063285523.1|", "10116", "g5719", "i0", "98.802", "2.87878787878788", "167", "0", "100", "1", "1", "165", "3472", "3306", "PREDICTED: Rattus norvegicus KRAS proto-oncogene, GTPase (Kras), transcript variant X4, mRNA", "blastn", "475", "296", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [389363, "PRJNA322517_P_NODE_6181_length_162_cov_0.902655_g6159_i0", "PRJNA322517", "6181", "162", "0.902655", "1.4623011", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "300", "4.36e-77", "", "NTclustered", "gi|2048774926|ref|NM_001395135.1|", "10116", "g6159", "i0", "100", "16.537037037037", "162", "0", "100", "0", "1", "162", "962", "1123", "Rattus norvegicus similar to human chromosome 1 open reading frame 52 (C2h1orf52), mRNA", "blastn", "2679", "300", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1664043, "PRJNA322517_P_NODE_5722_length_165_cov_0.879310_g5700_i0", "PRJNA322517", "5722", "165", "0.87931", "1.4508615", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "300", "4.46e-77", "", "NTclustered", "gi|2678927707|ref|XM_063283237.1|", "10116", "g5700", "i0", "99.394", "4", "165", "1", "100", "0", "1", "165", "4769", "4933", "PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 1 member 2 (Slc1a2), transcript variant X3, mRNA", "blastn", "660", "300", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1664052, "PRJNA322517_P_NODE_5902_length_164_cov_0.886957_g5880_i0", "PRJNA322517", "5902", "164", "0.886957", "1.45460948", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "298", "1.59e-76", "", "NTclustered", "gi|157819570|ref|NM_001106996.1|", "10116", "g5880", "i0", "100", "26.8414634146341", "161", "0", "98", "0", "1", "161", "3965", "4125", "Rattus norvegicus cytoplasmic FMR1 interacting protein 2 (Cyfip2), mRNA", "blastn", "4402", "298", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [1664061, "PRJNA322517_P_NODE_6182_length_162_cov_0.902655_g6160_i0", "PRJNA322517", "6182", "162", "0.902655", "1.4623011", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "300", "4.36e-77", "", "NTclustered", "gi|2678966669|ref|XM_039082102.2|", "10116", "g6160", "i0", "100", "36.7283950617284", "162", "0", "100", "0", "1", "162", "1260", "1421", "PREDICTED: Rattus norvegicus angiomotin like 2 (Amotl2), transcript variant X2, mRNA", "blastn", "5950", "300", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [2344418, "PRJNA322517_P_NODE_4662_length_181_cov_1.212121_g4640_i0", "PRJNA322517", "4662", "181", "1.212121", "2.19393901", "Bovidae", "9895", "Chordata", "Chordata", "204", "4.01e-48", "", "NTclustered", "gi|2607066119|ref|XM_060403501.1|", "9940", "g4640", "i0", "87.151", "33.353591160221", "179", "23", "99", "0", "1", "179", "23012", "22834", "PREDICTED: Ovis aries ataxin 1 (ATXN1), transcript variant X8, mRNA", "blastn", "6037", "204", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Ovis", "Ovis aries"], [2344419, "PRJNA322517_P_NODE_4702_length_180_cov_1.557252_g4680_i0", "PRJNA322517", "4702", "180", "1.557252", "2.8030536", "Rattus", "10114", "Chordata", "Chordata", "333", "4.87e-87", "", "NTclustered", "gi|298896652|emb|FQ218186.1|", "10116", "g4680", "i0", "100", "100", "180", "0", "100", "0", "1", "180", "19", "198", "Rattus norvegicus TL0ABA7YO05 mRNA sequence", "blastn", "18000", "333", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [2939976, "PRJNA322517_P_NODE_6203_length_162_cov_0.902655_g6181_i0", "PRJNA322517", "6203", "162", "0.902655", "1.4623011", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "230", "5.799999999999999e-56", "", "NTclustered", "gi|37650887|emb|AL844608.18|", "10090", "g6181", "i0", "92.547", "37.5802469135802", "161", "10", "99", "1", "1", "161", "146263", "146421", "Mouse DNA sequence from clone RP23-27L22 on chromosome 2, complete sequence", "blastn", "6088", "230", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [3619815, "PRJNA322517_P_NODE_5783_length_164_cov_3.034783_g5761_i0", "PRJNA322517", "5783", "164", "3.034783", "4.97704412", "root", "1", "Root_unresolved", "Root_unresolved", "303", "3.42e-78", "", "NTclustered", "gi|2587618203|ref|XR_009493738.1|", "9913", "g5761", "i0", "100", "145.414634146341", "164", "0", "100", "0", "1", "164", "8528", "8691", "PREDICTED: Bos taurus uncharacterized lncRNA (LOC132344779), transcript variant X2, ncRNA", "blastn", "23848", "303", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos taurus"], [4216472, "PRJNA322517_P_NODE_1644_length_382_cov_1.633634_g1622_i0", "PRJNA322517", "1644", "382", "1.633634", "6.24048188", "Protopterus annectens", "7888", "Chordata", "Chordata", "104", "9.92e-18", "", "NTclustered", "gi|2119030767|ref|XR_006366539.1|", "7888", "g1622", "i0", "79.012", "0.87696335078534", "162", "27", "41", "4", "105", "259", "1333", "1172", "PREDICTED: Protopterus annectens 28S ribosomal RNA (LOC122812577), rRNA", "blastn", "335", "104", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", null, "Ceratodontiformes", "Protopteridae", "Protopterus", "Protopterus annectens"], [4216563, "PRJNA322517_P_NODE_3704_length_210_cov_0.931677_g3682_i0", "PRJNA322517", "3704", "210", "0.931677", "1.9565217", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "388", "1.24e-103", "", "NTclustered", "gi|2678956269|ref|XM_006241971.4|", "10116", "g3682", "i0", "100", "1.2047619047619", "210", "0", "100", "0", "1", "210", "5688", "5479", "PREDICTED: Rattus norvegicus synaptogyrin 1 (Syngr1), transcript variant X1, mRNA", "blastn", "253", "388", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [4216633, "PRJNA322517_P_NODE_5864_length_164_cov_0.886957_g5842_i0", "PRJNA322517", "5864", "164", "0.886957", "1.45460948", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "113", "6.1900000000000006e-21", "", "NTclustered", "gi|2678921347|ref|XR_010063740.1|", "10116", "g5842", "i0", "89.773", "3.73780487804878", "88", "9", "54", "0", "3", "90", "4627", "4540", "PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC120100699 (LOC120100699), transcript variant X1, ncRNA", "blastn", "613", "113", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [4216634, "PRJNA322517_P_NODE_5884_length_164_cov_0.886957_g5862_i0", "PRJNA322517", "5884", "164", "0.886957", "1.45460948", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "93.5", "8.07e-15", "", "NTclustered", "gi|83921836|gb|AC132232.6|", "10090", "g5862", "i0", "98.113", "22.8170731707317", "53", "1", "32", "0", "112", "164", "116806", "116754", "Mus musculus BAC clone RP24-489N16 from chromosome 10, complete sequence", "blastn", "3742", "93.5", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [5492840, "PRJNA322517_P_NODE_525_length_765_cov_2.604749_g506_i0", "PRJNA322517", "525", "765", "2.604749", "19.92632985", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "1413", "0", "", "NTclustered", "gi|228014974|gb|FJ919767.1|", "10116", "g506", "i0", "100", "100", "765", "0", "100", "0", "1", "765", "9378", "8614", "Rattus norvegicus strain WK/Kyoto mitochondrion, complete genome", "blastn", "76500", "1413", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [5492859, "PRJNA322517_P_NODE_5825_length_164_cov_1.330435_g5803_i0", "PRJNA322517", "5825", "164", "1.330435", "2.1819134", "Bos taurus", "9913", "Chordata", "Chordata", "303", "3.42e-78", "", "NTclustered", "gi|329744544|ref|NG_028346.1|", "9913", "g5803", "i0", "100", "99.9573170731707", "164", "0", "100", "0", "1", "164", "427", "264", "Bos taurus ribosomal protein L23a pseudogene (LOC100300832) on chromosome 6", "blastn", "16393", "303", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos taurus"], [5492885, "PRJNA322517_P_NODE_6425_length_156_cov_5.663551_g6403_i0", "PRJNA322517", "6425", "156", "5.663551", "8.83513956", "Bos indicus x Bos taurus", "30522", "Chordata", "Chordata", "278", "1.95e-70", "", "NTclustered", "gi|1542919458|ref|XM_027523552.1|", "30522", "g6403", "i0", "98.718", "2", "156", "2", "100", "0", "1", "156", "45", "200", "PREDICTED: Bos indicus x Bos taurus chromosome 22 C3orf86 homolog (C22H3orf86), mRNA", "blastn", "312", "278", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos indicus x Bos taurus"], [6172033, "PRJNA322517_P_NODE_1105_length_482_cov_1.090069_g1083_i0", "PRJNA322517", "1105", "482", "1.090069", "5.25413258", "Bos", "9903", "Chordata", "Chordata", "891", "0", "", "NTclustered", "gi|2587625133|ref|XM_015473597.3|", "9913", "g1083", "i0", "100", "94.6908713692946", "482", "0", "100", "0", "1", "482", "413", "894", "PREDICTED: Bos taurus progestagen-associated endometrial protein (PAEP), transcript variant X1, mRNA", "blastn", "45641", "891", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos taurus"], [6766841, "PRJNA322517_P_NODE_3446_length_222_cov_1.156069_g3424_i0", "PRJNA322517", "3446", "222", "1.156069", "2.56647318", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "353", "4.82e-93", "", "NTclustered", "gi|32362324|gb|AC111678.6|", "10116", "g3424", "i0", "96.296", "316.72972972973", "216", "6", "97", "2", "8", "222", "56494", "56280", "Rattus norvegicus 18 BAC CH230-60A14 (Children's Hospital Oakland Research Institute) complete sequence", "blastn", "70314", "353", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [6766854, "PRJNA322517_P_NODE_3726_length_209_cov_1.018750_g3704_i0", "PRJNA322517", "3726", "209", "1.01875", "2.1291875", "Rattus rattus", "10117", "Chordata", "Chordata", "348", "2.09e-91", "", "NTclustered", "gi|1820954922|ref|XM_032884879.1|", "10117", "g3704", "i0", "96.651", "26.4162679425837", "209", "7", "100", "0", "1", "209", "4057", "4265", "PREDICTED: Rattus rattus phosphatase and actin regulator 1 (Phactr1), transcript variant X7, mRNA", "blastn", "5521", "348", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus rattus"], [6766900, "PRJNA322517_P_NODE_5006_length_174_cov_1.368000_g4984_i0", "PRJNA322517", "5006", "174", "1.368", "2.38032", "Mirounga angustirostris", "9716", "Chordata", "Chordata", "62.1", "2.43e-5", "", "NTclustered", "gi|2721855486|ref|XM_064598396.1|", "9716", "g4984", "i0", "94.872", "1.69540229885057", "39", "2", "22", "0", "136", "174", "7486", "7448", "PREDICTED: Mirounga angustirostris zinc finger protein 883-like (LOC123837350), transcript variant X11, mRNA", "blastn", "295", "62.1", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Carnivora", "Phocidae", "Mirounga", "Mirounga angustirostris"], [6766926, "PRJNA322517_P_NODE_5686_length_165_cov_0.879310_g5664_i0", "PRJNA322517", "5686", "165", "0.87931", "1.4508615", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "305", "9.59e-79", "", "NTclustered", "gi|2678922298|ref|XR_005500622.2|", "10116", "g5664", "i0", "100", "9", "165", "0", "100", "0", "1", "165", "5023", "4859", "PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549347 (LOC102549347), transcript variant X12, ncRNA", "blastn", "1485", "305", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [6766942, "PRJNA322517_P_NODE_6166_length_162_cov_0.902655_g6144_i0", "PRJNA322517", "6166", "162", "0.902655", "1.4623011", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "300", "4.36e-77", "", "NTclustered", "gi|1982559988|ref|NM_001100697.3|", "10116", "g6144", "i0", "100", "11.783950617284", "162", "0", "100", "0", "1", "162", "2798", "2959", "Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 5A2 (Eif5a2), mRNA", "blastn", "1909", "300", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [7447032, "PRJNA322517_P_NODE_4706_length_180_cov_1.496183_g4684_i0", "PRJNA322517", "4706", "180", "1.496183", "2.6931294", "Bos", "9903", "Chordata", "Chordata", "333", "4.87e-87", "", "NTclustered", "gi|2633814377|ref|XM_061401839.1|", "9906", "g4684", "i0", "100", "95.6111111111111", "180", "0", "100", "0", "1", "180", "2925", "3104", "PREDICTED: Bos javanicus polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 (GALNT17), mRNA", "blastn", "17210", "333", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos javanicus"], [8042623, "PRJNA322517_P_NODE_6087_length_162_cov_3.150442_g6065_i0", "PRJNA322517", "6087", "162", "3.150442", "5.10371604", "Bos taurus", "9913", "Chordata", "Chordata", "300", "4.36e-77", "", "NTclustered", "gi|2587681287|ref|XM_024991062.2|", "9913", "g6065", "i0", "100", "4.02469135802469", "162", "0", "100", "0", "1", "162", "10213", "10052", "PREDICTED: Bos taurus inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 (IMMP2L), transcript variant X6, mRNA", "blastn", "652", "300", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos taurus"], [8042633, "PRJNA322517_P_NODE_6327_length_161_cov_0.910714_g6305_i0", "PRJNA322517", "6327", "161", "0.910714", "1.46624954", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "287", "3.37e-73", "", "NTclustered", "gi|269914220|gb|AC105831.10|", "10116", "g6305", "i0", "98.758", "391.807453416149", "161", "2", "100", "0", "1", "161", "76466", "76306", "Rattus norvegicus Chr18 BAC CH230-79L13 (Children's Hospital Oakland Research Institute Rat (BN/SsNHsd/MCW) BAC library) complete sequence", "blastn", "63081", "287", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [9317234, "PRJNA322517_P_NODE_2508_length_300_cov_1.406375_g2486_i0", "PRJNA322517", "2508", "300", "1.406375", "4.219125", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "551", "2.259999999999999e-152", "", "NTclustered", "gi|296041276|gb|HM152027.1|", "10116", "g2486", "i0", "100", "99.3333333333333", "298", "0", "99", "0", "3", "300", "11528", "11231", "Rattus norvegicus strain LEW/NCrlBR mitochondrion, complete genome", "blastn", "29800", "551", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [9317280, "PRJNA322517_P_NODE_3688_length_210_cov_2.310559_g3666_i0", "PRJNA322517", "3688", "210", "2.310559", "4.8521739", "Bos indicus", "9915", "Chordata", "Chordata", "180", "8.099999999999998e-41", "", "NTclustered", "gi|2878355850|ref|XM_070796827.1|", "9915", "g3666", "i0", "99", "409.457142857143", "100", "1", "48", "0", "111", "210", "2145", "2046", "PREDICTED: Bos indicus protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta (PGGT1B), transcript variant X4, mRNA", "blastn", "85986", "180", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos indicus"], [9317329, "PRJNA322517_P_NODE_5088_length_172_cov_2.073171_g5066_i0", "PRJNA322517", "5088", "172", "2.073171", "3.56585412", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "318", "1.2899999999999999e-82", "", "NTclustered", "gi|726965664|gb|KM577635.1|", "10116", "g5066", "i0", "100", "100", "172", "0", "100", "0", "1", "172", "4088", "3917", "Rattus norvegicus isolate 67 mitochondrion, complete genome", "blastn", "17200", "318", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [9317349, "PRJNA322517_P_NODE_5568_length_166_cov_0.871795_g5546_i0", "PRJNA322517", "5568", "166", "0.871795", "1.4471797", "Branchiostoma lanceolatum", "7740", "Chordata", "Chordata", "135", "1.34e-27", "", "NTclustered", "gi|2770714158|ref|XM_066440329.1|", "7740", "g5546", "i0", "84.828", "0.873493975903614", "145", "11", "86", "6", "24", "166", "1866", "2001", "PREDICTED: Branchiostoma lanceolatum ubiquitin-conjugating enzyme E2 G1-like (LOC136443186), mRNA", "blastn", "145", "135", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Leptocardii", "Amphioxiformes", "Branchiostomatidae", "Branchiostoma", "Branchiostoma lanceolatum"], [10592907, "PRJNA322517_P_NODE_2649_length_284_cov_3.906383_g2627_i0", "PRJNA322517", "2649", "284", "3.906383", "11.09412772", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "525", "1.2899999999999994e-144", "", "NTclustered", "gi|2678898585|ref|XR_010057803.1|", "10116", "g2627", "i0", "100", "35.2077464788732", "284", "0", "100", "0", "1", "284", "908", "1191", "PREDICTED: Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase 2 (Parp2), transcript variant X7, misc_RNA", "blastn", "9999", "525", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [10592949, "PRJNA322517_P_NODE_3509_length_218_cov_1.035503_g3487_i0", "PRJNA322517", "3509", "218", "1.035503", "2.25739654", "Bos indicus", "9915", "Chordata", "Chordata", "387", "4.649999999999998e-103", "", "NTclustered", "gi|2878532533|ref|XM_019962869.2|", "9915", "g3487", "i0", "100", "85.1880733944954", "209", "0", "96", "0", "1", "209", "210", "2", "PREDICTED: Bos indicus casein alpha s1 (CSN1S1), mRNA", "blastn", "18571", "387", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos indicus"], [10593027, "PRJNA322517_P_NODE_5869_length_164_cov_0.886957_g5847_i0", "PRJNA322517", "5869", "164", "0.886957", "1.45460948", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "287", "3.45e-73", "", "NTclustered", "gi|312434043|gb|AC242414.6|", "10116", "g5847", "i0", "98.171", "51.1707317073171", "164", "3", "100", "0", "1", "164", "42492", "42329", "Rattus norvegicus Y Chr BAC RNECO-14C22 (Amplicon Express Rat SHR-Akr (EcoR1 Digest) BAC library) complete sequence", "blastn", "8392", "287", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [10593040, "PRJNA322517_P_NODE_6189_length_162_cov_0.902655_g6167_i0", "PRJNA322517", "6189", "162", "0.902655", "1.4623011", "Branchiostoma belcheri", "7741", "Chordata", "Chordata", "283", "4.39e-72", "", "NTclustered", "gi|1126161225|ref|XM_019773508.1|", "7741", "g6167", "i0", "98.16", "1.00617283950617", "163", "2", "100", "1", "1", "162", "1034", "872", "PREDICTED: Branchiostoma belcheri sorting nexin-3-like (LOC109473592), mRNA", "blastn", "163", "283", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Leptocardii", "Amphioxiformes", "Branchiostomatidae", "Branchiostoma", "Branchiostoma belcheri"], [11272333, "PRJNA322517_P_NODE_1549_length_395_cov_1.323699_g1527_i0", "PRJNA322517", "1549", "395", "1.323699", "5.22861105", "Bovidae", "9895", "Chordata", "Chordata", "730", "0", "", "NTclustered", "gi|159793208|gb|EU221564.1|", "9913", "g1527", "i0", "100", "97.9848101265823", "395", "0", "100", "0", "1", "395", "122", "516", "Bos taurus clone 2_18 alpha S1 casein gene, partial cds", "blastn", "38704", "730", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos taurus"], [11272341, "PRJNA322517_P_NODE_5789_length_164_cov_2.243478_g5767_i0", "PRJNA322517", "5789", "164", "2.243478", "3.67930392", "Bos", "9903", "Chordata", "Chordata", "243", "7.57e-60", "", "NTclustered", "gi|910266067|gb|KT005248.1|", "9913", "g5767", "i0", "96.599", "551.243902439024", "147", "4", "90", "1", "1", "147", "232389", "232244", "Bos taurus haplotype A14 tripartite motif containing 26 (TRIM26), MHC class I antigen 6*04001, MHC class I antigen 2*02501, MHC class I antigen 4*02401, and MHC class I antigen 1*02301 genes, complete cds; MHC class I antigen-like protein 6, MHC class I antigen-like protein 5, and MHC class I antigen-like protein 4 (pseudogene 4) pseudogenes, complete sequence; non-classical MHC class I antigen NC1*00601 gene, complete cds; and MHC class I antigen-like protein 7 pseudogene, complete sequence", "blastn", "90404", "243", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos taurus"], [11867778, "PRJNA322517_P_NODE_1710_length_374_cov_2.350769_g1688_i0", "PRJNA322517", "1710", "374", "2.350769", "8.79187606", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "691", "0", "", "NTclustered", "gi|1002159955|gb|KU182944.1|", "10116", "g1688", "i0", "100", "100", "374", "0", "100", "0", "1", "374", "296", "669", "Rattus norvegicus clone 43 cytochrome oxidase subunit I (COI) gene, partial cds; mitochondrial", "blastn", "37400", "691", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [12547674, "PRJNA322517_P_NODE_2190_length_324_cov_1.112727_g2168_i0", "PRJNA322517", "2190", "324", "1.112727", "3.60523548", "Bos", "9903", "Chordata", "Chordata", "599", "8.67e-167", "", "NTclustered", "gi|171|emb|X06359.1|", "9913", "g2168", "i0", "100", "88.5586419753086", "324", "0", "100", "0", "1", "324", "979", "656", "Bovine mRNA for beta-casein", "blastn", "28693", "599", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos taurus"], [12547686, "PRJNA322517_P_NODE_5210_length_170_cov_1.504132_g5188_i0", "PRJNA322517", "5210", "170", "1.504132", "2.5570244", "Bovidae", "9895", "Chordata", "Chordata", "163", "6.29e-36", "", "NTclustered", "gi|218511123|gb|AC172693.4|", "9913", "g5188", "i0", "96.907", "192.441176470588", "97", "3", "58", "0", "1", "97", "44093", "44189", "Bos taurus Y Chr BAC CH240-230F8 (Children's Hospital Oakland Research Institute Bovine BAC Library (male)) complete sequence", "blastn", "32715", "163", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos taurus"], [12547687, "PRJNA322517_P_NODE_5570_length_166_cov_0.871795_g5548_i0", "PRJNA322517", "5570", "166", "0.871795", "1.4471797", "Rattus", "10114", "Chordata", "Chordata", "307", "2.69e-79", "", "NTclustered", "gi|60688448|gb|BC091317.1|", "10116", "g5548", "i0", "100", "5", "166", "0", "100", "0", "1", "166", "277", "442", "Rattus norvegicus RAS protein-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7312874), partial cds", "blastn", "830", "307", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [13142783, "PRJNA322517_P_NODE_3071_length_247_cov_1.000000_g3049_i0", "PRJNA322517", "3071", "247", "1", "2.47", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "457", "4.05e-124", "", "NTclustered", "gi|2678950075|ref|XM_063261543.1|", "10116", "g3049", "i0", "100", "5.03238866396761", "247", "0", "100", "0", "1", "247", "2090", "2336", "PREDICTED: Rattus norvegicus calmodulin 1 (Calm1), transcript variant X1, mRNA", "blastn", "1243", "457", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [13142873, "PRJNA322517_P_NODE_5551_length_166_cov_0.871795_g5529_i0", "PRJNA322517", "5551", "166", "0.871795", "1.4471797", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "307", "2.69e-79", "", "NTclustered", "gi|2678914198|ref|XM_008772329.4|", "10116", "g5529", "i0", "100", "41.0060240963855", "166", "0", "100", "0", "1", "166", "1727", "1562", "PREDICTED: Rattus norvegicus C-X3-C motif chemokine ligand 1 (Cx3cl1), transcript variant X1, mRNA", "blastn", "6807", "307", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [13142901, "PRJNA322517_P_NODE_6271_length_161_cov_0.910714_g6249_i0", "PRJNA322517", "6271", "161", "0.910714", "1.46624954", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "298", "1.56e-76", "", "NTclustered", "gi|2678950356|ref|XM_039111862.2|", "10116", "g6249", "i0", "100", "6.00621118012422", "161", "0", "100", "0", "1", "161", "3759", "3599", "PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type N2 (Ptprn2), transcript variant X2, mRNA", "blastn", "967", "298", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [14418135, "PRJNA322517_P_NODE_3992_length_199_cov_1.360000_g3970_i0", "PRJNA322517", "3992", "199", "1.36", "2.7064", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "368", "1.51e-97", "", "NTclustered", "gi|298898289|emb|FQ231277.1|", "10116", "g3970", "i0", "100", "79.9045226130653", "199", "0", "100", "0", "1", "199", "1129", "931", "Rattus norvegicus TL0AEA73YA15 mRNA sequence", "blastn", "15901", "368", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [14418178, "PRJNA322517_P_NODE_5472_length_167_cov_0.864407_g5450_i0", "PRJNA322517", "5472", "167", "0.864407", "1.44355969", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "309", "7.53e-80", "", "NTclustered", "gi|157817457|ref|NM_001109533.1|", "10116", "g5450", "i0", "100", "2.98802395209581", "167", "0", "100", "0", "1", "167", "1895", "2061", "Rattus norvegicus charged multivesicular body protein 1B (Chmp1b), mRNA", "blastn", "499", "309", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [14418205, "PRJNA322517_P_NODE_6292_length_161_cov_0.910714_g6270_i0", "PRJNA322517", "6292", "161", "0.910714", "1.46624954", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "298", "1.56e-76", "", "NTclustered", "gi|2678931614|ref|XM_063284431.1|", "10116", "g6270", "i0", "100", "10.9813664596273", "161", "0", "100", "0", "1", "161", "1999", "1839", "PREDICTED: Rattus norvegicus calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4 (Cacnb4), transcript variant X4, mRNA", "blastn", "1768", "298", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [14418207, "PRJNA322517_P_NODE_6352_length_161_cov_0.910714_g6330_i0", "PRJNA322517", "6352", "161", "0.910714", "1.46624954", "Mus musculus", "10090", "Chordata", "Chordata", "171", "3.54e-38", "", "NTclustered", "gi|38490628|gb|AC134449.3|", "10090", "g6330", "i0", "86.25", "0.993788819875776", "160", "18", "99", "3", "2", "161", "147364", "147209", "Mus musculus BAC clone RP24-213M16 from chromosome 3, complete sequence", "blastn", "160", "171", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Mus", "Mus musculus"], [15691997, "PRJNA322517_P_NODE_5913_length_164_cov_0.886957_g5891_i0", "PRJNA322517", "5913", "164", "0.886957", "1.45460948", "Bos mutus", "72004", "Chordata", "Chordata", "298", "1.59e-76", "", "NTclustered", "gi|2868772704|ref|XM_070363185.1|", "72004", "g5891", "i0", "99.39", "1", "164", "1", "100", "0", "1", "164", "691", "854", "PREDICTED: Bos mutus group 10 secretory phospholipase A2 (LOC102265754), transcript variant X1, mRNA", "blastn", "164", "298", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos mutus"], [16966566, "PRJNA322517_P_NODE_2154_length_328_cov_1.827957_g2132_i0", "PRJNA322517", "2154", "328", "1.827957", "5.99569896", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "606", "5.249999999999998e-169", "", "NTclustered", "gi|296041276|gb|HM152027.1|", "10116", "g2132", "i0", "100", "100", "328", "0", "100", "0", "1", "328", "8190", "7863", "Rattus norvegicus strain LEW/NCrlBR mitochondrion, complete genome", "blastn", "32800", "606", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [16966619, "PRJNA322517_P_NODE_3494_length_219_cov_1.200000_g3472_i0", "PRJNA322517", "3494", "219", "1.2", "2.628", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "399", "6.009999999999999e-107", "", "NTclustered", "gi|298915712|emb|FQ213214.1|", "10116", "g3472", "i0", "99.543", "15.648401826484", "219", "1", "100", "0", "1", "219", "942", "724", "Rattus norvegicus TL0AAA49YB13 mRNA sequence", "blastn", "3427", "399", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [16966657, "PRJNA322517_P_NODE_4634_length_181_cov_2.530303_g4612_i0", "PRJNA322517", "4634", "181", "2.530303", "4.57984843", "Bos javanicus", "9906", "Chordata", "Chordata", "167", "5.259999999999999e-37", "", "NTclustered", "gi|2633903837|ref|XR_009738364.1|", "9906", "g4612", "i0", "91.129", "6.28176795580111", "124", "9", "67", "2", "8", "129", "3226", "3103", "PREDICTED: Bos javanicus uncharacterized LOC133253648 (LOC133253648), ncRNA", "blastn", "1137", "167", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos javanicus"], [16966689, "PRJNA322517_P_NODE_5574_length_166_cov_0.871795_g5552_i0", "PRJNA322517", "5574", "166", "0.871795", "1.4471797", "Rattus rattus", "10117", "Chordata", "Chordata", "287", "3.5e-73", "", "NTclustered", "gi|1821001331|ref|XM_032911284.1|", "10117", "g5552", "i0", "98.182", "26.921686746988", "165", "2", "99", "1", "1", "164", "1760", "1596", "PREDICTED: Rattus rattus transmembrane protein 158 (Tmem158), mRNA", "blastn", "4469", "287", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus rattus"], [18240853, "PRJNA322517_P_NODE_2615_length_288_cov_2.192469_g2593_i0", "PRJNA322517", "2615", "288", "2.192469", "6.31431072", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "532", "7.8e-147", "", "NTclustered", "gi|228014974|gb|FJ919767.1|", "10116", "g2593", "i0", "100", "100", "288", "0", "100", "0", "1", "288", "8453", "8166", "Rattus norvegicus strain WK/Kyoto mitochondrion, complete genome", "blastn", "28800", "532", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [18240928, "PRJNA322517_P_NODE_4755_length_179_cov_1.261538_g4733_i0", "PRJNA322517", "4755", "179", "1.261538", "2.25815302", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "320", "3.76e-83", "", "NTclustered", "gi|51260834|gb|BC079420.1|", "10116", "g4733", "i0", "98.883", "8.6927374301676", "179", "2", "100", "0", "1", "179", "175", "353", "Rattus norvegicus similar to HTGN29 protein; keratinocytes associated transmembrane protein 2 (predicted), mRNA (cDNA clone IMAGE:7113778)", "blastn", "1556", "320", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [18240963, "PRJNA322517_P_NODE_5715_length_165_cov_0.879310_g5693_i0", "PRJNA322517", "5715", "165", "0.87931", "1.4508615", "Branchiostoma belcheri", "7741", "Chordata", "Chordata", "122", "1.0399999999999997e-23", "", "NTclustered", "gi|1126205116|ref|XM_019780517.1|", "7741", "g5693", "i0", "94.872", "1.63636363636364", "78", "4", "82", "0", "1", "78", "227", "304", "PREDICTED: Branchiostoma belcheri splicing factor 3B subunit 1 (LOC109478762), transcript variant X2, mRNA", "blastn", "270", "122", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Leptocardii", "Amphioxiformes", "Branchiostomatidae", "Branchiostoma", "Branchiostoma belcheri"], [19515107, "PRJNA322517_P_NODE_3136_length_242_cov_1.056995_g3114_i0", "PRJNA322517", "3136", "242", "1.056995", "2.5579279", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "436", "5.1499999999999985e-118", "", "NTclustered", "gi|2678886427|ref|XM_063270887.1|", "10116", "g3114", "i0", "99.174", "1.58264462809917", "242", "2", "100", "0", "1", "242", "514", "755", "PREDICTED: Rattus norvegicus 45S pre-ribosomal RNA like 2 (Rn45sl2), mRNA", "blastn", "383", "436", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [19515207, "PRJNA322517_P_NODE_5996_length_163_cov_0.894737_g5974_i0", "PRJNA322517", "5996", "163", "0.894737", "1.45842131", "Rattus rattus", "10117", "Chordata", "Chordata", "279", "5.73e-71", "", "NTclustered", "gi|1820976621|ref|XR_004387364.1|", "10117", "g5974", "i0", "97.546", "5.41104294478528", "163", "4", "100", "0", "1", "163", "1851", "1689", "PREDICTED: Rattus rattus uncharacterized LOC116896734 (LOC116896734), ncRNA", "blastn", "882", "279", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus rattus"], [19515209, "PRJNA322517_P_NODE_6036_length_163_cov_0.894737_g6014_i0", "PRJNA322517", "6036", "163", "0.894737", "1.45842131", "Branchiostoma belcheri", "7741", "Chordata", "Chordata", "296", "5.68e-76", "", "NTclustered", "gi|1126158853|ref|XM_019761356.1|", "7741", "g6014", "i0", "99.387", "2", "163", "1", "100", "0", "1", "163", "3353", "3515", "PREDICTED: Branchiostoma belcheri A-kinase anchor protein 1, mitochondrial-like (LOC109464393), transcript variant X1, mRNA", "blastn", "326", "296", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Leptocardii", "Amphioxiformes", "Branchiostomatidae", "Branchiostoma", "Branchiostoma belcheri"], [20195214, "PRJNA322517_P_NODE_5176_length_171_cov_1.106557_g5154_i0", "PRJNA322517", "5176", "171", "1.106557", "1.89221247", "Bos", "9903", "Chordata", "Chordata", "316", "4.6e-82", "", "NTclustered", "gi|1802566199|gb|MN714167.1|", "9913", "g5154", "i0", "100", "100", "171", "0", "100", "0", "1", "171", "8442", "8272", "Bos taurus isolate LL29A mitochondrion, complete genome", "blastn", "17100", "316", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos taurus"], [20790750, "PRJNA322517_P_NODE_4257_length_190_cov_1.446809_g4235_i0", "PRJNA322517", "4257", "190", "1.446809", "2.7489371", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "351", "1.4399999999999997e-92", "", "NTclustered", "gi|2678931833|ref|XM_063284508.1|", "10116", "g4235", "i0", "100", "102.042105263158", "190", "0", "100", "0", "1", "190", "7914", "8103", "PREDICTED: Rattus norvegicus spectrin, alpha, non-erythrocytic 1 (Sptan1), transcript variant X6, mRNA", "blastn", "19388", "351", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [20790804, "PRJNA322517_P_NODE_5917_length_164_cov_0.886957_g5895_i0", "PRJNA322517", "5917", "164", "0.886957", "1.45460948", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "298", "1.59e-76", "", "NTclustered", "gi|2678953380|ref|XM_063262509.1|", "10116", "g5895", "i0", "99.39", "62.2865853658537", "164", "1", "100", "0", "1", "164", "1441", "1278", "PREDICTED: Rattus norvegicus KIAA0586 homolog (Kiaa0586), transcript variant X8, mRNA", "blastn", "10215", "298", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [22065679, "PRJNA322517_P_NODE_3318_length_229_cov_8.033333_g3296_i0", "PRJNA322517", "3318", "229", "8.033333", "18.39633257", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "424", "3.76e-114", "", "NTclustered", "gi|228014974|gb|FJ919767.1|", "10116", "g3296", "i0", "100", "99.0043668122271", "229", "0", "100", "0", "1", "229", "9699", "9471", "Rattus norvegicus strain WK/Kyoto mitochondrion, complete genome", "blastn", "22672", "424", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [22065688, "PRJNA322517_P_NODE_3578_length_213_cov_2.390244_g3556_i0", "PRJNA322517", "3578", "213", "2.390244", "5.09121972", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "383", "5.8499999999999996e-102", "", "NTclustered", "gi|2678886437|ref|XM_063270893.1|", "10116", "g3556", "i0", "99.061", "2.50704225352113", "213", "2", "100", "0", "1", "213", "443", "655", "PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC134481045 (LOC134481045), mRNA", "blastn", "534", "383", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [22065741, "PRJNA322517_P_NODE_5158_length_171_cov_1.360656_g5136_i0", "PRJNA322517", "5158", "171", "1.360656", "2.32672176", "Bos taurus", "9913", "Chordata", "Chordata", "305", "9.96e-79", "", "NTclustered", "gi|61097818|gb|AC156367.3|", "9913", "g5136", "i0", "98.83", "5.00584795321637", "171", "2", "100", "0", "1", "171", "39654", "39484", "Bos taurus clone RP42-394P24, complete sequence", "blastn", "856", "305", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos taurus"], [22065753, "PRJNA322517_P_NODE_5438_length_167_cov_0.864407_g5416_i0", "PRJNA322517", "5438", "167", "0.864407", "1.44355969", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "309", "7.53e-80", "", "NTclustered", "gi|2678894000|ref|XM_039091561.2|", "10116", "g5416", "i0", "100", "95.1377245508982", "167", "0", "100", "0", "1", "167", "1814", "1648", "PREDICTED: Rattus norvegicus stromal interaction molecule 2 (Stim2), transcript variant X2, mRNA", "blastn", "15888", "309", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [22746047, "PRJNA322517_P_NODE_5138_length_171_cov_2.254098_g5116_i0", "PRJNA322517", "5138", "171", "2.254098", "3.85450758", "Bovidae", "9895", "Chordata", "Chordata", "267", "4.699999999999999e-67", "", "NTclustered", "gi|2633893019|ref|XR_009737684.1|", "9906", "g5116", "i0", "94.737", "1092.16959064327", "171", "9", "100", "0", "1", "171", "2986", "3156", "PREDICTED: Bos javanicus uncharacterized LOC133251570 (LOC133251570), transcript variant X1, ncRNA", "blastn", "186761", "267", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos javanicus"], [23341071, "PRJNA322517_P_NODE_1239_length_450_cov_1.518703_g1217_i0", "PRJNA322517", "1239", "450", "1.518703", "6.8341635", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "832", "0", "", "NTclustered", "gi|228014974|gb|FJ919767.1|", "10116", "g1217", "i0", "100", "100.002222222222", "450", "0", "100", "0", "1", "450", "4432", "4881", "Rattus norvegicus strain WK/Kyoto mitochondrion, complete genome", "blastn", "45001", "832", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [23341128, "PRJNA322517_P_NODE_2519_length_299_cov_2.376000_g2497_i0", "PRJNA322517", "2519", "299", "2.376", "7.10424", "Rattus norvegicus", "10116", "Chordata", "Chordata", "553", "6.25e-153", "", "NTclustered", "gi|228014974|gb|FJ919767.1|", "10116", "g2497", "i0", "100", "100", "299", "0", "100", "0", "1", "299", "7572", "7274", "Rattus norvegicus strain WK/Kyoto mitochondrion, complete genome", "blastn", "29900", "553", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Rodentia", "Muridae", "Rattus", "Rattus norvegicus"], [24615419, "PRJNA322517_P_NODE_5300_length_168_cov_2.235294_g5278_i0", "PRJNA322517", "5300", "168", "2.235294", "3.75529392", "Bos taurus", "9913", "Chordata", "Chordata", "311", "2.11e-80", "", "NTclustered", "gi|50872219|gb|AC149665.2|", "9913", "g5278", "i0", "100", "1156.65476190476", "168", "0", "100", "0", "1", "168", "26985", "27152", "Bos taurus BAC CH240-60O13 (Children's Hospital Oakland Research Institute Bovine BAC Library (male)) complete sequence", "blastn", "194318", "311", "1", "Eukaryota", "Opisthokonta", "Metazoa", "Chordata", "Mammalia", "Artiodactyla", "Bovidae", "Bos", "Bos taurus"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 70, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "blastn", "p1": "PRJNA322517", "p2": "Chordata"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA322517&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "PRJNA322517", "label": "PRJNA322517", "count": 70, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&tax_phylum=Chordata", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA322517&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 70, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA322517&tax_phylum=Chordata", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA322517&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "Eukaryota", "label": "Eukaryota", "count": 70, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA322517&tax_phylum=Chordata&tax_superkingdom=Eukaryota", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA322517&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "Opisthokonta", "label": "Opisthokonta", "count": 70, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA322517&tax_phylum=Chordata&tax_clade=Opisthokonta", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA322517&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "Metazoa", "label": "Metazoa", "count": 70, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA322517&tax_phylum=Chordata&tax_kingdom=Metazoa", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA322517&tax_phylum=Chordata", "results": [{"value": "Chordata", "label": "Chordata", "count": 70, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA322517", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 293.5217999984161}