{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"blastn\", bioproject = \"PRJNA1118794\" and tax_phylum = \"Bdellovibrionota\"", "rows": [[230559, "PRJNA1118794_P_NODE_29481_length_294_cov_2.371041_g28731_i0", "PRJNA1118794", "29481", "294", "2.371041", "6.97086054", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "254", "6.97e-63", "", "NTclustered", "gi|2258818259|gb|CP060220.1|", "2026715", "g28731", "i0", "83.513", "253.632653061224", "279", "39", "94", "6", "19", "294", "3250358", "3250084", "MAG: Pseudobdellovibrionaceae bacterium isolate HK-STAS-BDEL-7 chromosome", "blastn", "74568", "254", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [230982, "PRJNA1118794_P_NODE_64261_length_245_cov_0.895349_g63511_i0", "PRJNA1118794", "64261", "245", "0.895349", "2.19360505", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "292", "1.2e-74", "", "NTclustered", "gi|578016248|gb|CP002190.1|", "765869", "g63511", "i0", "90.868", "85.7673469387755", "219", "19", "89", "1", "27", "245", "611500", "611717", "Bdellovibrio bacteriovorus W, complete genome", "blastn", "21013", "292", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [2781376, "PRJNA1118794_P_NODE_48803_length_251_cov_0.865169_g48053_i0", "PRJNA1118794", "48803", "251", "0.865169", "2.17157419", "Bdellovibrio bacteriovorus", "959", "Bacteria", "Bacteria", "270", "5.77e-68", "", "NTclustered", "gi|2800927921|gb|CP168969.1|", "959", "g48053", "i0", "86.111", "20.7729083665339", "252", "33", "100", "2", "1", "251", "3806089", "3805839", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd10 chromosome, complete genome", "blastn", "5214", "270", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [8678126, "PRJNA1118794_P_NODE_23367_length_320_cov_3.627530_g22617_i0", "PRJNA1118794", "23367", "320", "3.62753", "11.608096", "Pseudobdellovibrio", "2862745", "Bacteria", "Bacteria", "412", "1.1999999999999999e-110", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g22617", "i0", "91.892", "191.53125", "296", "22", "92", "2", "26", "320", "309", "15", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "61290", "412", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [8678248, "PRJNA1118794_P_NODE_6527_length_549_cov_1.886555_g5788_i0", "PRJNA1118794", "6527", "549", "1.886555", "10.35718695", "Pseudomonadati", "3379134", "Bacteria", "Bacteria", "335", "4.789999999999999e-87", "", "NTclustered", "gi|2258818259|gb|CP060220.1|", "2026715", "g5788", "i0", "79.406", "146.342440801457", "505", "81", "90", "18", "23", "516", "3250517", "3251009", "MAG: Pseudobdellovibrionaceae bacterium isolate HK-STAS-BDEL-7 chromosome", "blastn", "80342", "335", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"], [8678251, "PRJNA1118794_P_NODE_66987_length_243_cov_2.100000_g66237_i0", "PRJNA1118794", "66987", "243", "2.1", "5.103", "Pseudobdellovibrio", "2862745", "Bacteria", "Bacteria", "350", "6.94e-92", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g66237", "i0", "92.593", "78.6707818930041", "243", "18", "100", "0", "1", "243", "1467", "1225", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "19117", "350", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [15052529, "PRJNA1118794_P_NODE_14592_length_380_cov_1.915309_g13842_i0", "PRJNA1118794", "14592", "380", "1.915309", "7.2781742", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "315", "4.18e-81", "", "NTclustered", "gi|2663425168|dbj|AP029173.1|", "3113893", "g13842", "i0", "82.238", "256.094736842105", "411", "30", "97", "16", "1", "369", "756528", "756119", "Bdellovibrio sp. CKG001 DNA, complete genome", "blastn", "97316", "315", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. CKG001"], [18082342, "PRJNA1118794_P_NODE_37475_length_274_cov_1.527363_g36725_i0", "PRJNA1118794", "37475", "274", "1.527363", "4.18497462", "Silvanigrella aquatica", "1915309", "Bacteria", "Bacteria", "106", "1.9e-18", "", "NTclustered", "gi|1114626566|gb|CP017834.1|", "1915309", "g36725", "i0", "76.132", "6.47445255474453", "243", "35", "85", "20", "30", "263", "390360", "390132", "Silvanigrella aquatica strain MWH-Nonnen-W8red chromosome", "blastn", "1774", "106", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", "Silvanigrellales", "Silvanigrellaceae", "Silvanigrella", "Silvanigrella aquatica"], [21426941, "PRJNA1118794_P_NODE_34677_length_280_cov_4.623188_g33927_i0", "PRJNA1118794", "34677", "280", "4.623188", "12.9449264", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "318", "2.3e-82", "", "NTclustered", "gi|2800924434|gb|CP168967.1|", "959", "g33927", "i0", "87.143", "344.264285714286", "280", "36", "100", "0", "1", "280", "785732", "786011", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd4 chromosome, complete genome", "blastn", "96394", "318", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [21907900, "PRJNA1118794_P_NODE_61018_length_246_cov_0.890173_g60268_i0", "PRJNA1118794", "61018", "246", "0.890173", "2.18982558", "Bdellovibrio sp. NC01", "2220073", "Bacteria", "Bacteria", "383", "6.94e-102", "", "NTclustered", "gi|1700686220|gb|CP030034.1|", "2220073", "g60268", "i0", "94.715", "1", "246", "13", "100", "0", "1", "246", "69428", "69673", "Bdellovibrio sp. NC01 chromosome, complete genome", "blastn", "246", "383", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio sp. NC01"], [22701928, "PRJNA1118794_P_NODE_48398_length_251_cov_1.584270_g47648_i0", "PRJNA1118794", "48398", "251", "1.58427", "3.9765177", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "381", "2.549999999999999e-101", "", "NTclustered", "gi|2800917394|gb|CP168972.1|", "959", "g47648", "i0", "94.024", "42.7211155378486", "251", "15", "100", "0", "1", "251", "3641473", "3641723", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd19 chromosome, complete genome", "blastn", "10723", "381", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [23183268, "PRJNA1118794_P_NODE_69439_length_243_cov_0.858824_g68689_i0", "PRJNA1118794", "69439", "243", "0.858824", "2.08694232", "Pigmentibacter ruber", "2683196", "Bacteria", "Bacteria", "52.8", "0.022", "", "NTclustered", "gi|2651759839|dbj|AP029159.1|", "2683196", "g68689", "i0", "100", "0.11522633744856", "28", "0", "12", "0", "87", "114", "1911853", "1911880", "Pigmentibacter ruber GTC16762 DNA, complete genome", "blastn", "28", "52.8", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Oligoflexia", "Silvanigrellales", "Silvanigrellaceae", "Pigmentibacter", "Pigmentibacter ruber"], [23977321, "PRJNA1118794_P_NODE_53519_length_249_cov_0.875000_g52769_i0", "PRJNA1118794", "53519", "249", "0.875", "2.17875", "Bdellovibrio", "958", "Bacteria", "Bacteria", "279", "9.5e-71", "", "NTclustered", "gi|2800917394|gb|CP168972.1|", "959", "g52769", "i0", "87.2", "36.3333333333333", "250", "27", "99", "5", "1", "247", "3432399", "3432152", "Bdellovibrio bacteriovorus strain Bd19 chromosome, complete genome", "blastn", "9047", "279", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Bdellovibrio", "Bdellovibrio bacteriovorus"], [23977378, "PRJNA1118794_P_NODE_75499_length_229_cov_3.217949_g74749_i0", "PRJNA1118794", "75499", "229", "3.217949", "7.36910321", "Pseudobdellovibrio", "2862745", "Bacteria", "Bacteria", "385", "1.77e-102", "", "NTclustered", "gi|507148233|ref|NR_103040.1|", "453816", "g74749", "i0", "97.345", "83.5371179039301", "226", "6", "99", "0", "1", "226", "1747", "1522", "Bdellovibrio exovorus strain JSS 23S ribosomal RNA gene, complete sequence", "blastn", "19130", "385", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", "Pseudobdellovibrio", "Pseudobdellovibrio exovorus"], [24456841, "PRJNA1118794_P_NODE_3420_length_783_cov_2.421127_g2727_i0", "PRJNA1118794", "3420", "783", "2.421127", "18.95742441", "Pseudobdellovibrionaceae bacterium", "2026715", "Bacteria", "Bacteria", "795", "0", "", "NTclustered", "gi|2258818259|gb|CP060220.1|", "2026715", "g2727", "i0", "85.223", "121.812260536398", "785", "102", "99", "13", "2", "783", "3251991", "3251218", "MAG: Pseudobdellovibrionaceae bacterium isolate HK-STAS-BDEL-7 chromosome", "blastn", "95379", "795", "1", "Bacteria", null, "Pseudomonadati", "Bdellovibrionota", "Bdellovibrionia", "Bdellovibrionales", "Pseudobdellovibrionaceae", null, "Pseudobdellovibrionaceae bacterium"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 15, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "blastn", "p1": "PRJNA1118794", "p2": "Bdellovibrionota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA1118794&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "PRJNA1118794", "label": "PRJNA1118794", "count": 15, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA1118794&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 15, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJNA1118794&tax_phylum=Bdellovibrionota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA1118794&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bacteria", "label": "Bacteria", "count": 15, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA1118794&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_superkingdom=Bacteria", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA1118794&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA1118794&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Pseudomonadati", "label": "Pseudomonadati", "count": 15, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA1118794&tax_phylum=Bdellovibrionota&tax_kingdom=Pseudomonadati", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA1118794&tax_phylum=Bdellovibrionota", "results": [{"value": "Bdellovibrionota", "label": "Bdellovibrionota", "count": 15, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJNA1118794", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 212.58579199638916}