{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"blastn\", bioproject = \"PRJNA1146029\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[290191, "PRJNA1146029_P_NODE_4381_length_411_cov_2.449704_g4103_i0", "PRJNA1146029", "4381", "411", "2.449704", "10.06828344", "Bdellovibrio sp. qaytius", "1916293", "Bacteria", "Bacteria", "472", "2.5599999999999997e-128", "", "NTclustered", "gi|1552089877|gb|CP025734.1|", "1916293", "g4103", "i0", "87.591", "200.420924574209", "411", "46", "100", "3", "1", "411", "666392", "666797", "Bdellovibrio sp. qaytius chromosome, complete genome", "blastn", "82373", "472", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. qaytius"], [2840989, "PRJNA1146029_P_NODE_2923_length_500_cov_3.608899_g2646_i0", "PRJNA1146029", "2923", "500", "3.608899", "18.044495", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "896", "0", "", "NTclustered", "gi|2800924434|gb|CP168967.1|", "959", "g2646", "i0", "99", "176.804", "500", "5", "100", "0", "1", "500", "784205", "783706", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd4 chromosome, complete genome", "blastn", "88402", "896", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [2841081, "PRJNA1146029_P_NODE_8423_length_312_cov_1.464435_g8142_i0", "PRJNA1146029", "8423", "312", "1.464435", "4.5690372", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "377", "4.24e-100", "", "NTclustered", "gi|2258818259|gb|CP060220.1|", "2026715", "g8142", "i0", "88.498", "427.221153846154", "313", "35", "100", "1", "1", "312", "3252068", "3252380", "MAG: Pseudobdellovibrionaceae bacterium isolate HK-STAS-BDEL-7 chromosome", "blastn", "133293", "377", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [4117186, "PRJNA1146029_P_NODE_2964_length_497_cov_1.250000_g2687_i0", "PRJNA1146029", "2964", "497", "1.25", "6.2125", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "566", "1.4e-156", "", "NTclustered", "gi|2258818259|gb|CP060220.1|", "2026715", "g2687", "i0", "87.302", "160.971830985915", "504", "53", "99", "9", "1", "496", "3250598", "3251098", "MAG: Pseudobdellovibrionaceae bacterium isolate HK-STAS-BDEL-7 chromosome", "blastn", "80003", "566", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [5393290, "PRJNA1146029_P_NODE_16305_length_251_cov_0.865169_g16024_i0", "PRJNA1146029", "16305", "251", "0.865169", "2.17157419", "uncultured Micavibrio sp.", "362447", "Bacteria", "Bacteria", "322", "1.57e-83", "", "NTclustered", "gi|2621703983|emb|OY762938.1|", "362447", "g16024", "i0", "90.361", "182.581673306773", "249", "19", "98", "4", "2", "247", "961650", "961896", "MAG: uncultured Micavibrio sp. isolate 194a20bb-105a-45c9-9846-0688499aae06 genome assembly, chromosome: 1", "blastn", "45828", "322", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Micavibrio", "uncultured Micavibrio sp."], [7411509, "PRJNA1146029_P_NODE_166_length_1852_cov_6.381113_g112_i0", "PRJNA1146029", "166", "1852", "6.381113", "118.17821276", "Peredibacter", "263370", "Bacteria", "Bacteria", "3079", "0", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g112", "i0", "96.656", "146.563714902808", "1854", "60", "100", "1", "1", "1852", "510709", "512562", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "271436", "3079", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [9218175, "PRJNA1146029_P_NODE_22368_length_239_cov_2.493976_g22087_i0", "PRJNA1146029", "22368", "239", "2.493976", "5.96060264", "Bdellovibrio sp. HCB274", "3394361", "Bacteria", "Bacteria", "228", "3.329999999999999e-55", "", "NTclustered", "gi|2895984058|gb|CP178623.1|", "3394361", "g22087", "i0", "86.512", "191.075313807531", "215", "20", "89", "6", "1", "213", "1742346", "1742553", "Bdellovibrio sp. HCB274 chromosome, complete genome", "blastn", "45667", "228", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB274"], [11768857, "PRJNA1146029_P_NODE_3890_length_433_cov_2.988889_g3612_i0", "PRJNA1146029", "3890", "433", "2.988889", "12.94188937", "Peredibacter sp. HCB2-198", "3383025", "Bacteria", "Bacteria", "617", "3.29e-172", "", "NTclustered", "gi|2867657404|gb|CP174607.1|", "3383025", "g3612", "i0", "92.379", "131.699769053118", "433", "33", "100", "0", "1", "433", "1292313", "1292745", "Peredibacter sp. HCB2-198 chromosome, complete genome", "blastn", "57026", "617", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter sp. HCB2-198"], [13043822, "PRJNA1146029_P_NODE_21591_length_242_cov_0.911243_g21310_i0", "PRJNA1146029", "21591", "242", "0.911243", "2.20520806", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "244", "3.3499999999999997e-60", "", "NTclustered", "gi|2258818259|gb|CP060220.1|", "2026715", "g21310", "i0", "85.95", "164.297520661157", "242", "19", "94", "8", "15", "242", "3251640", "3251880", "MAG: Pseudobdellovibrionaceae bacterium isolate HK-STAS-BDEL-7 chromosome", "blastn", "39760", "244", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [14318995, "PRJNA1146029_P_NODE_172_length_1820_cov_5.283343_g112_i1", "PRJNA1146029", "172", "1820", "5.283343", "96.1568426", "Peredibacter starrii", "28202", "Bacteria", "Bacteria", "3068", "0", "", "NTclustered", "gi|2631252187|gb|CP139487.1|", "28202", "g112", "i1", "97.091", "146.895604395604", "1822", "50", "100", "2", "1", "1820", "510709", "512529", "Peredibacter starrii strain A3.12 chromosome, complete genome", "blastn", "267350", "3068", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Peredibacter", "Peredibacter starrii"], [15061389, "PRJNA1146029_P_NODE_2292_length_569_cov_1.786290_g2017_i0", "PRJNA1146029", "2292", "569", "1.78629", "10.1639901", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "966", "0", "", "NTclustered", "gi|485099167|ref|NR_102561.1|", "959", "g2017", "i0", "97.364", "90.0017574692443", "569", "14", "100", "1", "1", "569", "1699", "1132", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Tiberius 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "51211", "972", "0.993827160493827", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [15592930, "PRJNA1146029_P_NODE_14653_length_260_cov_1.395722_g14372_i0", "PRJNA1146029", "14653", "260", "1.395722", "3.6288772", "Bdellovibrio reynosensis", "2835041", "Bacteria", "Bacteria", "150", "8.17e-32", "", "NTclustered", "gi|2216477995|gb|CP093442.1|", "2835041", "g14372", "i0", "77.395", "1.00384615384615", "261", "53", "99", "6", "3", "260", "2709317", "2709574", "Bdellovibrio reynosensis strain LBG001 chromosome, complete genome", "blastn", "261", "150", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio reynosensis"], [15593155, "PRJNA1146029_P_NODE_8513_length_311_cov_0.970588_g8232_i0", "PRJNA1146029", "8513", "311", "0.970588", "3.01852868", "Fluviispira sanaruensis", "2493639", "Bacteria", "Bacteria", "309", "1.5600000000000002e-79", "", "NTclustered", "gi|1566193515|dbj|AP019368.1|", "2493639", "g8232", "i0", "84.762", "143.659163987138", "315", "40", "100", "6", "1", "311", "399337", "399647", "Silvanigrellales bacterium RF1110005 DNA, complete genome", "blastn", "44678", "309", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", "Silvanigrellales", "Silvanigrellaceae", "Fluviispira", "Fluviispira sanaruensis"], [16867155, "PRJNA1146029_P_NODE_14554_length_261_cov_1.170213_g14273_i0", "PRJNA1146029", "14554", "261", "1.170213", "3.05425593", "Bdellovibrio sp. HCB337", "3394358", "Bacteria", "Bacteria", "427", "3.38e-115", "", "NTclustered", "gi|2895525383|gb|CP178621.1|", "3394358", "g14273", "i0", "96.169", "178.647509578544", "261", "10", "100", "0", "1", "261", "3447625", "3447365", "Bdellovibrio sp. HCB337 chromosome, complete genome", "blastn", "46627", "427", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB337"], [17611329, "PRJNA1146029_P_NODE_4774_length_396_cov_1.043344_g4496_i0", "PRJNA1146029", "4774", "396", "1.043344", "4.13164224", "Bacteriovorax", "146784", "Bacteria", "Bacteria", "643", "4.919999999999999e-180", "", "NTclustered", "gi|1700689994|gb|CP030035.1|", "960", "g4496", "i0", "95.96", "225.924242424242", "396", "16", "100", "0", "1", "396", "1661828", "1661433", "Bacteriovorax stolpii strain AC01 chromosome, complete genome", "blastn", "89466", "643", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bacteriovoracia", "Bacteriovoracales", "Bacteriovoracaceae", "Bacteriovorax", "Bacteriovorax stolpii"], [21966951, "PRJNA1146029_P_NODE_18638_length_247_cov_0.885057_g18357_i0", "PRJNA1146029", "18638", "247", "0.885057", "2.18609079", "Bdellovibrio sp. HCB288", "3394355", "Bacteria", "Bacteria", "257", "4.41e-64", "", "NTclustered", "gi|2895994964|gb|CP178619.1|", "3394355", "g18357", "i0", "85.484", "52.497975708502", "248", "34", "100", "2", "1", "247", "2063257", "2063011", "Bdellovibrio sp. HCB288 chromosome, complete genome", "blastn", "12967", "257", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. HCB288"], [21967109, "PRJNA1146029_P_NODE_8678_length_309_cov_1.076271_g8397_i0", "PRJNA1146029", "8678", "309", "1.076271", "3.32567739", "uncultured Bdellovibrio sp.", "239744", "Bacteria", "Bacteria", "571", "1.7899999999999995e-158", "", "NTclustered", "gi|333034728|gb|JF703522.1|", "239744", "g8397", "i0", "100", "128.122977346278", "309", "0", "100", "0", "1", "309", "313", "5", "Uncultured Bdellovibrio sp. clone L1-86 16S ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "39590", "571", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "uncultured Bdellovibrio sp."], [23242519, "PRJNA1146029_P_NODE_20959_length_243_cov_0.905882_g20678_i0", "PRJNA1146029", "20959", "243", "0.905882", "2.20129326", "Pseudobdellovibrio sp. HCB154", "3386277", "Bacteria", "Bacteria", "60.2", "1.31e-4", "", "NTclustered", "gi|2872995934|gb|CP176530.1|", "3386277", "g20678", "i0", "94.737", "1.75720164609054", "38", "2", "16", "0", "206", "243", "61868", "61831", "Pseudobdellovibrio sp. HCB154 chromosome, complete genome", "blastn", "427", "60.2", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio sp. HCB154"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 18, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "blastn", "p1": "PRJNA1146029", "p2": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA1146029&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA1146029", "label": "PRJNA1146029", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA1146029&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1146029&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA1146029&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA1146029&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA1146029&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA1146029&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA1146029&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA1146029&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 18, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA1146029", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 142.40142499329522}