{"database": "metadata", "table": "contig_metadata", "is_view": false, "human_description_en": "where analysis = \"blastn\", bioproject = \"PRJEB14664\" and tax_phylum = \"Oomycota\"", "rows": [[21154, "PRJEB14664_P_NODE_11721_length_216_cov_2.237569_g11591_i0", "PRJEB14664", "11721", "216", "2.237569", "4.83314904", "Aphanomyces astaci", "112090", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "388", "1.28e-103", "", "NTclustered", "gi|1111669722|ref|NC_032051.1|", "112090", "g11591", "i0", "99.074", "106.601851851852", "216", "2", "100", "0", "1", "216", "2179", "2394", "Aphanomyces astaci isolate AP03 mitochondrion, complete genome", "blastn", "23026", "388", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Saprolegniomycetes", "Saprolegniales", "Verrucalvaceae", "Aphanomyces", "Aphanomyces astaci"], [21173, "PRJEB14664_P_NODE_13321_length_198_cov_1.453988_g13191_i0", "PRJEB14664", "13321", "198", "1.453988", "2.87889624", "Saprolegnia parasitica", "101203", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "108", "3.61e-19", "", "NTclustered", "gi|813142527|ref|XM_012343931.1|", "695850", "g13191", "i0", "90.244", "1.08585858585859", "82", "8", "41", "0", "30", "111", "1209", "1128", "Saprolegnia parasitica CBS 223.65 60S ribosomal protein L3 mRNA", "blastn", "215", "108", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Saprolegniomycetes", "Saprolegniales", "Saprolegniaceae", "Saprolegnia", "Saprolegnia parasitica"], [21189, "PRJEB14664_P_NODE_14621_length_186_cov_1.589404_g14491_i0", "PRJEB14664", "14621", "186", "1.589404", "2.95629144", "Aphanomyces invadans", "157072", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "163", "7.04e-36", "", "NTclustered", "gi|673035777|ref|XM_008873628.1|", "157072", "g14491", "i0", "83.146", "1.93010752688172", "178", "30", "96", "0", "8", "185", "86", "263", "Aphanomyces invadans hypothetical protein mRNA", "blastn", "359", "163", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Saprolegniomycetes", "Saprolegniales", "Verrucalvaceae", "Aphanomyces", "Aphanomyces invadans"], [21340, "PRJEB14664_P_NODE_9401_length_252_cov_2.884793_g9271_i0", "PRJEB14664", "9401", "252", "2.884793", "7.26967836", "Aphanomyces astaci", "112090", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "455", "1.49e-123", "", "NTclustered", "gi|698793876|ref|XR_717098.1|", "112090", "g9271", "i0", "99.209", "100.043650793651", "253", "1", "100", "1", "1", "252", "1869", "1617", "Aphanomyces astaci 28S ribosomal RNA rRNA", "blastn", "25211", "455", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Saprolegniomycetes", "Saprolegniales", "Verrucalvaceae", "Aphanomyces", "Aphanomyces astaci"], [1295314, "PRJEB14664_P_NODE_10902_length_227_cov_8.989583_g10772_i0", "PRJEB14664", "10902", "227", "8.989583", "20.40635341", "Aphanomyces astaci", "112090", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "375", "1.06e-99", "", "NTclustered", "gi|256009645|gb|GQ374534.1|", "112090", "g10772", "i0", "96.476", "85.2290748898678", "227", "8", "100", "0", "1", "227", "159", "385", "Aphanomyces astaci strain Gb04 28S ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "19347", "375", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Saprolegniomycetes", "Saprolegniales", "Verrucalvaceae", "Aphanomyces", "Aphanomyces astaci"], [1295385, "PRJEB14664_P_NODE_18202_length_160_cov_1.600000_g18072_i0", "PRJEB14664", "18202", "160", "1.6", "2.56", "Aphanomyces invadans", "157072", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "263", "5.629999999999999e-66", "", "NTclustered", "gi|673038061|ref|XM_008874770.1|", "157072", "g18072", "i0", "96.25", "5.3125", "160", "6", "100", "0", "1", "160", "78", "237", "Aphanomyces invadans 60S ribosomal protein L38 mRNA", "blastn", "850", "263", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Saprolegniomycetes", "Saprolegniales", "Verrucalvaceae", "Aphanomyces", "Aphanomyces invadans"], [2571148, "PRJEB14664_P_NODE_6363_length_327_cov_1.571918_g6233_i0", "PRJEB14664", "6363", "327", "1.571918", "5.14017186", "Phytophthora chrysanthemi", "638948", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "268", "2.7999999999999998e-67", "", "NTclustered", "gi|1337859674|gb|MG601089.1|", "638948", "g6233", "i0", "82.951", "98.1467889908257", "305", "44", "92", "8", "1", "301", "14", "314", "Phytophthora chrysanthemi isolate 201600114 ODA translation elongation factor 1-alpha gene, partial cds", "blastn", "32094", "268", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Peronosporales", "Peronosporaceae", "Phytophthora", "Phytophthora chrysanthemi"], [2571176, "PRJEB14664_P_NODE_8683_length_267_cov_1.379310_g8553_i0", "PRJEB14664", "8683", "267", "1.37931", "3.6827577", "Aphanomyces invadans", "157072", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "291", "4.76e-74", "", "NTclustered", "gi|673043756|ref|XM_008877617.1|", "157072", "g8553", "i0", "86.617", "1.00749063670412", "269", "29", "99", "7", "1", "265", "467", "202", "Aphanomyces invadans hypothetical protein mRNA", "blastn", "269", "291", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Saprolegniomycetes", "Saprolegniales", "Verrucalvaceae", "Aphanomyces", "Aphanomyces invadans"], [5123560, "PRJEB14664_P_NODE_13245_length_199_cov_1.219512_g13115_i0", "PRJEB14664", "13245", "199", "1.219512", "2.42682888", "Aphanomyces astaci", "112090", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "261", "2.64e-65", "", "NTclustered", "gi|698783094|ref|XM_009826289.1|", "112090", "g13115", "i0", "94.643", "79.9597989949749", "168", "9", "84", "0", "1", "168", "331", "498", "Aphanomyces astaci 40S ribosomal protein S23 mRNA", "blastn", "15912", "261", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Saprolegniomycetes", "Saprolegniales", "Verrucalvaceae", "Aphanomyces", "Aphanomyces astaci"], [5123635, "PRJEB14664_P_NODE_2165_length_625_cov_4.328814_g2054_i0", "PRJEB14664", "2165", "625", "4.328814", "27.0550875", "Aphanomyces astaci", "112090", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "922", "0", "", "NTclustered", "gi|698793876|ref|XR_717098.1|", "112090", "g2054", "i0", "97.757", "90.7344", "535", "12", "86", "0", "91", "625", "2616", "2082", "Aphanomyces astaci 28S ribosomal RNA rRNA", "blastn", "56709", "922", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Saprolegniomycetes", "Saprolegniales", "Verrucalvaceae", "Aphanomyces", "Aphanomyces astaci"], [6088851, "PRJEB14664_P_NODE_10945_length_227_cov_1.619792_g10815_i0", "PRJEB14664", "10945", "227", "1.619792", "3.67692784", "Aphanomyces", "100860", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "399", "6.269999999999998e-107", "", "NTclustered", "gi|166051677|emb|CU353805.1|", "100861", "g10815", "i0", "98.667", "100.31718061674", "225", "3", "99", "0", "3", "227", "297", "73", "Aphanomyces euteiches cDNA", "blastn", "22772", "399", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Saprolegniomycetes", "Saprolegniales", "Verrucalvaceae", "Aphanomyces", "Aphanomyces euteiches"], [7363421, "PRJEB14664_P_NODE_12826_length_203_cov_1.904762_g12696_i0", "PRJEB14664", "12826", "203", "1.904762", "3.86666686", "Eukaryota", "2759", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "99", "2.24e-16", "", "NTclustered", "gi|189084639|gb|BT032155.1|", "4784", "g12696", "i0", "84.694", "7.80788177339902", "98", "15", "48", "0", "1", "98", "222", "125", "Phytophthora capsici clone CBOT141-D08 mRNA sequence", "blastn", "1585", "99", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Peronosporales", "Peronosporaceae", "Phytophthora", "Phytophthora capsici"], [8948179, "PRJEB14664_P_NODE_18048_length_161_cov_1.269841_g17918_i0", "PRJEB14664", "18048", "161", "1.269841", "2.04444401", "Aphanomyces astaci", "112090", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "104", "3.64e-18", "", "NTclustered", "gi|698776983|ref|XM_009823234.1|", "112090", "g17918", "i0", "79.141", "29.6645962732919", "163", "25", "96", "6", "5", "159", "461", "300", "Aphanomyces astaci hypothetical protein mRNA", "blastn", "4776", "104", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Saprolegniomycetes", "Saprolegniales", "Verrucalvaceae", "Aphanomyces", "Aphanomyces astaci"], [14049324, "PRJEB14664_P_NODE_17312_length_166_cov_0.977099_g17182_i0", "PRJEB14664", "17312", "166", "0.977099", "1.62198434", "Saprolegnia parasitica", "101203", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "163", "6.16e-36", "", "NTclustered", "gi|813171659|ref|XM_012349195.1|", "695850", "g17182", "i0", "84.848", "23.0421686746988", "165", "21", "98", "4", "1", "163", "55", "217", "Saprolegnia parasitica CBS 223.65 hypothetical protein mRNA", "blastn", "3825", "163", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Saprolegniomycetes", "Saprolegniales", "Saprolegniaceae", "Saprolegnia", "Saprolegnia parasitica"], [15013607, "PRJEB14664_P_NODE_3032_length_520_cov_1.668041_g2912_i0", "PRJEB14664", "3032", "520", "1.668041", "8.6738132", "Peronosporomycetes", "3418804", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "300", "1.65e-76", "", "NTclustered", "gi|327206264|gb|JF414554.1|", "143453", "g2912", "i0", "77.316", "101.107692307692", "529", "104", "99", "11", "3", "520", "1631", "1108", "Pseudoperonospora cubensis isolate CDM-276 cytochrome c oxidase subunit II (cox2) and cytochrome c oxidase subunit I (cox1) genes, partial cds; mitochondrial", "blastn", "52576", "302", "0.993377483443709", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Peronosporales", "Peronosporaceae", "Pseudoperonospora", "Pseudoperonospora cubensis"], [15323339, "PRJEB14664_P_NODE_14533_length_187_cov_1.578947_g14403_i0", "PRJEB14664", "14533", "187", "1.578947", "2.95263089", "Aphanomyces astaci", "112090", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "196", "6.989999999999999e-46", "", "NTclustered", "gi|698813201|ref|XM_009841328.1|", "112090", "g14403", "i0", "85.561", "2.77540106951872", "187", "27", "100", "0", "1", "187", "366", "552", "Aphanomyces astaci hypothetical protein mRNA", "blastn", "519", "196", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Saprolegniomycetes", "Saprolegniales", "Verrucalvaceae", "Aphanomyces", "Aphanomyces astaci"], [16598092, "PRJEB14664_P_NODE_4514_length_408_cov_2.828418_g4386_i0", "PRJEB14664", "4514", "408", "2.828418", "11.53994544", "Aphanomyces sp.", "1982524", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "749", "0", "", "NTclustered", "gi|1578815424|gb|MK546601.1|", "1982524", "g4386", "i0", "99.755", "99.781862745098", "408", "1", "100", "0", "1", "408", "188", "595", "Aphanomyces sp. voucher CCIBt4545 large subunit ribosomal RNA gene, partial sequence", "blastn", "40711", "749", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Saprolegniomycetes", "Saprolegniales", "Verrucalvaceae", "Aphanomyces", "Aphanomyces sp."], [17563588, "PRJEB14664_P_NODE_13294_length_198_cov_1.815951_g13164_i0", "PRJEB14664", "13294", "198", "1.815951", "3.59558298", "Saprolegnia", "4769", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "130", "7.71e-26", "", "NTclustered", "gi|813182419|ref|XM_012350790.1|", "695850", "g13164", "i0", "87.611", "1.14141414141414", "113", "13", "57", "1", "84", "196", "424", "313", "Saprolegnia parasitica CBS 223.65 50S ribosomal protein L35Ae mRNA", "blastn", "226", "130", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Saprolegniomycetes", "Saprolegniales", "Saprolegniaceae", "Saprolegnia", "Saprolegnia parasitica"], [17563607, "PRJEB14664_P_NODE_2694_length_555_cov_3.038462_g2579_i0", "PRJEB14664", "2694", "555", "3.038462", "16.8634641", "Albugo", "65356", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "58.4", "0.001", "", "NTclustered", "gi|325182092|emb|FR824068.1|", "890382", "g2579", "i0", "94.595", "0.133333333333333", "37", "2", "7", "0", "514", "550", "33969", "34005", "Albugo laibachii Nc14, genomic contig CONTIG_23_NC14_v4_178735_235", "blastn", "74", "58.4", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Albuginales", "Albuginaceae", "Albugo", "Albugo laibachii"], [17872774, "PRJEB14664_P_NODE_14035_length_191_cov_1.929487_g13905_i0", "PRJEB14664", "14035", "191", "1.929487", "3.68532017", "Aphanomyces euteiches", "100861", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "267", "5.3899999999999993e-67", "", "NTclustered", "gi|166038943|emb|CU355173.1|", "100861", "g13905", "i0", "92.063", "83.0942408376963", "189", "15", "99", "0", "1", "189", "451", "639", "Aphanomyces euteiches cDNA", "blastn", "15871", "267", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Saprolegniomycetes", "Saprolegniales", "Verrucalvaceae", "Aphanomyces", "Aphanomyces euteiches"], [21387893, "PRJEB14664_P_NODE_7777_length_287_cov_1.876984_g7647_i0", "PRJEB14664", "7777", "287", "1.876984", "5.38694408", "Peronosporaceae", "4777", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "108", "5.58e-19", "", "NTclustered", "gi|58202010|gb|AY898628.1|", "4787", "g7647", "i0", "75.099", "88.2961672473868", "253", "52", "86", "10", "39", "286", "1001", "755", "Phytophthora infestans haplotype IIb mitochondrion, complete genome", "blastn", "25341", "108", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Peronosporales", "Peronosporaceae", "Phytophthora", "Phytophthora infestans"], [21697881, "PRJEB14664_P_NODE_14278_length_189_cov_2.000000_g14148_i0", "PRJEB14664", "14278", "189", "2", "3.78", "Aphanomyces euteiches", "100861", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "128", "2.62e-25", "", "NTclustered", "gi|166035576|emb|CU354455.1|", "100861", "g14148", "i0", "92.222", "4.97354497354497", "90", "7", "48", "0", "1", "90", "753", "842", "Aphanomyces euteiches cDNA", "blastn", "940", "128", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Saprolegniomycetes", "Saprolegniales", "Verrucalvaceae", "Aphanomyces", "Aphanomyces euteiches"], [21697984, "PRJEB14664_P_NODE_7078_length_305_cov_2.814815_g6948_i0", "PRJEB14664", "7078", "305", "2.814815", "8.58518575", "Aphanomyces invadans", "157072", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "159", "1.6299999999999999e-34", "", "NTclustered", "gi|673051000|ref|XM_008881239.1|", "157072", "g6948", "i0", "88.06", "12.6262295081967", "134", "16", "44", "0", "1", "134", "900", "1033", "Aphanomyces invadans fructose-bisphosphate aldolase, class II mRNA", "blastn", "3851", "159", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Saprolegniomycetes", "Saprolegniales", "Verrucalvaceae", "Aphanomyces", "Aphanomyces invadans"], [22662681, "PRJEB14664_P_NODE_15098_length_182_cov_1.462585_g14968_i0", "PRJEB14664", "15098", "182", "1.462585", "2.6619047", "Eukaryota", "2759", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "243", "8.559999999999999e-60", "", "NTclustered", "gi|166051442|emb|CU364545.1|", "100861", "g14968", "i0", "92.857", "91.7747252747253", "168", "10", "92", "1", "15", "182", "508", "343", "Aphanomyces euteiches cDNA", "blastn", "16703", "243", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Saprolegniomycetes", "Saprolegniales", "Verrucalvaceae", "Aphanomyces", "Aphanomyces euteiches"], [22973267, "PRJEB14664_P_NODE_779_length_1027_cov_5.848790_g713_i0", "PRJEB14664", "779", "1027", "5.84879", "60.0670733", "Phytophthora novae-guineae", "3070859", "SAR_Eukaryotes", "SAR_Eukaryotes", "126", "6.049999999999999e-24", "", "NTclustered", "gi|1940379313|gb|MN883605.1|", "3070859", "g713", "i0", "77.477", "9.27458617332035", "222", "42", "21", "7", "8", "225", "828", "611", "Phytophthora novae-guineae culture ICMP:19637 mitochondrion, complete genome", "blastn", "9525", "126", "1", "Eukaryota", "Sar", null, "Oomycota", "Peronosporomycetes", "Peronosporales", "Peronosporaceae", "Phytophthora", "Phytophthora novae-guineae"]], "truncated": false, "filtered_table_rows_count": 25, "expanded_columns": [], "expandable_columns": [], "columns": ["rowid", "query", "bioproject", "node", "length", "coverage", "rel_abundance", "taxname_lca", "taxid_lca", "taxoncategory", "taxoncategorysimple", "bits", "evalue", "lowcoverage_flag", "analysis_used", "target", "taxid", "gene", "allele", "pident", "sumperc_cov", "alnlen", "mismatch", "qcov", "gapopen", "qstart", "qend", "tstart", "tend", "target_title", "analysis", "sumalnlen", "maxbits", "bits_percmax", "tax_superkingdom", "tax_clade", "tax_kingdom", "tax_phylum", "tax_class", "tax_order", "tax_family", "tax_genus", "tax_species"], "primary_keys": [], "units": {}, "query": {"sql": "select rowid, [query], bioproject, node, length, coverage, rel_abundance, taxname_lca, taxid_lca, taxoncategory, taxoncategorysimple, bits, evalue, lowcoverage_flag, analysis_used, target, taxid, gene, allele, pident, sumperc_cov, alnlen, mismatch, qcov, gapopen, qstart, qend, tstart, tend, target_title, analysis, sumalnlen, maxbits, bits_percmax, tax_superkingdom, tax_clade, tax_kingdom, tax_phylum, tax_class, tax_order, tax_family, tax_genus, tax_species from contig_metadata where \"analysis\" = :p0 and \"bioproject\" = :p1 and \"tax_phylum\" = :p2 order by rowid limit 101", "params": {"p0": "blastn", "p1": "PRJEB14664", "p2": "Oomycota"}}, "facet_results": {"bioproject": {"name": "bioproject", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJEB14664&tax_phylum=Oomycota", "results": [{"value": "PRJEB14664", "label": "PRJEB14664", "count": 25, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&tax_phylum=Oomycota", "selected": true}], "truncated": false}, "analysis": {"name": "analysis", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJEB14664&tax_phylum=Oomycota", "results": [{"value": "blastn", "label": "blastn", "count": 25, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?bioproject=PRJEB14664&tax_phylum=Oomycota", "selected": true}], "truncated": false}, "tax_superkingdom": {"name": "tax_superkingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJEB14664&tax_phylum=Oomycota", "results": [{"value": "Eukaryota", "label": "Eukaryota", "count": 25, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJEB14664&tax_phylum=Oomycota&tax_superkingdom=Eukaryota", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_clade": {"name": "tax_clade", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJEB14664&tax_phylum=Oomycota", "results": [{"value": "Sar", "label": "Sar", "count": 25, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJEB14664&tax_phylum=Oomycota&tax_clade=Sar", "selected": false}], "truncated": false}, "tax_kingdom": {"name": "tax_kingdom", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJEB14664&tax_phylum=Oomycota", "results": [], "truncated": false}, "tax_phylum": {"name": "tax_phylum", "type": "column", "hideable": false, "toggle_url": "/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJEB14664&tax_phylum=Oomycota", "results": [{"value": "Oomycota", "label": "Oomycota", "count": 25, "toggle_url": "http://metadata.rnaquarium.org/metadata/contig_metadata.json?analysis=blastn&bioproject=PRJEB14664", "selected": true}], "truncated": false}}, "suggested_facets": [], "next": null, "next_url": null, "private": false, "allow_execute_sql": true, "query_ms": 122.38288200751413}